| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,396,984 | T→C | G331G (GGT→GGC) | nnr → | bifunctional ADP‑dependent NAD(P)H‑hydrate dehydratase/NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,396,984 | 0 | T | C | 99.8% | 2139.8 / NA | 611 | G331G (GGT→GGC) | nnr | bifunctional ADP‑dependent NAD(P)H‑hydrate dehydratase/NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (399/211); minor base A (1/0); total (400/211) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 611 total aligned reads displayed.
GAGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGTCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCATCC > NZ_CP025268/4396848‑4397118 | aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 1:414440/1‑140 (MQ=255) aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 1:7426823/1‑140 (MQ=255) gTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCa > 2:5579497/1‑140 (MQ=255) tGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAagag > 1:8769598/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 2:1575565/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 1:10707318/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 2:7250363/1‑140 (MQ=255) aCCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTg > 1:8450376/1‑140 (MQ=255) cGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTgggg < 1:9000084/140‑1 (MQ=255) gCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTggggg > 2:2305038/1‑140 (MQ=255) cAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGa > 2:8097911/1‑140 (MQ=255) cAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGa > 2:10812331/1‑140 (MQ=255) aaaaCATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGaaaaaa > 2:9433056/1‑140 (MQ=255) taCATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCAGGAACTGACGTTGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGAGGTGGTGGGGAGTGGTGCCGGGCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGACAAAAGc > 2:10302770/2‑140 (MQ=255) aCATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCa < 2:9601613/140‑1 (MQ=255) ttGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGTACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCAGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGTGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTg > 2:9526593/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCACGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:6613886/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:716920/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:8665253/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:9277518/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 2:2098046/1‑140 (MQ=255) ccgcTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCaaaa < 2:4212781/140‑1 (MQ=255) cgcTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCaaaaa > 2:3299274/1‑140 (MQ=255) tgctgACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGtt > 1:8375444/1‑140 (MQ=255) gACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGACTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTgaga > 1:489265/1‑140 (MQ=255) gACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTgaga > 1:2494065/1‑140 (MQ=255) gACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGc > 2:5353413/1‑140 (MQ=255) aCCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCa < 1:10004515/140‑1 (MQ=255) aaTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCg < 1:4374733/140‑1 (MQ=255) aaTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCg < 1:6780417/140‑1 (MQ=255) aaTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCg < 1:1082847/140‑1 (MQ=255) aaTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCGTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCg < 1:1517495/140‑1 (MQ=255) tGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtg < 2:2862469/140‑1 (MQ=255) gATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtgt < 1:2733686/140‑1 (MQ=255) gTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTtgtg < 1:4621120/140‑1 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGACTTTTCGCAAACCGAGGTTGTggg > 2:5933361/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:9059723/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:10227446/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:1749169/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:5692801/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:631015/1‑140 (MQ=255) cATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGa < 1:8161171/140‑1 (MQ=255) tGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATg < 1:7685435/140‑1 (MQ=255) tGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATg < 2:692605/140‑1 (MQ=255) tGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATg < 2:10507908/140‑1 (MQ=255) acagaagATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGTATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGTGATGCCg < 2:4930045/134‑1 (MQ=255) cTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGa < 2:2489778/140‑1 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGACAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGACTTTTCGCAAACCGAGGTTGGGGGATGCCGATg > 2:7122003/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 1:220332/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 2:3532273/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 1:3993837/1‑140 (MQ=255) cGATGGACTCTCTTACCGAACGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCa < 1:2925966/140‑1 (MQ=255) aCTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCACGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAAc < 2:1228867/140‑1 (MQ=255) ctctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGACAAAAGCACTGCAAAATGTTGAGAATTTTCGCAAACCGTTGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAAcc > 2:4008250/1‑140 (MQ=255) ctctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAAcc < 2:1796029/140‑1 (MQ=255) ctctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAAcc < 1:8024302/140‑1 (MQ=255) ctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAGGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctg > 2:5812859/1‑140 (MQ=255) ctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTGGAGAAGTTTCGCAAACCGAGGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctg > 2:8702140/1‑140 (MQ=255) ctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGGGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctgct > 2:4777232/1‑140 (MQ=255) tACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTgg > 2:7870463/1‑140 (MQ=255) aCCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGc > 2:3654942/1‑140 (MQ=255) aaaGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatc > 2:1069635/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:7411472/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:9153311/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 1:9581295/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:6232383/1‑140 (MQ=255) ccTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAATAAGTTGAGAAGTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCaatcaatc > 2:5721981/1‑140 (MQ=255) ccTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCaatcaatc < 1:5902576/140‑1 (MQ=255) aaTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGAt < 1:3340220/140‑1 (MQ=255) aTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 1:9388014/140‑1 (MQ=255) aTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 1:689073/140‑1 (MQ=255) aTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 1:1640976/140‑1 (MQ=255) aTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGAAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 2:3005586/140‑1 (MQ=255) ggCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGc > 1:378818/1‑140 (MQ=255) ggCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGc > 2:8431704/1‑140 (MQ=255) gCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCg > 1:193340/1‑140 (MQ=255) gCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCg > 1:7893718/1‑140 (MQ=255) ccGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGGTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGt > 2:1654008/1‑140 (MQ=255) gATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTca < 2:10360009/140‑1 (MQ=255) tgtgGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcaca > 2:6643092/1‑140 (MQ=255) tgtgGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcaca < 1:10356273/140‑1 (MQ=255) tgtgGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcaca < 2:860016/140‑1 (MQ=255) tgtgGAGGTGACTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcaca < 2:376624/140‑1 (MQ=255) gtggtgATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAATAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTTGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCCATCCCGATCAGCGTCACAATcg > 1:1334915/1‑140 (MQ=255) gtggtgATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTtgtg < 1:5496654/86‑1 (MQ=255) gtggtgATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCCGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATcg > 2:8941601/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAATGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGGTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAt > 2:4639395/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAt > 1:9777166/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAt > 2:7610814/1‑140 (MQ=255) tGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCa > 1:6178636/1‑140 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAACAGTGGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGGGGGAGGCCGCTGCCTTGAACCTGCTGGCAATCACTCCCGATACGCGTCACAATCGCGTGATCAcg < 2:5183157/140‑1 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcg > 2:8245466/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 1:4735107/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 1:3646696/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 2:3864102/1‑140 (MQ=255) cccGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgcc < 1:9993225/140‑1 (MQ=255) cccGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgcc < 1:3135353/140‑1 (MQ=255) gtgtGGGCCAGCAATAGTGGGGGACAATTGCACTGCTATAAGTTGAGAATTTTCGCAAACAGATGTTGTGGGATGCCGTTGGATTGAAGCTGCTGGCGCTCACTCCCGATTAGCGTCACGAGCGCGTGATCAcgccgccg > 2:141220/4‑138 (MQ=255) gTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATACGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCAt < 1:1197398/140‑1 (MQ=255) tCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCATc < 1:5273689/140‑1 (MQ=255) | GAGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGTCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCATCC > NZ_CP025268/4396848‑4397118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |