Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 4,505,921 | A→G | intergenic (‑557/‑52) | insG ← / → nanX | IS4‑like element IS4 family transposase/MFS transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 4,505,921 | 0 | A | G | 100.0% | 283.0 / NA | 83 | intergenic (‑557/‑52) | insG/nanX | IS4‑like element IS4 family transposase/MFS transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (36/47); total (36/47) |
TATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGACTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGTATTTGAT > NZ_CP025268/4505786‑4506053 | tATCAGTTTTATCTTTCATAGATTTAAATATGTTATGAAGAAATGGATGAAAATTTTGTACTGTTTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCTTTTTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGATGCTcc < 2:2908096/140‑1 (MQ=255) ttATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATAtt < 2:3142456/140‑1 (MQ=255) aTCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGACATGGAGGAAAAGATTGTAGTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGAACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATAATTa > 1:10086313/1‑140 (MQ=255) tCATTGAGTGAAATATGTTAAGAAGAATTGGTGGTATAGATTGTACTGATTAGGTATTGATATCAATCAATAGTTCTGGCGTATTTGAAGTCAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTTATATTTACtttt < 2:7034062/140‑2 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |