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cTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑AGAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGc < 1:2815177/140‑1 (MQ=255) gtgtTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCCTGTTTACCGTGCTAGTGAAACCTACTTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGc < 2:27179/140‑1 (MQ=255) ttttGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCcac > 1:4415527/1‑140 (MQ=255) tttGCGCAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑ACAAAAGAGTATTCTTATATCCGCATAACCATGCATCTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAACTCTCCGTATGGCGTGGCCAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCcaca < 2:2069987/140‑1 (MQ=255) tttGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCcaca < 1:5184389/140‑1 (MQ=255) tttGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCcaca < 1:676058/140‑1 (MQ=255) tGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTa > 1:3081007/1‑96 (MQ=255) tGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAACTGCCACAAg > 2:3896569/1‑140 (MQ=255) gAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCa < 1:3987666/140‑1 (MQ=255) aaaCATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAAc < 2:5198395/140‑1 (MQ=255) aaCATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACg < 1:4186847/140‑1 (MQ=255) gAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTGTAGGCGAATAACAATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAGGGCGTGGACAGCCGCCATTCGTGATGTCGGTTGCTGCCACAGGGCAACGGtcttct < 1:346511/140‑1 (MQ=255) gAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGtcttct < 2:260030/140‑1 (MQ=255) gAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGtcttct < 1:2240638/140‑1 (MQ=255) | CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCT > NZ_CP025268/939300‑939571 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |