| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,013,520 | +G | pseudogene (463/542 nt) | zapC → | cell division protein ZapC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 97.6% | 935.8 / 13.9 | 289 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/3); new base G (151/129); total (155/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑G‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 | tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTCTTGCTGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑g > 1:1928497/1‑140 (MQ=255)tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑g > 2:3378994/1‑140 (MQ=255) ggCGCTGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑g‑ggcga > 2:956168/1‑136 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑g‑ggcga < 2:1133318/140‑5 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑g‑ggcga > 1:4422789/1‑136 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑g‑ggcga < 1:2468893/140‑5 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCa > 1:2239249/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCAt > 1:4819367/1‑140 (MQ=255) ccTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTaaa > 1:4093563/1‑140 (MQ=255) cTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTaaaa < 1:836400/140‑1 (MQ=255) cTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTaaaa < 1:2532486/140‑1 (MQ=255) gTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACg > 2:1206644/1‑140 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:1721100/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 2:5201655/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 2:3614183/140‑1 (MQ=255) ctGAGCGCTACTCACGACCAAGTAAATTTGCCGGTAGTTGCATCTGGCCAACATGCCGCACCATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCC‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGACCGa < 2:2939761/139‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGTAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCCACGGCGTTATCGCGGGTCGCGCGCTGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAGTCCTGAACGACAg > 2:4588319/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg < 1:275999/140‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:2290060/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGACGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCGCAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:4688324/1‑140 (MQ=255) cTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGaaa > 2:499364/1‑140 (MQ=255) tCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAAc < 2:2263538/140‑1 (MQ=255) tCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAAc < 2:4819367/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg > 1:329628/1‑140 (MQ=255) gCAGGTCAATTTTATGGTCGTTGAATCTGGCGCAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 1:1100524/140‑1 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 1:3365630/140‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACGCTGCGTTGTTATTGCGGGCCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAggg > 2:919740/1‑139 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:241678/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:755960/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:2052449/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:3848067/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:1790664/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:2600975/1‑140 (MQ=255) aaGGTCAATTTGCTGGTAGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTCGCACAACCCTGCGTTGATATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑TTTGG‑GGGACGCCATTAAAATCATAAACGACAGGCTGAAACCGCAgga > 2:1007428/2‑139 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:4180422/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:572986/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:3748568/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAAAGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 2:3924057/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 2:1658163/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCCGCGTGGTTATTGCGGGTCGCGCGATGGA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACATGCTGCAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 2:4131132/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTGGAATCTGGTGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 2:1344431/1‑140 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt > 1:319920/1‑140 (MQ=255) gTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCGCCACCCTGCGTTGGGATTGCGGGTCGCGCGATGCAGGTG‑G‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGAAGGTTAATGGTGACAGCTTCAg > 2:801032/1‑140 (MQ=255) ttcaaTCTGGCGCAACTTCCGCACTATGCCTGCTCGCACCACCCTGCGTTGTTTTTGCGGGTCGCGCTATGCA‑GTT‑GTGCGACGCCATTAAAATCCTGAACGACACGCTGAAACCACAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGc < 2:2486856/137‑1 (MQ=255) ttGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGc < 1:4506279/140‑1 (MQ=255) aTCTGGCGAAAATGAAGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCg < 1:1394639/140‑1 (MQ=255) ggCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGCAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACa > 1:737900/1‑140 (MQ=255) cGAAACTGCCGCATCGTCCCTGGTGGCACACCCCTGTATGGGTATTGCGGGTCGGGCGATGCA‑GTTGG‑GCTATGCCATTAAATCCATCCACGTTACGCTGAAACCGCAGGTTAATGTGGTCATCTCTAGACTCGATCAgc < 2:4449957/140‑2 (MQ=255) cGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAc > 1:542005/1‑140 (MQ=255) cGCACTATGCCTCCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAc > 2:5146944/1‑140 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCATCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 2:4678467/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:1562782/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:907216/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:1876108/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 2:4066019/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 2:2965900/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:658575/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCGATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 2:3119459/1‑140 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 1:200045/1‑140 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 2:2347324/1‑140 (MQ=255) gctgGCACAACCCGGCGTTGTTATTCGGGGTCTGGAGATGCA‑GTTGG‑GGGAAGCCATTAAAATCATGGACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTGATGTTGACAGCTTGAGCATCGGAGAGGCAGTCTAGCACGCCAACTTaa > 2:668913/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg > 1:3487010/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg > 1:2124988/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 2:4252060/140‑1 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 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1:2915246/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:2054160/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:4006129/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:3668015/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:2111034/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGAGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:5157211/140‑1 (MQ=255) tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg < 2:3206820/140‑1 (MQ=255) gttgttATTGCGGGTCGCGCGATGGA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTac < 2:4893903/140‑1 (MQ=255) cttgttATTGCCGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATCAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTGGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTac < 2:3731485/139‑1 (MQ=255) ttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTaca < 1:3824605/140‑1 (MQ=255) tgttATTGCGGGTCGCACGATGCA‑GTT‑GTGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAGCCGCAGGTTCATGTTTACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACCTAAGTGCAGTCTTCGGTacac < 2:4313446/140‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:3460133/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:2903458/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:2824643/1‑140 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc > 1:2987055/1‑140 (MQ=255) aTTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCt > 1:236176/1‑140 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:1550757/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:1734393/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:1664582/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:2532841/140‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:2242823/1‑140 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:494702/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 2:863776/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAACTCAGGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGGTGACAGCTTCAGCCTGGAACAGGCAGTCTAACGGGCCAACTGAAGGGCAGTCTTGGGGACACAGCTACAGCaaa > 2:540704/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg > 2:3431768/1‑123 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:3284427/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:1766133/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa < 2:3536154/140‑1 (MQ=255) cgcgATGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 2:826873/1‑140 (MQ=255) tGCA‑GTTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTg < 2:2627952/140‑1 (MQ=255) | TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑G‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |