| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,218,374 | (C)5→6 | pseudogene (306/1685 nt) | btsS ← | two‑component regulatory system sensor histidine kinase BtsS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,218,369 | 1 | . | C | 96.1% | 815.3 / 24.5 | 254 | pseudogene (311/1685 nt) | btsS | two‑component regulatory system sensor histidine kinase BtsS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/4); new base C (152/92); total (158/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
CAGCGACGAACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATG‑C‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAATGTGCAACCCAAAC > NZ_CP025268/2218230‑2218503 | cAGCGACGAACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCGGCGGCGGAGCAGGATGCTGTGGACCAGGCCACCGAGTAACCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATg < 2:4267593/140‑1 (MQ=255) cgacgaACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTTTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATG‑c‑cc > 1:2075532/1‑140 (MQ=255) gacgaACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATG‑c‑cc‑c < 1:2961809/140‑1 (MQ=255) gacgaACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATG‑c‑cc‑c < 2:4672470/140‑1 (MQ=255) gaACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATG‑c‑cc‑ccca < 1:4544036/140‑3 (MQ=255) gaACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATG‑c‑cc‑ccca > 1:9128/1‑138 (MQ=255) aCGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATG‑c‑cc‑cccatc < 1:951085/140‑5 (MQ=255) aCGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATG‑c‑cc‑cccatc < 2:4902548/140‑5 (MQ=255) aCGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAata < 1:2239569/140‑1 (MQ=255) aCGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAata < 1:4852918/140‑1 (MQ=255) cGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAatat < 1:1082266/140‑1 (MQ=255) ataggcgcggTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCg > 1:4257421/7‑140 (MQ=255) cggcggTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGt > 1:3572782/1‑140 (MQ=255) gcggTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCCGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGCGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCCATGTaa > 2:617288/1‑140 (MQ=255) ggTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAgc < 2:4868279/140‑1 (MQ=255) ggTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAgc > 1:4840618/1‑140 (MQ=255) ggggTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCgg < 2:2050545/140‑1 (MQ=255) aaaGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCGTGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGcc > 2:3908513/1‑140 (MQ=255) aaaGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGcc > 2:3239673/1‑140 (MQ=255) cTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAAcc > 1:2440370/1‑140 (MQ=255) tttATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCa > 1:739365/1‑140 (MQ=255) ttATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAg > 1:2831219/1‑140 (MQ=255) ttATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATG‑C‑CCACCATCGAATATCTATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCACCCAg > 2:871894/1‑140 (MQ=255) tataAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGGTGCTGTGTACCATGCCACCGCGTACTCCGTCAACGATGGCCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATG‑CACC‑CGATCGAATATCGAAGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGc > 2:2597836/1‑140 (MQ=255) tATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGc > 2:1887550/1‑140 (MQ=255) tATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGc > 1:4904026/1‑140 (MQ=255) tATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACGTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGc > 2:3425939/1‑140 (MQ=255) tATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGAGGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCCACCAGc > 2:2831338/1‑140 (MQ=255) tGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCGACcg > 1:4755544/1‑140 (MQ=255) tGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcg > 1:1391471/1‑140 (MQ=255) tGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcg > 2:1123052/1‑140 (MQ=255) cgcCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcgac < 2:1349554/140‑1 (MQ=255) cgcCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcgac > 1:1637072/1‑140 (MQ=255) gcggcgGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACgaccg < 2:1017208/140‑1 (MQ=255) gcggATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACgaccggac > 1:886174/1‑140 (MQ=255) gcggATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACgaccggac > 1:4420098/1‑140 (MQ=255) ggATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGt < 2:239492/140‑1 (MQ=255) ggATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGt < 1:2617938/140‑1 (MQ=255) tGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCTGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAg < 2:3286175/140‑1 (MQ=255) tGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAg > 1:4709407/1‑140 (MQ=255) tGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAg < 1:2472573/140‑1 (MQ=255) tGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAg < 1:2267380/140‑1 (MQ=255) tGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAg < 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ccGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGcc < 1:3263461/140‑1 (MQ=255) ccGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGcc > 1:1974369/1‑140 (MQ=255) ccGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGcc < 2:3878041/140‑1 (MQ=255) ccGAGTAATCCTTCAACGATGATCGACATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGATTATCGAAGTAAGCCGCCGGTCATCCTAACCAGCTCACCGACGACCGGACCGCCTAGCAACCGGCCCATTAACACGcc > 2:2146205/1‑140 (MQ=255) cGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCt < 2:3149431/140‑1 (MQ=255) aGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTAt > 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1:4119048/1‑140 (MQ=255) tGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCa > 1:3824887/1‑140 (MQ=255) tGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCa > 1:4952416/1‑140 (MQ=255) gTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAAt > 2:3382620/1‑140 (MQ=255) gTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAAt > 1:299592/1‑140 (MQ=255) gaTCATGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAAt < 2:1232327/140‑1 (MQ=255) aTGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTc < 1:3974092/140‑1 (MQ=255) tGCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCa > 2:4147230/1‑140 (MQ=255) gCAACTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCaa > 1:33722/1‑140 (MQ=255) cTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAAtgtg < 2:2451960/140‑1 (MQ=255) cTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAAtgtg < 2:5213102/140‑1 (MQ=255) cTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAAtgtg < 1:1818774/140‑1 (MQ=255) cTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAAtgtg > 1:3291442/1‑140 (MQ=255) cTTAACGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAAtgtg < 1:3815457/140‑1 (MQ=255) aaCGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAATGTGCaa > 1:3889843/1‑140 (MQ=255) aaCGCGGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAATGTGCaa > 2:2481554/1‑140 (MQ=255) cgcgGTCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAATGTGCAAcc > 2:2478458/1‑140 (MQ=255) tCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAAGCGTCAATGTGCAACCCAAAc > 2:3607417/1‑140 (MQ=255) tCATGCC‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCGATCGCACGGGCATTGGCAATAGAATCGTCAATGTGCAACCCAAAc > 2:2256107/1‑140 (MQ=255) | CAGCGACGAACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTCATG‑C‑CC‑CCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAATGTGCAACCCAAAC > NZ_CP025268/2218230‑2218503 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |