Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,016,563 | +C | intergenic (‑19/+28) | yqeB ← / ← yqeC | selenium‑dependent molybdenum cofactor biosynthesis protein YqeB/selenium cofactor biosynthesis protein YqeC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,016,562 | 1 | . | C | 98.5% | 857.0 / 4.9 | 264 | intergenic (‑18/+29) | yqeB/yqeC | selenium‑dependent molybdenum cofactor biosynthesis protein YqeB/selenium cofactor biosynthesis protein YqeC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/2); new base C (96/163); total (99/165) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
TCGGCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATAT‑CTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGTTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTG > NZ_CP025268/3016423‑3016694 | tCGGCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGCGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGatat > 1:4367234/1‑140 (MQ=255) tCGGCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCCACCTCAATGGatat > 1:2033260/1‑140 (MQ=255) tCGGCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGatat > 1:5060903/1‑140 (MQ=255) tCGGCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGatat > 1:1292382/1‑140 (MQ=255) tCGGCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGatat > 2:2335913/1‑140 (MQ=255) tCGGCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGatat > 2:4532791/1‑140 (MQ=255) tCGGCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGatat < 1:2397260/140‑1 (MQ=255) tCGGCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGatat > 2:270830/1‑140 (MQ=255) tCGGCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTGTGCGCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGatat > 1:3695439/1‑140 (MQ=255) ggCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATAT‑cc > 2:149759/1‑139 (MQ=255) gcgcgcACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATAT‑cct < 2:682828/140‑3 (MQ=255) cgcACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATAT‑Cctttc > 2:3455658/1‑138 (MQ=255) gcACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCa > 1:4785907/1‑140 (MQ=255) cTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTa < 1:3304379/140‑1 (MQ=255) cTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTa < 1:2801589/140‑1 (MQ=255) cTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGACATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTa < 1:4659905/140‑1 (MQ=255) aaCATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAAc < 1:524214/140‑1 (MQ=255) cATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAAccc > 1:3884710/1‑140 (MQ=255) gtgCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAAt > 1:3228362/1‑140 (MQ=255) gtgCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAAt > 1:736803/1‑140 (MQ=255) gtgCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAAt > 2:2609955/1‑140 (MQ=255) gtgCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAAt > 2:4223040/1‑140 (MQ=255) gtgCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGCCTAACAAAAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTCCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGACATCCTTTCAGTAACCCGGAAt > 2:2311117/1‑140 (MQ=255) aaTGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCgg > 1:2595597/1‑140 (MQ=255) aaTGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCgg > 1:4498367/1‑140 (MQ=255) aaTGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCgg > 1:180138/1‑140 (MQ=255) tGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGc < 1:4931533/140‑1 (MQ=255) cGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCgc > 1:679760/1‑139 (MQ=255) cGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCgc < 1:4475581/140‑2 (MQ=255) gggAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGGAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGcagcta < 2:3035078/140‑6 (MQ=255) gggAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCgcta < 2:1123563/140‑4 (MQ=255) aGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAAtt > 2:1930431/1‑140 (MQ=255) aGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGGTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAAtt > 2:25628/1‑140 (MQ=255) gggCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTcaca > 2:648812/3‑140 (MQ=255) gCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgcg < 2:1814654/140‑1 (MQ=255) tATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgcgcg < 1:4189528/140‑1 (MQ=255) tATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgcgcg < 1:307291/140‑1 (MQ=255) tATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgcgcg < 1:4260961/140‑1 (MQ=255) tATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgcgcg < 1:225900/140‑1 (MQ=255) tATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgcgcg < 1:1567442/140‑1 (MQ=255) tATCAACAAGTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgcgcg < 2:2238662/140‑1 (MQ=255) tCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGcgcgcg > 1:4548753/1‑140 (MQ=255) caaTTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTg < 2:4455342/140‑1 (MQ=255) caaTTTGCGCCAGAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTGTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTg < 2:1052913/140‑1 (MQ=255) caaTTTGCGCCAGAGCAAACGGACAATGTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCACGGGATATCCTTGCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAACCTGCGCGCGATTg < 2:5115950/140‑1 (MQ=255) aaaTTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAACTATTCATACCAACCTCAATTGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTg < 2:3740553/139‑1 (MQ=255) aTTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCa < 1:4834340/140‑1 (MQ=255) tGCGCCAGAGCAAATGTACAATTTTGCTATTCTAGTTTTGTAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAAAGGATAACCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACCAATCTGCGCGCGATTGCAggc < 2:4311864/140‑2 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 2:2188518/140‑1 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 1:3188326/140‑1 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 2:1274179/140‑1 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 1:1247048/140‑1 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCGTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAGATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 2:4601012/140‑1 (MQ=255) aTAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCt < 2:1615085/140‑1 (MQ=255) aGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTg > 2:4633728/1‑140 (MQ=255) aaaCGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGtat < 2:3241539/140‑1 (MQ=255) aaCGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGtata > 1:3502807/1‑140 (MQ=255) ggACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCg < 2:2065376/140‑1 (MQ=255) aCAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGcc < 1:1099543/140‑1 (MQ=255) cacttttGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGccc < 1:1880856/137‑1 (MQ=255) gCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGa < 1:2752892/140‑1 (MQ=255) ctctTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGAt < 1:2335913/140‑1 (MQ=255) ctctTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGAt < 2:3928269/140‑1 (MQ=255) ctctTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGAt < 2:3828116/140‑1 (MQ=255) cGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCct > 2:5034021/1‑140 (MQ=255) aGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCctct < 1:2976785/140‑1 (MQ=255) tttGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTAcg < 1:338691/140‑1 (MQ=255) aGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCgtg < 2:1887957/140‑1 (MQ=255) aGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCgtg < 1:4815755/140‑1 (MQ=255) aGCCTCCGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCGTTCAGTAACCCGGATTACACGGGCCGCTAATACACAAATCTGCGCGCGATTCCAGGATGTTCTTGTATCTCGCCCAGCCAGATGGCCTCTACGTCgtg < 2:1383497/140‑1 (MQ=255) tctGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGtgttgt > 2:2714601/1‑140 (MQ=255) tgtgAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGttgttg < 2:4699001/140‑1 (MQ=255) gtgAAAATATTCGTACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGc < 2:2565787/140‑1 (MQ=255) tgAAAATATTCATACCACCCTCAATGGATATCCTTTCAGTCACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCa < 1:219226/140‑1 (MQ=255) tgAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACCAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCa < 1:4246230/140‑1 (MQ=255) tgAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCa < 1:928294/140‑1 (MQ=255) tgAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCa < 1:4019016/140‑1 (MQ=255) tatTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGtt > 2:3099413/1‑140 (MQ=255) ttCATACCAACCTCAATTGATATCCTTTCAGTAACCAGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGGAGGATGGTGTTGTATATGGACCAGCCAGATTGCCACTACGTCGGGTTGTTGAAGCTGGTGa > 2:4192843/1‑140 (MQ=255) ttCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGa > 1:3857015/1‑140 (MQ=255) ttCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGa < 1:2555720/140‑1 (MQ=255) ttCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGGCGTGTTGTTGCAGCGGTTGa > 2:1343208/1‑140 (MQ=255) tCATACCAACCTCAATTGATATCCTCTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGaa < 2:4924753/140‑1 (MQ=255) cATACCAACCTGAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGGGAGTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAg > 2:2858510/1‑140 (MQ=255) cATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAg < 1:1736537/140‑1 (MQ=255) cATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGACGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAg > 1:1024191/1‑140 (MQ=255) cATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCAAAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTCTTGTTGCAGCGGTTGAAg > 2:3711703/1‑140 (MQ=255) aCCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAg > 1:1831947/1‑140 (MQ=255) aCCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCg > 1:5147728/1‑140 (MQ=255) ccTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGAt < 1:3669369/66‑1 (MQ=255) ccTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGAt > 2:3669369/1‑66 (MQ=255) ccTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGc > 1:2438823/1‑140 (MQ=255) ccTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGc > 2:1540004/1‑140 (MQ=255) ccTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGc > 1:4214566/1‑140 (MQ=255) cTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCTCAACTCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCt < 2:825784/140‑1 (MQ=255) cTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCt < 1:885391/140‑1 (MQ=255) aaTGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCt < 2:4022452/137‑1 (MQ=255) aaTGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTtg > 2:4774610/1‑140 (MQ=255) aaTGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTtg > 1:4137936/1‑140 (MQ=255) tGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGACGGAGCTCGCTTtgtg < 2:561200/140‑1 (MQ=255) | TCGGCGCGCACTAACATTTGTGCAGAATGGCGGGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATAT‑CTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGTTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTG > NZ_CP025268/3016423‑3016694 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |