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1:4666451/140‑1 (MQ=255) tGTTGCCGCGCGCGGTATCGACATTCCTGACGTCAGCCACGTCTTTAACTTCGATATGCCGCGCAGCGGCGATACTTATTTGCACCGTATCGGACGGACCGCGCGCGCCGGTCGTAAAGGCACCGCAATTTCGCgggtgg < 2:1882243/140‑1 (MQ=255) tGTTGCCGCGCGCGGTATAGACATTCCTGACGTCAGCCACGTCTTTAACTTCTACATGCCGCGCAGTGGCGATACTTAGTTGCACCGTATCGGACGTACCGCGCGCGCCAGTCGTAAAGGCACCGCAATTTCGCtggtgg < 2:2007225/140‑1 (MQ=255) gTTGCCGCGCGCGGTATCGACATTCCTGACGTCAGCCACGTCTTTAACTTCGATATGCCGCGCAGTGGCGATACTTATTTGCACCGTATCGGACGTACCGCGCGCGCCGGTCGTAAAGGCACCGCAATTTCGCTGGTGGa < 1:2761771/140‑1 (MQ=255) cggcgcgcgcgGTATCGACATTCCTGCCGTCAGCCACGTCTTTAACTTCGATATGCCGCGCGTTGGCGATACTTATTTGCACCGTCTCGGACGCACCCCGCGCGACGGTCGTAAAGGCACCGCAATTTCGCTGGTGGAAg > 1:1367559/4‑140 (MQ=255) gCCGCGCGCGGTATCGACATTCCTGACGTCAGCCACGTCTTTAACTTCGATATGCCGCGCAGTGGCGATACTTATTTGCACGGTATCGGACGTACCGCGCGCGCCGGTCGTAAAGGCACCGCAATTTCGCTTGTGGAAGc > 1:4342095/1‑140 (MQ=255) gCCGCGCGCGGTATCGACATTCCTGACGTCAGCCACGTCTTTAACTTCGATATGCCGCGCAGTGGCGATACTTATTTGCACCGTATCGGACGTACCGCGCGCGCCGGTCGTAAAGGCACCGCAATTTCGCTGGTGGAAGc < 1:3501079/140‑1 (MQ=255) cgcgcgcgGTATCGACATTCCTGACGTCAGCCACGTCTTTAACTTCGATATGCCGCGCAGTGGCGATACTTATTTGCACCGTATCGGACGTACCGCGCGCGCCGGTCGTAAAGGCACCGCAATTTCGCTGGTGGAAGccc > 2:1926473/1‑140 (MQ=255) gcgcgGTATCAACATTCCTGACGTCAGCCACGTCTTTAACTTCGATATGCCGCGCAGTGGCGATACTTATTTGCAACGTATCGGACGTACCGCGCGCGCCGGTCGTAAAGGCACCGCAATTTCGCTGGTGGAAGGCCATg < 1:4558223/140‑1 (MQ=255) cgGTATCGACATTCCTGACGTCAGCCACGTCTTTAACTTCGATATGCCGCGCAGTGGCGATACTTATTTGCACCGTATCGGACGTACCGCGCGCGCCGGTCGTAAAGGCACCGCAATTTCGCTGGTGGAAGCCCATGAcc < 1:3362416/140‑1 (MQ=255) tATCGACATTCCTGACGTCAGCCACGTCTTTAACTTCGATATGCCGCGCAGTGGCGATACTTATTTGCACCGTATCGGACGTACCGCGCGCGCCGGTCGTAAAGGCACCGCAATTTCGCTGGTGGAAGCCCATGACCATc < 1:1744918/140‑1 (MQ=255) | AACTGGCTGCGCGAAGCGGGCATCAACAACTGCTATCTCGAAGGTGAGATGGTACAGGGCAAGCGTAACGAAGCGATCAAGCGTTTGACCGAAGGTCGCGTAAACGTACTGGTCGCAACCGATGTTGCCGCGCGCGGTATCGACATTCCTGACGTCAGCCACGTCTTTAACTTCGATATGCCGCGCAGTGGCGATACTTATTTGCACCGTATCGGACGTACCGCGCGCGCCGGTCGTAAAGGCACCGCAATTTCGCTGGTGGAAGCCCATGACCATC > NZ_CP025268/2717715‑2717991 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |