| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | 1292725 = | 361 (1.200) | 171 (0.670) | 58/232 | 1.0 | 47.8% | intergenic (+182/+2) | narI/CXP41_RS06830 | respiratory nitrate reductase subunit gamma/RtT sRNA |
| ? | NZ_CP025268 | = 1293258 | 68 (0.270) | intergenic (‑44/+3) | CXP41_RS06840/CXP41_RS06845 | RtT sRNA/tRNA‑Tyr | |||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
CGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGA > NZ_CP025268/1293120‑1293396 | cGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTg > 1:3598811‑M2/1‑139 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTga > 1:4002669‑M2/1‑138 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTga > 1:2735634‑M2/1‑138 (MQ=255) ccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatg > 1:4828340‑M2/1‑136 (MQ=255) cTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatgg > 1:160255‑M2/1‑135 (MQ=255) tCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGTGCCGAACCTTAGTCGCAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGATCGTTCAGGGACTTTTGAACGTgatggtg < 1:2761822‑M2/140‑8 (MQ=255) tCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtg > 1:2900057‑M2/1‑133 (MQ=255) cGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtgg > 2:4288067‑M2/1‑132 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggt > 2:1228261‑M2/1‑131 (MQ=255) gTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAGTTCCGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgg < 2:1980765‑M2/140‑12 (MQ=255) gTCGTTGCCTGAGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGCACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAGGGGCAGAATATTTGATTGCGGAGTCGATGGAGAGTTGAGGGACTGTGGAAAGTGAtggtggggg > 2:2340024/1‑140 (MQ=11) gTTGCCTGCGGTAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAAACGTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGGGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:2047582‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGGACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:2281532‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:417352‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:4755016‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:750065‑M2/1‑126 (MQ=255) cTGCGGTATCGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACGGTAGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGCATATTTGATTGCGGAGTCGCTTGAGGGTTCAGGGACTTTTGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:3210352/140‑1 (MQ=11) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 2:716675‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 2:2806659‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCTGCATGGGCAGAATATTTGATAGCGGATTAGGTTGAGAGGTCAGGGATTTTTGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:5172193/140‑1 (MQ=11) gCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACTTTGTGCGAAGGTTATCATCCTGCTCTGCACGGGCAGAATAGTTGGCTGCGGATGCGGTGGGTAGGTCAGGGACTTTTGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGa < 2:583964/140‑1 (MQ=2) gCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGATTCTCATCTTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGTACTTTTGGAAGTgatggtggtgggggaaggattact > 2:4879051‑M2/1‑116 (MQ=255) tctcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgc < 1:2807821‑M2/140‑34 (MQ=255) ctcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcg > 1:4520369‑M2/1‑106 (MQ=255) tGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgctt > 1:286340‑M2/1‑101 (MQ=255) gacgctcGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttc < 1:593391‑M2/138‑41 (MQ=255) acgctCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcg > 1:848220‑M2/2‑99 (MQ=255) tCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgccct < 2:2133935‑M2/140‑46 (MQ=255) gAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttc < 2:1844564‑M2/140‑48 (MQ=255) gAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttc > 1:489969‑M2/1‑93 (MQ=255) aaCCTTAGTCGAAGCTTCTCCTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATGGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcg > 2:852219‑M2/1‑87 (MQ=255) aaCCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcg > 1:4665019‑M2/1‑87 (MQ=255) aaCCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcg < 1:4423783‑M2/140‑54 (MQ=255) accttggtcgaagctTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAGTTCCGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactaaacgctgctggcgtcgccgttcgggacgt < 2:4621350‑M2/133‑55 (MQ=255) gAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgccg < 1:943076‑M2/140‑64 (MQ=255) gAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgcggcgcgcatcgcccttcgggtcgtggcctgtgg < 2:3891434‑M2/140‑64 (MQ=255) aGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggca > 1:935640‑M2/1‑75 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattagtcagcgctgcgcgcttggcgccaggggtcgatgcctgcgccaa < 2:3116855‑M2/140‑67 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaa > 1:2392423‑M2/1‑74 (MQ=255) ttCGCACCGTTCCACGTGTGGGCAGAAGGTTTGATTGCGGATTCGTTTGAGGGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacg > 2:2411325‑M2/1‑72 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGCACTTTTGAAAGTgatggtggtggggcaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgct > 2:1020360‑M2/1‑70 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGGTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgct < 1:3124529‑M2/140‑71 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGTTTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgct > 1:1939465‑M2/1‑62 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGGGAGTGAAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattacacagcgcggcgctcatcgccctttgagtcgttgcctgcggcattgcccgctcgct < 2:52156‑M2/140‑79 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAACGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcgggaacgctctctcgct < 1:2173360‑M2/140‑79 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagctctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgct < 1:1999588‑M2/140‑79 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgct < 1:341842‑M2/140‑79 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgct < 1:2447004‑M2/140‑79 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgct < 1:4285821‑M2/140‑79 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgagcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgtggcaacgctctctcgct < 2:3560671‑M2/140‑79 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctg < 1:1309674‑M2/140‑80 (MQ=255) aTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctacggcaacgctctctcggtggggctc < 2:3428007‑M2/140‑86 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGATAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggtggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgtgtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgag < 1:3766391‑M2/140‑89 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgag < 1:5076817‑M2/140‑89 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgag < 1:457129‑M2/140‑89 (MQ=255) aGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctgacgctcgagccg > 1:3901569‑M2/1‑49 (MQ=255) tatTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaacc < 1:4331491‑M2/140‑96 (MQ=255) ttGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGATTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaatcttg < 2:4044353‑M2/140‑99 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 1:1777803‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 1:415176‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 1:3653819‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga > 1:3444018‑M2/1‑37 (MQ=255) cGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc < 1:2035031/117‑1 (MQ=17) gATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagct < 2:1094188‑M2/140‑108 (MQ=255) ttCGCTTGAGAGTTCAGGGATTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttc > 1:919559‑M2/1‑31 (MQ=255) gttgggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGGCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTaa < 2:1584952/133‑1 (MQ=255) ttgggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAAt < 2:663244/134‑1 (MQ=255) ggaagTTCAGGTACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 2:457129/137‑1 (MQ=255) ggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 2:396356/137‑1 (MQ=255) gagaTTTCAGGGACTTTTGCAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGCGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 2:3934173/140‑1 (MQ=255) ttCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGACGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCGCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 1:802215/140‑1 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1:1421411/140‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 1:1104416/140‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 1:1843186/140‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 1:2277109/140‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTCACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGACCCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 2:762811/140‑1 (MQ=255) gggggacTTATGAAAGCgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgc > 2:2075333‑M2/3‑17 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaaggctatctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgc < 1:3706959‑M2/140‑124 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTGAAATTTTGCGGCAATGCTTGATAtg > 2:2485688/1‑140 (MQ=255) aGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgca > 1:1004811‑M2/1‑16 (MQ=255) aGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgca < 2:3646066‑M2/140‑125 (MQ=255) aGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgca > 1:2672588‑M2/1‑16 (MQ=255) gggACGTTTGGCAGTgatggtggtgggggcaggattactcagcgctgcgcgcgtcgcgcttcgggtcgctgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcat > 2:446911‑M2/1‑15 (MQ=255) ggACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtgggg > 1:2283512/1‑138 (MQ=255) aCTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatggg < 1:2079383‑M2/140‑129 (MQ=255) aCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtggtggt < 1:5191135/140‑1 (MQ=255) ttttGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggca > 2:1628213‑M2/1‑10 (MQ=255) tttGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggc > 2:420344‑M2/1‑9 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggg > 2:1066398/1‑140 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCCTCGCTGTTGTTGACGGCTGATTTAGCGTCTGCTGCCTTTGGCGGCTCTGGAACCCCACCAGGGGTCATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggg > 2:3142467/1‑140 (MQ=21) ttGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcaga > 1:487279‑M2/1‑8 (MQ=255) ttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAATGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATCCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTgggg < 1:3812012/140‑1 (MQ=255) tGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAAGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggggg < 1:1895133/140‑1 (MQ=255) gTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgctt < 2:3714078‑M2/41‑40 (MQ=255) tgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttc > 1:4477475‑M2/1‑1 (MQ=255) | CGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGA > NZ_CP025268/1293120‑1293396 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |