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tCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGAGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGatat > 1:3762127/1‑140 (MQ=255) tCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCCATGACTTGGGCACCTGGATGCGAACCAGGGTATGcccgcat > 2:2604547/1‑135 (MQ=18) gAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCaa > 1:5081762/1‑140 (MQ=255) ttGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCCGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAc < 2:1950194/140‑1 (MQ=255) cgagATTCAAACTTGTGACCCCATCATTATGGGTGATGGGCTCTAACCGACTGAGCTACGGAGCCAGATTGTTTCTACGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCg < 2:2679923/137‑1 (MQ=25) ggcttCAAACCTGTATACCCATCATTATGAGTGATGCGCACTAAACAACAAAGCTACGCAGCCAGATCGTTTCTAAGATGGCTGGGGTACGTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGCTATCAAAATCCGGTGCCTTACCGCt < 2:4662936/137‑1 (MQ=18) ccTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGCGCTGACCCCAACGACGTAAAGTAGCCCGATAGTGTCTACCATGGCTGGGGTACATGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAc < 2:3723461/140‑1 (MQ=14) acTGCGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTATAACGAACTGAGCTACGTGGACAGATTGTTTCTAATATGGCTGGGGTACCTGGATGCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAACGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAc < 2:1556125/139‑1 (MQ=21) tgACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTTTTTTTTGGATGGCTGGGGCAGCTGTATTCGAAGCAGGGAACGCATGTAGCAAAAACGGGTGCCTTACCGTTTCGAGATACCCCa > 2:3848882/1‑140 (MQ=18) tgACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTTTTCGATGGCTTGGGTACCTGGGTTGGGCGCAGGGTATGCGTGTATCATAAACCGGTGCCTTACCTCTTGGCGGTACCTCa > 2:3258478/1‑140 (MQ=21) | TGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCA > NZ_CP025268/695621‑695878 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |