Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 448,506 | 0 | T | C | 20.2% | 793.4 / 35.4 | 334 | M396V (ATG→GTG) | cyoB | cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (145/120); new base C (2/65); total (148/186) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.43e-17 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 334 total aligned reads displayed.
ACCAGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCATTGTGGTGAT > NZ_CP025268/448374‑448644 | ccaGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCa > 1:3657997/1‑140 (MQ=255) caGTTGGCCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGCCACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGACCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCAc > 2:4286226/1‑140 (MQ=255) caGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCAc > 2:5167990/1‑140 (MQ=255) caGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGAGCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCAc > 1:1561980/1‑140 (MQ=255) caGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCAGAAGACCACGCCGCCGATGAGCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCGGCGCCCGGTACGGCAAGAAGCACACCAGTCATGccacccac > 2:2953/1‑140 (MQ=255) aGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCAcc < 1:2094965/140‑1 (MQ=255) aTCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGGCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGGAATCAGGAACAGGCTGTTATGCTGAAGGAAGTACGCGCCGGGTATGGCCAGCAGCAAGCCAGTCAGCCCGCCCACCGAGAAggg > 2:48842/1‑139 (MQ=255) aTCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGt < 1:1299631/140‑1 (MQ=255) aTCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCACACCGAGAAGGt > 1:4454496/1‑140 (MQ=255) aTCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGACAGTCATCGCGCCCACCGAGAAGGt < 2:5114523/140‑1 (MQ=255) tCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGt > 1:2202616/1‑139 (MQ=255) tCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGt > 2:2921803/1‑139 (MQ=255) tCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTg > 1:3160534/1‑140 (MQ=255) cTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACg > 1:2932492/1‑140 (MQ=255) tGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGa > 1:1703607/1‑140 (MQ=255) cGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATCCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCAAGACATCCCGCCCACCGAGAAGGCGCCGATa > 2:774640/1‑140 (MQ=255) cGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGGGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGGAGTCCGCGCCCGGTACGGCCGGCAGCACGCCAGACATCCCGCCCACCGCGCAGGCGCCGATa > 2:4328274/1‑140 (MQ=255) gAAGCAGCCGAAGTCCACGCCGCCGATGCTCACGTTATGGAAGGGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGCACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCTGCACGACAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATaa < 2:4628365/140‑1 (MQ=255) gAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATaa > 1:581337/1‑140 (MQ=255) aaGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCACCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATaaa < 2:2228180/140‑1 (MQ=255) cagcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGGGACGATAAAAcc > 1:3559679/1‑140 (MQ=255) ggcCGAAGGCCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCCGGAACATGCTGTTATGCAGAACGACGTCCGCGCCCGGTACTGCCAGCTTTTCTCATGACACCGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCg < 2:4425159/139‑1 (MQ=255) agcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCg < 1:255708/140‑1 (MQ=255) agcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGAAAGTCACCGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCg < 2:3611122/140‑1 (MQ=255) gcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCTTGCAAGACACGGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa < 2:1571549/140‑1 (MQ=255) gcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTTACCGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa < 2:3622879/140‑1 (MQ=255) gcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa < 1:1933766/140‑1 (MQ=255) gcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa < 1:1578976/140‑1 (MQ=255) gcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa < 2:5023021/140‑1 (MQ=255) aCCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGACGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCca < 1:4077074/140‑1 (MQ=255) aCCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCca < 1:1129421/140‑1 (MQ=255) cACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCcaca > 1:4580353/1‑140 (MQ=255) aCGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGTTTGAATGACACCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAg < 2:3175475/140‑1 (MQ=255) cgccgcCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAAc > 1:1357515/1‑126 (MQ=255) cgccgcCGATGATCACGTGGTGGAAGTTCGCAATCAGGAACAGGCTGTTGTGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCAAGCAGGACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGCGACGACAAAAGCGACGGTCcccatc > 2:2712342/1‑138 (MQ=255) gccgccGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGACGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCATTTTTAATGTTACGGCGACCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCa < 2:1518788/140‑1 (MQ=255) cccgccgATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCa < 1:4215666/139‑1 (MQ=255) cgATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCa < 1:3504778/140‑1 (MQ=255) atgatCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGa > 1:3716998/1‑140 (MQ=255) tgatCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGaa < 1:3304478/140‑1 (MQ=255) tgatCACGGTATGGACGTGCGCAATCCGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAACTCCCCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGaa < 1:3695193/140‑1 (MQ=255) cGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTTACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAac > 1:3757695/1‑140 (MQ=255) ggAAGTGGGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGTTCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATg < 2:1281641/140‑1 (MQ=255) ggAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGACCGAAGTCCGCGGCCGGTACGGCCAGCAGCACGCAAGTCACCCCGACCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATg < 2:2591441/140‑1 (MQ=255) ggAAGTGCGAAATCAGGAACCGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCAAACTGCACGCCAGATATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATg < 2:1695377/140‑1 (MQ=255) gAAGTGGGCAATCACGAACAGGCAGTTATGCAGACCGAAGTCCGCTCCCGGTACGGCCAGCTTTTTTAATGATACGGCGACCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGc < 2:2743077/140‑1 (MQ=255) gAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGTACTCCAGTCACCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGc < 2:187099/140‑1 (MQ=255) gAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGc > 1:784109/1‑140 (MQ=255) gAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGc < 1:1058076/140‑1 (MQ=255) tGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCca < 1:2371530/110‑1 (MQ=255) tGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGcc > 1:1092251/1‑140 (MQ=255) tGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGcc < 1:3454299/140‑1 (MQ=255) ggcgcAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCTTCTTTCATGTCACGCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGcc < 2:3856245/139‑1 (MQ=255) tgcAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGACGTCCGCGCCCGGTACAGGCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAGACGGATGGTCGAAAAAAGCGCATAATTGAACACCCTGCGGccgc > 2:2392998/2‑138 (MQ=255) cgcAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCt > 1:2728474/1‑140 (MQ=255) cgcAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCt > 1:2335884/1‑140 (MQ=255) cgcAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCt > 1:1806056/1‑140 (MQ=255) aaTCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCACCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGAt < 2:4990335/140‑1 (MQ=255) cAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCACCGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACa < 2:4055332/140‑1 (MQ=255) aGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACAt < 2:1023081/140‑1 (MQ=255) aGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCACCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACAt < 2:542291/140‑1 (MQ=255) aaCAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGt > 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aGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGaa > 1:1710752/1‑140 (MQ=255) aGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCACTCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTTCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGaa < 2:3105905/140‑1 (MQ=255) aGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCACCTTCTCTCATGTCACGGCGACCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGaa < 2:7197/140‑1 (MQ=255) aGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGACCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGaa < 1:4286226/140‑1 (MQ=255) aaCGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa > 1:3028895/1‑74 (MQ=255) aaCGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa < 2:3028895/74‑1 (MQ=255) aaCGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGa > 1:5024929/1‑140 (MQ=255) aaCGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGa > 2:1366620/1‑140 (MQ=255) aaCGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTCAACAGCCAGTTGAAGa > 1:2886288/1‑140 (MQ=255) cGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCGCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATg < 2:3700214/104‑1 (MQ=255) cGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGCGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATc > 1:1506124/1‑140 (MQ=255) cGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCGCAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGACCTGATACATGGTTAACAGCCCTTTGAAGATc > 2:106945/1‑140 (MQ=255) cGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATc > 1:2307911/1‑140 (MQ=255) gTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGAGGCGGCCCTGAGACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCa > 1:2464992/1‑140 (MQ=255) ccGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCAcc < 2:4825267/140‑1 (MQ=255) gcgcCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCAcccc > 1:1223974/1‑140 (MQ=255) gcgcCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCAcccc > 1:1480577/1‑140 (MQ=255) ccgggTACGGCCAGATGTACGCATGTTACGGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCAGCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGt < 2:2071130/137‑1 (MQ=255) cccGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGGTGAAGATCTTCACCCCGGt > 1:381139/1‑140 (MQ=255) cccGGTACGGCCAGCAGCACGACAGTCACCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGt < 2:148252/140‑1 (MQ=255) gTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGAGACATGGTGAAGAACCAGTTTAAGATCTCCCCCCCGGTCggg > 2:1841496/1‑140 (MQ=255) tACGGCCAGCTGCACGCCAGTCACCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACCGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGa < 2:2347721/140‑1 (MQ=255) ccAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCg < 1:1623121/140‑1 (MQ=255) agcagcACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGAt < 2:4736822/140‑1 (MQ=255) agcagcACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGAt < 2:3312115/140‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATa > 1:1737506/1‑140 (MQ=255) cagcaCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCTGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATaa > 1:4154238/1‑140 (MQ=255) cagcaCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATaa > 1:190797/1‑140 (MQ=255) agcaCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAGTGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAAt < 1:2243297/140‑1 (MQ=255) agcaCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGTCGATAAt > 1:2836501/1‑140 (MQ=255) agcaCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAAt > 1:4739217/1‑140 (MQ=255) gTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCATTgtggt < 1:4409338/140‑1 (MQ=255) gTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCATTgtggt > 1:4920266/1‑140 (MQ=255) | ACCAGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCATTGTGGTGAT > NZ_CP025268/448374‑448644 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |