| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,156,813 | A→G | *318* (TAA→TAG) | fabH → | beta‑ketoacyl‑ACP synthase III |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,156,813 | 0 | A | G | 99.7% | 969.8 / NA | 289 | *318* (TAA→TAG) | fabH | beta‑ketoacyl‑ACP synthase III |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (179/109); minor base T (1/0); total (180/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
GTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAAGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTGCGGCGCT > NZ_CP025268/1156677‑1156947 | tAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATa < 1:3233831/140‑1 (MQ=255) tAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATa < 1:4688067/140‑1 (MQ=255) tAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATa < 2:276271/140‑1 (MQ=255) ccTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGAt > 1:1782646/1‑140 (MQ=255) tctGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTa < 2:1020733/140‑1 (MQ=255) ctGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaa > 1:31212/1‑140 (MQ=255) ctGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaa > 1:2894943/1‑140 (MQ=255) ctGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaa > 2:3602073/1‑140 (MQ=255) ctGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCGGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCTGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGAGTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaa > 2:1484240/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaa > 2:3153932/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaa > 1:521727/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGAGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaca > 2:631543/1‑138 (MQ=255) tGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGCACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGCTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaa > 1:5045706/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCGGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGAGTCAGCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGAGAAGGATTaaaa > 2:4354570/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaaa > 2:747419/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaaa > 1:3738063/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaaa > 1:1252155/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCGGGTTCGTTTCGAGGATAAGGAGTaaaa > 2:2010220/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATCCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaaa > 2:3900853/1‑140 (MQ=255) ctctGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGGTAAGGATTAAAACATgt < 2:5072804/140‑2 (MQ=255) tctGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCCTTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCCTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGAc > 2:2340123/1‑140 (MQ=255) cccGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAAt < 1:2323268/140‑1 (MQ=255) cccGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAAt < 1:5143922/140‑1 (MQ=255) gTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTGCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAAATTg > 1:1870977/1‑140 (MQ=255) tGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGc > 2:2082549/1‑140 (MQ=255) tGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGc > 2:449890/1‑140 (MQ=255) cgcgcTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCAt > 2:2459848/1‑140 (MQ=255) gcTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACGTGAGGCTCCGCGCTGGTTCGGTGCTAGGATAAGGCTTAAAACATGACGCAATTTGCATTtg > 2:908103/1‑140 (MQ=255) cTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGACGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtgt < 2:4124370/140‑1 (MQ=255) cTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtgt < 1:3434461/140‑1 (MQ=255) cTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtgt < 1:3527493/140‑1 (MQ=255) cTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtgt < 1:2222488/140‑1 (MQ=255) cTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGACGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtgt < 1:2248195/140‑1 (MQ=255) aTGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGCATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTc > 2:3524123/1‑140 (MQ=255) aGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTg > 2:2448131/1‑140 (MQ=255) cTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGa < 1:5077344/140‑1 (MQ=255) cTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGa < 1:2122541/140‑1 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg < 1:3917455/140‑1 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg < 1:667964/140‑1 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg > 1:4582190/1‑140 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg > 1:3135703/1‑140 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg > 1:3794551/1‑140 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg > 1:1693732/1‑140 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGAGTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg > 1:3304001/1‑140 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cgcATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAAc < 1:1571464/140‑1 (MQ=255) cgcATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAAc < 1:4849110/140‑1 (MQ=255) cgcATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATGTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAAc < 2:1752172/140‑1 (MQ=255) tAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTg < 1:1243660/140‑1 (MQ=255) gCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAATCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAATGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGaa < 1:1992290/140‑1 (MQ=255) ccGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAAt > 1:3623801/1‑140 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(MQ=255) ttGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCa > 1:1222798/1‑140 (MQ=255) ttGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCa > 1:3842930/1‑140 (MQ=255) cGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTg < 2:2613754/140‑1 (MQ=255) cGGGGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTg < 1:358040/140‑1 (MQ=255) tGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCg > 1:873752/1‑140 (MQ=255) tGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCg > 2:1254673/1‑140 (MQ=255) gggCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTg > 1:4993316/1‑140 (MQ=255) gggCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTg > 1:1294734/1‑140 (MQ=255) gggCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTg > 2:462697/1‑140 (MQ=255) ggCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGc > 2:3422651/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAAGCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCt < 2:3708818/140‑1 (MQ=255) gCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCt < 1:2448131/140‑1 (MQ=255) cTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTg > 2:2176705/1‑140 (MQ=255) ccGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGaa > 1:4135065/1‑140 (MQ=255) ccGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGGTTGCTGaa > 1:2710923/1‑140 (MQ=255) cgcgCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAg > 1:3487251/1‑140 (MQ=255) gcgcTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGc > 1:2835235/1‑140 (MQ=255) gTTCGTTTCTAGAATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTgc > 2:5131279/1‑140 (MQ=255) gTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTgcggcg < 1:4646956/140‑1 (MQ=255) gTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTgcggcg < 2:1133983/140‑1 (MQ=255) ttCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTGCGGCGCt < 1:796932/140‑1 (MQ=255) ttCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTGCGGCGCt > 1:3075692/1‑140 (MQ=255) | GTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAAGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTGCGGCGCT > NZ_CP025268/1156677‑1156947 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |