Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NZ_CP025268 1,576,151 T→G I238I (ATA→ATC gadB ← glutamate decarboxylase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NZ_CP0252681,576,1510TG100.0% 167.9 / NA 77I238I (ATA→ATCgadBglutamate decarboxylase
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                                                                 |                                                                                                                                       
cAGACGATCTCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGGATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAgt                                                               >  1:4483644/1‑140 (MQ=9)
cAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGGCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAgg                                                               >  1:4483530/1‑139 (MQ=9)
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      atatCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGt                                                         <  2:2494389/140‑1 (MQ=18)
       tatCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTTCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTc                                                        >  1:3126877/1‑140 (MQ=18)
       tatCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTc                                                        >  2:3422072/1‑140 (MQ=18)
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                   cgaACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTc                                            >  2:689845/1‑140 (MQ=17)
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                   cgaACGGTGCAAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACAGGTAGCGGCATGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCAGTTGTGGGAGCTCATAGTTACCAGGGGAGGTCACGCCGAAAGTc                                            >  2:2123274/1‑140 (MQ=11)
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                        ggTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGcac                                       <  2:2498761/140‑1 (MQ=18)
                        ggTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGcac                                       <  2:4775949/140‑1 (MQ=18)
                          tGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGGACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGcacca                                     >  2:3169548/1‑140 (MQ=12)
                          ggCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGcacca                                     <  2:487276/139‑1 (MQ=18)
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                                         gCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGtttt                      <  2:4631035/140‑1 (MQ=18)
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                                                       tgtgGATGTCGATGTCGATACCAGTATCGGCCTGGAACTGATCCAGGGCATCGTGCAGCGGTTGTGCGAAATAATAGTTACCAGTGTAGGTCACGAAGAAAGTCGGCACCCCGCCGAGTGTGTTTTCGTCACAGGCTTCa        <  2:4087351/140‑1 (MQ=11)
                                                       tgtgCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCa        >  2:3502917/1‑140 (MQ=18)
                                                        gtgCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCaa       <  2:2008231/140‑1 (MQ=18)
                                                           cATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCa    <  2:1463054/140‑1 (MQ=18)
                                                           cATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCa    >  2:1174235/1‑140 (MQ=18)
                                                           cATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCa    >  1:2254715/1‑140 (MQ=18)
                                                            atgtcgatgtcgATACCTGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTTTGGGAACTTATAGTTACCAGGGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCAt   >  1:385101/1‑140 (MQ=11)
                                                             tgtcgatgtcgaTACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCATg  <  2:1624170/140‑1 (MQ=18)
                                                             tgtcgatgtcgaTACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCATg  >  1:4816767/1‑140 (MQ=18)
                                                             tGTCGATGACCATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGATGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCTAAAGTCGGCACCACGCCGATTGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCATg  <  2:3799160/140‑1 (MQ=11)
                                                                 |                                                                                                                                       
CAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCTATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCATG  >  NZ_CP025268/1576086‑1576286

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: