| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,656,356 | A→G | pseudogene (696/696 nt) | CXP41_RS08775 → | IS3‑like element IS2 family transposase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,656,356 | 0 | A | G | 99.6% | 728.9 / NA | 228 | pseudogene (696/696 nt) | CXP41_RS08775 | IS3‑like element IS2 family transposase |
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Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
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tAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGGTGAACTACGCTCCTCTGTTTGTTACGCAATAAAAACTGGTGTTTTCGACTATGCAAAACAGTTTCCCTCCTCACGCAATCTGGAAAAATTTGGTGAGGCCCGa > 2:1425674/1‑140 (MQ=255) tAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGGTGAACTACGCTCCTCTGTTTGTTACGCAATAAAAACTGGTGTTTTCGACTATGCAAAACAGTTTCCCTCCTCACGCAATCTGGAAAAATTTGGTGAGGCCCGa > 1:1118412/1‑140 (MQ=255) aaCCGATGTCTGGAAAACAAGGGGCTAATCTACAGGTGAACTACTATCCTCTGTTTGTTACGCAATAAAACCTGGTGTTTTCGACGATGCAAAACCGTTTCCCTCCTCTCGCAATCTGGAACATGTTGGTGAGGCCCGAc < 2:3016594/140‑1 (MQ=255) aaCAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGGTGAACTACGCTCCTCTGTTTGTTACGCAATAAAAACTGGTGTTTTCGACTATGCAAAACAGTTTCCCTCCTCACGCAATCTGGAAAAATTTGGTGAGGCCCGAc > 2:775599/1‑140 (MQ=255) tGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGGTGAACTACGCTCCTCTGTTTGTTACGCAATAAAAACTGGTGTTTTCGACTATGCAAAACAGTTTCCCTCCTCACGCAATCTGGAAAAATTTGGTGAGGCCCGACAAGAtt > 2:2830900/1‑140 (MQ=255) tGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGGTGAACTACGCTCCTCTGTTTGTTACGCAATAAAAACTGGTGTTTTCGACTATGCAAAACAGTTTCCCTCCTCACGCAATCTGGAAAAATTTGGTGAGGCCCGACAAGAtt > 1:2418472/1‑140 (MQ=255) tGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGGTGAACTACGCTCCTCTCTTTGTTACGCAATAAAAACGGGTGTTTTCGACTAGGCAATACAGATTCCATCCTCACGCAGTCTGTAAAAATTTGGTGAGGCCCGACAAGAtt > 2:3479355/1‑140 (MQ=255) gTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGGTGAACTACGCTCCTCTGTTTGTTACGCAATAAAAACTGGTGTTTTCGACTCTGCAAAACAGTTTCCCTCCTCACGCAATCTGGAAAAATTTGGTGAGGCCCGACAAGAttt < 2:727778/140‑1 (MQ=255) gTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGGTGAACTACGCTCCTCTGTTTGTTACGCAATAAAAACTGGTGTTTTCGACTATGCAAAACAGTTTCCCTCCTCACGCAATCTGGAAAAATTTGGTGAGGCCCGACAAGAttt > 1:4720560/1‑140 (MQ=255) tGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGGTGAACTACGCTCCTCTGTTTGTTACGCAATAAAAACTGGTGTTTTCGACTATGCAAAACAGTTTCCCTCCTCACGCAATCTGGAAAAATTTGGTGAGGCCCGACAAGATTTAAc < 2:2721108/140‑1 (MQ=255) tGGAAATATAGGGGCAAATCCAAAGGTGAACTACGCTCCTCTGTTTGTTACGCAATAAAACCTGGTGTTTTCGACTATGCCAAACAGTTTCCCTCCTCACGCAATCTGGAAAAATTTGGTGAGGCCCGACACGATTTAAc < 2:2234392/140‑1 (MQ=255) | TGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAAGGGCAAATCCACAGGTGAACTACGCTCCTCTGTTTGTTACGCAATAAAAACTGGTGTTTTCGACTATGCAAAACAGTTTCCCTCCTCACGCAATCTGGAAAAATTTGGTGAGGCCCGACAAGATTTAACCA > NZ_CP025268/1656230‑1656487 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |