Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 1,661,562 | A→G | *187* (TAA→TAG) | speG → | spermidine N1‑acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 1,661,562 | 0 | A | G | 99.2% | 883.6 / NA | 269 | *187* (TAA→TAG) | speG | spermidine N1‑acetyltransferase |
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Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
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1:1123701/1‑140 (MQ=255) gACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGAGTAGCGTGTCTGTCATATTCACAGCTCTGtt > 2:1352936/1‑140 (MQ=255) cacaATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACa < 2:3256185/140‑1 (MQ=255) acaTTATCATTATTAATATTCGATCGTATTTTTGCGGCTGTAATCCCGTTCCCCGGCGGCTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGAATTAGCGTGACTGCCATATTCACAGCTCTGTTTTACAt < 2:1758979/140‑1 (MQ=255) | GTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT > NZ_CP025268/1661425‑1661695 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |