| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,867,449 | G→A | intergenic (‑205/‑137) | msrB ← / → gapA | peptide‑methionine (R)‑S‑oxide reductase MsrB/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,867,449 | 0 | G | A | 99.6% | 842.9 / NA | 226 | intergenic (‑205/‑137) | msrB/gapA | peptide‑methionine (R)‑S‑oxide reductase MsrB/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (88/137); total (88/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
GCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGGGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGAAT > NZ_CP025268/1867314‑1867583 | gCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCg > 1:1233412/1‑140 (MQ=255) cAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGa < 1:5137585/140‑1 (MQ=255) aaaTTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGagt < 2:3285216/140‑1 (MQ=255) aaaTTTTGTCCTAAACTTCATCTCGACGAAATGGCTCCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGagt < 1:786591/140‑1 (MQ=255) ttttGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGagtcag < 1:56418/140‑1 (MQ=255) ttttGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGagtcag < 2:4729221/140‑1 (MQ=255) tCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTcgcg < 1:447793/140‑1 (MQ=255) ccTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGt < 2:2290680/140‑1 (MQ=255) ccTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGt < 2:128034/140‑1 (MQ=255) ccTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGt < 1:2280346/140‑1 (MQ=255) aatAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGACGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCCCGt < 2:2821770/138‑1 (MQ=255) cTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCTCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATCTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTa < 2:1882275/140‑1 (MQ=255) tAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTaa < 1:1039373/140‑1 (MQ=255) tAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTaa < 1:4230341/140‑1 (MQ=255) cTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGCCCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCt < 2:2266844/140‑1 (MQ=255) tttaTCTCGACGCAATGGCTCCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTGTCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGCGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGGGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCtt < 2:149499/137‑1 (MQ=255) ttGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTAACGTTATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCtt < 1:3702949/140‑1 (MQ=255) gATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAg > 2:5156079/1‑140 (MQ=255) ctcGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGca < 2:2138555/140‑1 (MQ=255) ctcGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGca < 2:2542674/140‑1 (MQ=255) ctcGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCATTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGca < 1:4330254/140‑1 (MQ=255) ctcGACAGAATGGCTGCACCTAAATCGTGCTGAAAATCACATATATATCGTGATTGCCCTTTAAAATTCAGGGCGCCAACCCCATGTGCTCTCAAGCGCAAAGGAACAGTGAGGAAAGTCAGTCGCGTAATGCTGAGGca < 2:1785690/140‑1 (MQ=255) cgacgaAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGcaca > 1:2425364/1‑140 (MQ=255) acgaAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAgg > 2:4575957/1‑140 (MQ=255) aaTGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGgattg > 1:720047/1‑140 (MQ=255) tGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGgattgat > 2:1447586/1‑140 (MQ=255) cTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTg > 2:4836007/1‑140 (MQ=255) gTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGa < 1:1380975/140‑1 (MQ=255) tgatgaAAATCACATGTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGATGCGAGTCAGTCGCGTAATGCGTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGac > 1:419183/1‑140 (MQ=255) gatgaAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGaca < 1:328285/140‑1 (MQ=255) atgaAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGagtcag < 2:4752686/93‑1 (MQ=255) atgaAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGagtcag > 1:4752686/1‑93 (MQ=255) atgaAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGacac > 1:4682291/1‑140 (MQ=255) atgaAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGacac > 2:3837034/1‑140 (MQ=255) atgaAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGacac > 2:3836678/1‑140 (MQ=255) gacaggcacaTTTTTAGCCTGATGGCCCTATAAAATTCGGGGCGTCGACCCCATGTGGTCGCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAACGCGTATGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGGCACGa < 2:3987782/134‑1 (MQ=255) gaAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGa < 1:2019412/140‑1 (MQ=255) aaaTCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGAtt < 1:4042378/140‑1 (MQ=255) aaaTCACATCATTAGCGTAATTGCGCTTTCAATTTCGGGGCGCCGCCCCTATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGCGAGTCGCTTCAGTGTCGTAAAGCTTAGCCACAGCCTTGATTTGGCTTAATGATGGACACGAtt < 2:1562556/140‑1 (MQ=255) acaTTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCt < 1:1403663/140‑1 (MQ=255) acaTTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCt < 2:1802549/140‑1 (MQ=255) ttttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGAc < 2:1767350/140‑1 (MQ=255) ttttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGAc < 1:2650480/140‑1 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACg < 2:3308682/140‑1 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACg < 1:973791/140‑1 (MQ=255) tCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGc > 1:600193/1‑140 (MQ=255) cGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTCATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCg < 2:3109948/140‑1 (MQ=255) tAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTa < 1:1933060/140‑1 (MQ=255) tAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTa > 1:1346670/1‑140 (MQ=255) aTTGCCCTTTAAGATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGGAGAGTGAGGCTAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGAACAGGGTTGATTTGTCGCAATGATTTACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAg > 2:3366952/1‑140 (MQ=255) aTTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAg > 1:1633319/1‑140 (MQ=255) ccTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGtttt < 2:497747/140‑1 (MQ=255) cTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGttttt > 2:4954483/1‑140 (MQ=255) tttAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTg < 1:1146931/140‑1 (MQ=255) tAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTa > 2:1525218/1‑140 (MQ=255) tAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTa > 1:3185647/1‑140 (MQ=255) tAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTa > 2:20046/1‑140 (MQ=255) aaTTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAAtt < 1:3529341/140‑1 (MQ=255) ggggCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTACGGTTTTTGTAATTTTACa > 2:674872/1‑140 (MQ=255) ggCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAgg < 1:4644211/140‑1 (MQ=255) ggCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAgg > 2:1121938/1‑140 (MQ=255) ggCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAgg < 2:4284710/140‑1 (MQ=255) cgcCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCa < 2:3083310/140‑1 (MQ=255) cgcCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCa < 2:1231426/140‑1 (MQ=255) cgcCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCa < 2:2426798/140‑1 (MQ=255) cgcCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCa < 2:4043390/140‑1 (MQ=255) cgcCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCa < 1:2159149/140‑1 (MQ=255) cgcCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCa < 1:4292324/140‑1 (MQ=255) cgcCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCa < 1:3619236/140‑1 (MQ=255) ccGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAAc < 1:1121938/140‑1 (MQ=255) gACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCt > 1:4703373/1‑140 (MQ=255) ccccATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCttt < 1:956027/140‑1 (MQ=255) aTGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTAtt < 1:4991869/140‑1 (MQ=255) tgtgGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTc > 2:1161767/1‑140 (MQ=255) gtgGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCa < 1:5036758/140‑1 (MQ=255) gtgGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCa < 2:600193/140‑1 (MQ=255) gtgGTATCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCa < 2:1603414/140‑1 (MQ=255) gTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAAGGCTGAGGCACAGTAGTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGGTTGACGCTGCGTAAGGTTTGTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTa > 1:3714007/1‑140 (MQ=255) tctcAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTaa > 1:3479071/1‑140 (MQ=255) tcAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACa > 1:442835/1‑140 (MQ=255) aaGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACaaa > 2:2906008/1‑140 (MQ=255) aaGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACaaa > 1:2549027/1‑140 (MQ=255) aaGCCC‑AAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAAt < 2:4347401/140‑1 (MQ=255) aGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAAt > 1:907278/1‑140 (MQ=255) aGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAAt > 1:663593/1‑140 (MQ=255) aGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAAt > 1:4040050/1‑140 (MQ=255) cccAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGATTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAg > 1:2824763/1‑140 (MQ=255) ccAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGc < 2:3586031/140‑1 (MQ=255) cAAAGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGcg > 1:2350123/1‑139 (MQ=255) aaaGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtg > 1:3888052/1‑140 (MQ=255) aaaGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtg > 1:3018859/1‑140 (MQ=255) aaGGAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtgg < 1:5194635/140‑1 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 2:3228308/140‑1 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 2:2176188/140‑1 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 1:2497071/140‑1 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 2:823203/140‑1 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGGCGCGTAATGCTCAGTCACAGGATTGATTTGTCGCAATTATTGACACTATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGTTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTTATTAACAAATGGCtggta < 2:5119063/140‑2 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGCCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGTTTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 1:2866221/140‑1 (MQ=255) aaGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGa < 1:4382924/140‑1 (MQ=255) gagTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTGGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGTAat > 2:4197309/1‑140 (MQ=255) | GCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGGGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGAAT > NZ_CP025268/1867314‑1867583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |