| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 183,450 | A→G | K386R (AAG→AGG) | cdaR → | DNA‑binding transcriptional regulator CdaR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 183,450 | 0 | A | G | 99.7% | 1048.6 / NA | 313 | K386R (AAG→AGG) | cdaR | DNA‑binding transcriptional regulator CdaR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (181/131); minor base T (1/0); total (182/131) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
CAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GG‑TGAAGAGCGGTAAGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGAT > NZ_CP025268/183315‑183583 | cAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGtt < 1:474908/140‑1 (MQ=255)cAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGtt < 2:2821574/140‑1 (MQ=255) aaaGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTa < 1:837931/140‑1 (MQ=255) aaaGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTa < 2:549608/140‑1 (MQ=255) aaaGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCAGTAGGTTa < 2:3667451/140‑1 (MQ=255) ttgttTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTa > 2:4438668/1‑140 (MQ=255) cATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAgg < 2:622593/140‑1 (MQ=255) cATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAgg < 1:377355/140‑1 (MQ=255) tCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAggcg > 1:3826773/1‑140 (MQ=255) cGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAggcgg > 2:2083118/1‑140 (MQ=255) cGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACAGGGCTGGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAGTGGG‑TGAAGAGCGGTAGGTTATGCTTTAAGGTTGAgtcgg > 2:4604221/1‑140 (MQ=255) tcaTACCCTGGAGTATCGGCTTACTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTCGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGgcggcg < 2:4346385/138‑1 (MQ=255) tAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGgcggcg < 1:1529694/140‑1 (MQ=255) tAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGgcggcg < 1:1786515/140‑1 (MQ=255) cccTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGc < 2:692673/140‑1 (MQ=255) cccTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGc < 1:4717101/140‑1 (MQ=255) ccTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCt > 1:1022835/1‑140 (MQ=255) tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGGAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCtga > 1:3001393/1‑138 (MQ=255) tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGcaca > 1:2437642/1‑140 (MQ=255) tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCa > 1:4098421/1‑140 (MQ=255) tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCa > 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gAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCAGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAGGGTTGAGGCGTCGCTGGCTCAtt > 2:2919386/1‑140 (MQ=255) aGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTc > 2:5102417/1‑140 (MQ=255) aGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTc > 2:4276049/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 1:4198693/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 1:2169396/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 1:4524223/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt < 2:3538125/140‑1 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 1:4934134/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 1:2648758/1‑140 (MQ=255) cGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTc > 1:558366/1‑140 (MQ=255) ggCTTAATCGTATAGCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCa < 1:1205717/140‑1 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGGTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 1:4660823/140‑1 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 1:2044111/140‑1 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 1:947835/140‑1 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 1:2543113/140‑1 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTCTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 1:2894199/140‑1 (MQ=255) aaTCGTATACCGGAGCTGCCCGGGCTTGAATTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAATT‑GGATGAAGATCGGTAGGTTATGCGTTAAGGGTGAGGCGGCGCTGTCTCATGCCCCTCAGTCCg < 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tCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAACTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 1:5144063/140‑1 (MQ=255) gTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAgg < 2:3423110/140‑1 (MQ=255) tatCGGAACTGACCGGGCTTGCCTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTACGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGGAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTa > 2:4685695/1‑140 (MQ=255) tatCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTTTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGtt > 1:1983309/1‑139 (MQ=255) gAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTGAGCCCGAAGGGTAGAggg > 2:4232410/1‑140 (MQ=255) gAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAggg > 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aCCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGc > 1:5168619/1‑140 (MQ=255) aCCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGc > 1:1096853/1‑140 (MQ=255) cGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGccc > 1:970527/1‑140 (MQ=255) aTTTGGGCAATTTTTATGACAGGTTGCTGCTGTATGTTGCGTTACAACT‑GGCTGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAAc > 1:2249787/1‑140 (MQ=255) aTTTGGGCAATTTTGATGACAGGCTGCTGCTGTATGTGGCGGTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGGGGGGACTGCCCGAATTAAc > 2:4988105/1‑140 (MQ=255) tGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGt < 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ggCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCa > 1:4073592/1‑140 (MQ=255) aaTTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGtt < 2:4003999/140‑1 (MQ=255) tgatgaCAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGa < 1:2476117/140‑1 (MQ=255) gTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTAcg > 2:3151984/1‑140 (MQ=255) tgctgcTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTAcgcg < 1:3487542/140‑1 (MQ=255) gctgctGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGt > 2:2379894/1‑140 (MQ=255) gctgTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAg < 1:3172183/140‑1 (MQ=255) tgGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCa > 2:1550339/1‑140 (MQ=255) gggCGTTACAACT‑GGATGAAGGGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTAATTCCGCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAAATAACCGTCAGTGCGGGATTATTTCCGCGTTAGTTTTTCCa > 2:4316484/2‑140 (MQ=255) ggCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAg > 1:3032083/1‑140 (MQ=255) ggCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGGCAGTTCGGGATTATTTACGCGGTAGTTTTTCCAg > 2:1250480/1‑140 (MQ=255) cGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt < 2:3758251/140‑1 (MQ=255) cGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 1:3755639/1‑140 (MQ=255) cGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 1:2000994/1‑140 (MQ=255) cGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 1:4842812/1‑140 (MQ=255) tACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGt < 1:434928/127‑1 (MQ=255) tACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCgg > 1:208884/1‑140 (MQ=255) tACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCgg > 1:3656027/1‑140 (MQ=255) tACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCgg > 2:2688911/1‑140 (MQ=255) cAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTGTTCCAGATCGGCt > 2:1366791/1‑140 (MQ=255) aaCT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCtt < 2:1022835/140‑1 (MQ=255) ggatGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGCTCGGCTTCAAt > 2:1984871/4‑140 (MQ=255) ggatGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAt > 1:4223096/4‑140 (MQ=255) ggatGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAt > 1:1728334/4‑140 (MQ=255) ggatGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAt > 2:1463403/4‑140 (MQ=255) tGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGGTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtctc > 2:4767372/1‑140 (MQ=255) agagCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGt > 1:1508352/1‑88 (MQ=255) agagCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCt < 1:3248917/140‑1 (MQ=255) gCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGCTTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAACCTCGCTGAt > 2:252593/1‑140 (MQ=255) gCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGAt > 2:809158/1‑140 (MQ=255) | CAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GG‑TGAAGAGCGGTAAGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGAT > NZ_CP025268/183315‑183583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |