Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 252,913 | G→A | A126T (GCA→ACA) | yafP → | GNAT family N‑acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 252,913 | 0 | G | A | 99.2% | 507.6 / NA | 134 | A126T (GCA→ACA) | yafP | GNAT family N‑acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (55/78); minor base C (0/1); total (55/79) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TGTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACA > NZ_CP025268/252776‑253048 | gTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAg < 1:626683/140‑1 (MQ=255) gTTATTTGTCGACCATGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTCATTAAGTCTGAATCCGCACTTACCGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAg < 2:4424530/140‑1 (MQ=255) ttATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGt > 1:4804063/1‑140 (MQ=255) ttATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGt > 1:4802880/1‑140 (MQ=255) ttATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGt > 1:1790221/1‑140 (MQ=255) aTTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATCACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTa > 2:2979276/1‑140 (MQ=255) aTTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATCACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTa > 2:2979313/1‑140 (MQ=255) aTTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACCGTTa > 2:2977996/1‑140 (MQ=255) aTTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTa > 2:670205/1‑140 (MQ=255) ttgttgACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAag < 1:1464723/140‑1 (MQ=255) ttgACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcag < 1:3129378/140‑1 (MQ=255) tgACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagc > 1:727410/1‑140 (MQ=255) gACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagca > 1:3763711/1‑140 (MQ=255) gACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagca < 2:2585735/140‑1 (MQ=255) gACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTGATGGTTTTCAGACAGTTAatcagca > 2:705044/1‑140 (MQ=255) aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagcag > 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1:1924109/1‑140 (MQ=255) gTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCGGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGa < 1:4824809/140‑1 (MQ=255) gCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGtt > 1:3501114/1‑140 (MQ=255) cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGGACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTa > 1:197550/1‑140 (MQ=255) cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTAc < 2:4636411/138‑1 (MQ=255) cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTAc > 1:4636411/1‑138 (MQ=255) cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTa < 1:5198338/140‑1 (MQ=255) cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTa > 1:1529488/1‑140 (MQ=255) gcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTaa < 1:837378/140‑1 (MQ=255) tttGTTAAAAACTTTGATTAAGACAGAATACGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGGAAAACTATTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGACGGGGAGCGTGGTTTACTAAtg > 2:1990023/1‑139 (MQ=255) tGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAAtttt > 1:704934/1‑140 (MQ=255) tGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAAtttt > 1:704965/1‑140 (MQ=255) 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ccGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgccc > 1:1216808/1‑140 (MQ=255) ccGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg > 1:492571/1‑137 (MQ=255) ccGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 2:492571/137‑1 (MQ=255) cGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcccg < 2:2666319/140‑1 (MQ=255) cAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGCTATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcccgcc < 1:1727975/140‑1 (MQ=255) aaaaCCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCt > 2:1840406/1‑140 (MQ=255) ttttttGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCATGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTAtct > 2:3097583/1‑138 (MQ=255) aaCGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGtt > 1:292826/1‑140 (MQ=255) tATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGGAGCGCGTTGGATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATTGGAGATATACACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAAGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTg < 2:1817892/140‑1 (MQ=255) tATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTg < 2:4444827/140‑1 (MQ=255) tATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTg < 1:3066249/140‑1 (MQ=255) aTGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGa < 1:3236940/140‑1 (MQ=255) tGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGAt < 2:4773893/140‑1 (MQ=255) tGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGAt < 2:4773917/140‑1 (MQ=255) ttttCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTcc < 1:2641568/140‑1 (MQ=255) ttCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCcac < 2:1256004/140‑1 (MQ=255) tCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCcaca > 1:372633/1‑140 (MQ=255) tCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCcaca < 2:197550/140‑1 (MQ=255) tCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCcaca < 2:1199741/140‑1 (MQ=255) tCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCcaca < 1:1206867/140‑1 (MQ=255) tCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCcaca < 2:766391/140‑1 (MQ=255) tCAGACAGTTAAGCAGCAGCCCGTTGAATTGCGGGGAGTCTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCAGGCTTGAAGTGAAGATAACGCCCCCCTGGTCTGTGCGCGGTTTCTGATTCcacc < 2:2020335/140‑2 (MQ=255) | TGTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACA > NZ_CP025268/252776‑253048 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |