Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,034,336 | A→G | S222S (TCA→TCG) | uacT → | urate/proton symporter UacT |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,034,336 | 0 | A | G | 99.7% | 996.2 / NA | 299 | S222S (TCA→TCG) | uacT | urate/proton symporter UacT |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (179/119); minor base T (0/1); total (179/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
CCGCAATATGGTAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCATGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAATCATCG > NZ_CP025268/3034199‑3034469 | aaTATGGTAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATATTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTACAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCCTTTTACTTTCGTGgatg < 1:1753321/140‑1 (MQ=255) ggTAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTTTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGatgaa < 1:2528781/140‑1 (MQ=255) gTAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGCATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGatgaat < 2:4627849/140‑1 (MQ=255) tAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGatgaatg > 1:280936/1‑140 (MQ=255) aTCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGAtgaatgaa > 1:260746/1‑140 (MQ=255) aTCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGAtgaatgaa < 2:1097837/140‑1 (MQ=255) tCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAg > 1:2875833/1‑140 (MQ=255) tCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAg > 1:707386/1‑140 (MQ=255) tttatttaGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAg < 1:4718636/135‑1 (MQ=255) tttatttaGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAAt > 1:3571799/1‑140 (MQ=255) tttatttaGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAAt > 1:4197821/1‑140 (MQ=255) tttatttaGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAAt > 1:5066932/1‑140 (MQ=255) tttatttaGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAAt > 1:74036/1‑140 (MQ=255) tttaGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTAt < 1:453058/140‑1 (MQ=255) ttaGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATc < 1:1493339/140‑1 (MQ=255) gTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGCTTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCggg > 2:2205957/1‑140 (MQ=255) gTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCggg > 2:808165/1‑140 (MQ=255) tcCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACa < 1:5199135/140‑1 (MQ=255) cTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatg < 2:2317586/140‑1 (MQ=255) cTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatg < 2:3503806/140‑1 (MQ=255) cTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatg < 2:58174/140‑1 (MQ=255) cTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatg < 1:107498/140‑1 (MQ=255) ttGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatgat > 2:2796916/1‑140 (MQ=255) tGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatgatg > 1:1276577/1‑140 (MQ=255) gCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGc < 2:4153011/140‑1 (MQ=255) tCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa < 2:889533/140‑1 (MQ=255) tCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa > 1:602718/1‑140 (MQ=255) tCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa > 1:3671946/1‑140 (MQ=255) tCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa < 2:2983551/140‑1 (MQ=255) tCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa > 2:2961138/1‑140 (MQ=255) tCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa > 1:64830/1‑140 (MQ=255) tCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa > 1:1660211/1‑140 (MQ=255) tCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa > 2:1373239/1‑140 (MQ=255) tCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa > 2:1196745/1‑140 (MQ=255) ttAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATg > 1:3462939/1‑140 (MQ=255) ttAAGTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATg > 2:4777400/1‑140 (MQ=255) tttATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGc < 1:305694/140‑1 (MQ=255) tATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATTTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATGTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCGTCAGGGTTTGCGa > 1:528073/1‑140 (MQ=255) tATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGa < 1:2142554/140‑1 (MQ=255) tATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGa < 2:76957/140‑1 (MQ=255) tATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGa < 1:3252224/140‑1 (MQ=255) ttGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGt < 2:4041088/140‑1 (MQ=255) ttACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCg < 2:233163/140‑1 (MQ=255) tACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGa > 2:1889868/1‑140 (MQ=255) gCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATCAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCg > 1:2896003/1‑140 (MQ=255) gCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTgg > 2:2395276/1‑140 (MQ=255) gCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTgg > 1:4378861/1‑140 (MQ=255) gCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTgg > 1:4254528/1‑140 (MQ=255) gCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTGGGCCCTTTAGTTTCGTGGATGATGAGTGAAGTCCATTTATCCGCGCTACATCATGCTTCATGAATTACGATCGTTACGCCGATGTCGTTTgg > 2:3418113/1‑140 (MQ=255) gATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCg > 2:504839/1‑140 (MQ=255) gATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCg > 2:3956827/1‑140 (MQ=255) gATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCg < 1:1953901/140‑1 (MQ=255) tttATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACGTGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATATCGTTTGGTATGCCGAt > 2:4971790/1‑140 (MQ=255) tttATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGAt > 1:271212/1‑140 (MQ=255) tttATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGAt > 2:3208942/1‑140 (MQ=255) tttATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGCATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGCTGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGAt > 1:3629177/1‑140 (MQ=255) cAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATc > 2:3874641/1‑140 (MQ=255) cAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATc > 1:2481486/1‑140 (MQ=255) cAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATc > 1:5011149/1‑140 (MQ=255) cAACGTCGCCGTATTACTGGGAATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGAGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATc > 2:2623310/1‑140 (MQ=255) cAACGTAGCCGTATTACCGGGGAGGGTATTTGGCTTTTTGCTTGCGTGGATGATGAATGGAGTCAATTTATCAGGGCTACATTATGATTCATGGTTTGCGATTGTTACGCTGACGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATc > 2:1247685/1‑140 (MQ=255) aaCGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCTGATTTTCGATcc < 2:5145734/140‑1 (MQ=255) aaCGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATcc < 2:470371/140‑1 (MQ=255) cGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGttt > 2:3283014/1‑140 (MQ=255) cGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGttt > 1:4574672/1‑140 (MQ=255) cGCCGTAGTACGGGGGGTTGTATGTGTCTTTTTACTTTCGGGGAGGAGGAATGAAGTCAAGTTATCTGGTCTACATGTTGCGTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGGTGTCGGTTGGTAGGTCGATTTTCGGTcgctgtt > 2:1636852/1‑134 (MQ=255) ccGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTcc > 1:1357535/1‑140 (MQ=255) tATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCAtt < 2:4740265/140‑1 (MQ=255) tATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCAtt < 2:4773325/140‑1 (MQ=255) tACTGGTGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTg < 1:3845254/140‑1 (MQ=255) tACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGGCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTg < 1:4408860/140‑1 (MQ=255) cTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGAc < 1:3133498/140‑1 (MQ=255) cTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGAc < 1:4900770/140‑1 (MQ=255) ggggATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatga < 2:4339177/66‑1 (MQ=255) gggATTTGATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAGTTTCTCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTAGGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCAt > 2:1997215/1‑140 (MQ=255) gggATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCAt < 2:260746/140‑1 (MQ=255) gggATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCAt > 2:1618478/1‑140 (MQ=255) gggATTGTATTTGGCTTGTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCAt > 2:2076915/1‑140 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACa > 2:253633/1‑60 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACa < 1:253633/60‑1 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATTATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGa > 1:2184922/1‑140 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTTACCATGa > 2:4320295/1‑140 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGa > 1:2061839/1‑140 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGa > 2:4484427/1‑140 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGa > 1:3512402/1‑140 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGa > 1:2678149/1‑140 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGa > 2:4858207/1‑140 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGCAGTCAATTTATCCGGGCTACATGCGGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTGTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTg > 2:3598008/1‑140 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCCAGTTCTCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTg < 1:2297523/140‑1 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGAc < 2:4242347/132‑1 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTg > 1:862341/1‑140 (MQ=255) tATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGcc < 2:2171255/140‑1 (MQ=255) aTTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCg < 2:689454/140‑1 (MQ=255) ttGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCgtg > 1:4104194/1‑140 (MQ=255) ggCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTg > 2:2359057/1‑133 (MQ=255) tttACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa < 1:3169809/55‑1 (MQ=255) tttACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa > 2:3169809/1‑55 (MQ=255) tttACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAatca > 1:985421/1‑140 (MQ=255) tttACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAatca > 1:3913122/1‑140 (MQ=255) ttccTTTCGTGGATGATGAATGCAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGAATGCCGTGTTAatcat < 2:1292701/137‑1 (MQ=255) | CCGCAATATGGTAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCATGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAATCATCG > NZ_CP025268/3034199‑3034469 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |