| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,396,984 | T→C | G331G (GGT→GGC) | nnr → | bifunctional ADP‑dependent NAD(P)H‑hydrate dehydratase/NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,396,984 | 0 | T | C | 99.7% | 1001.8 / NA | 308 | G331G (GGT→GGC) | nnr | bifunctional ADP‑dependent NAD(P)H‑hydrate dehydratase/NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (206/101); minor base G (0/1); total (206/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
AGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGTCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCATC > NZ_CP025268/4396849‑4397117 | aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 2:4173253/1‑140 (MQ=255) gTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCa < 1:4016381/140‑1 (MQ=255) aCTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAag < 1:467455/140‑1 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGTCTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 2:3980708/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 2:3398669/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 1:4992832/1‑140 (MQ=255) cGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTgggg > 2:2643696/1‑140 (MQ=255) cAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTgggggg > 2:2927309/1‑139 (MQ=255) cAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACGGACGATGGACTATCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGCGGTGAGTGGTCCGGGGCTGGGCTAGCAAGAGggggggg > 2:2244273/1‑139 (MQ=255) tGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGaaaa > 1:475589/1‑140 (MQ=255) acgtggcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGGGCACGCACTAACGATGTACTCTCCTACCGCCAGCCAGGCCTGGGCGGATGCGGCGGTGCTTGCTCCCCGTCTGGGCGACCAAGACCAGGGCAACAAAGCa < 2:3290907/135‑1 (MQ=255) ttGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTg > 1:190711/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:3668421/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:5151219/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:1856531/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACGGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:4885515/1‑140 (MQ=255) gccgcTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCaaa < 1:1789655/140‑1 (MQ=255) ccgcTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCaaaa < 1:2811701/140‑1 (MQ=255) cACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAtttt > 2:4089855/1‑140 (MQ=255) cACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAtttt > 2:774835/1‑140 (MQ=255) cACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAtttt > 1:3471958/1‑140 (MQ=255) gACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGGGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGc > 2:3453995/1‑140 (MQ=255) gACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGCAATGGGCCGACGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGGGGGGGGAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTGTCGc > 2:2911020/1‑140 (MQ=255) gAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAAcc > 1:1047004/1‑140 (MQ=255) gAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAAcc > 2:2423354/1‑140 (MQ=255) aTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGa < 1:3782876/140‑1 (MQ=255) tGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtg < 2:2342489/140‑1 (MQ=255) tGATGGTGCATGAACTGACGATAGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGAAAGAGTGGGGGCAAACAGCACTGCAAAAAGTTGTGAATGTTCGCAAACCGAtg < 2:2871176/140‑1 (MQ=255) tGATGGTGCATGAACTGAAGATGGACTCTCTTACTGAAAGCCTGGAATGGGCAGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGTGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAACTTTCGCAAACCGAtg < 2:1562565/140‑1 (MQ=255) tGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtgttg > 2:4171682/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:4801089/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 2:3043562/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:458845/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 2:3760731/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:2520783/1‑140 (MQ=255) cATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGATTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGa > 1:3697739/1‑140 (MQ=255) cATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGa > 2:4963320/1‑140 (MQ=255) cATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGa > 1:277379/1‑140 (MQ=255) tGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATg > 1:1493327/1‑140 (MQ=255) aCTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAACAGGAATGCAAAAAGTTGAGCATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCg > 2:4502181/1‑140 (MQ=255) aCTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCg < 2:1755301/140‑1 (MQ=255) aCTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCg < 2:2379156/140‑1 (MQ=255) aCTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCg < 1:3398669/140‑1 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 1:5137124/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 1:1158389/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 2:4236051/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 1:2906396/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 1:354417/1‑140 (MQ=255) gACGATAGACACTCTTACCGAGAGCCTGGAATGGGCGGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTTGGCCAGCAAGGGTGGGGGAAAAGAGCACTGCAAAAAGTTGAGGATTTTCGCAAAATGATGATGTGAGATGGCGATg > 2:2484719/1‑140 (MQ=255) aCGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCACGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTTCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGGTGTGTGATGCCGATGc > 2:4472996/1‑140 (MQ=255) cGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGTCCAGCAAGAGGGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTGGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCa > 2:1239733/1‑140 (MQ=255) tGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTg > 2:4369522/1‑140 (MQ=255) ggACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGa > 1:2790899/1‑140 (MQ=255) ggACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGa > 2:4579488/1‑140 (MQ=255) gACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGaa > 1:1959368/1‑140 (MQ=255) atctTACCGAAAGCCTGGAATCGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCCAGAGTAGGGGAAAAACGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTATCGCAAAACGATGTTGTGGGATGTCGATGCATGGAACctg > 2:4306896/2‑140 (MQ=255) tctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctgc > 2:1171027/1‑140 (MQ=255) ttcccGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGGGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctgctg < 2:695015/137‑1 (MQ=255) ttACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctgctg < 1:3969036/140‑1 (MQ=255) tgaCCGCAATCCTGGCATGGGCCGATGTGGTGGTGATGGGGGCCGGTCGGGTCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCGCTGCAAAAAGTTGAGAAGTTGCGCAAACCGATGTTGTGGGATTCCGATGCATTGAACctgctg < 2:1993353/138‑1 (MQ=255) ccGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGca > 1:746667/1‑140 (MQ=255) gAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaat < 1:419642/140‑1 (MQ=255) gAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaat < 1:1251738/140‑1 (MQ=255) gAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaat < 2:3936244/140‑1 (MQ=255) gAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaat < 2:2435916/140‑1 (MQ=255) aaaGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatc > 1:2412985/1‑140 (MQ=255) aaaGCCTGGAAGGGGCCGATGCGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGGGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatc > 2:3858613/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 1:4626580/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 1:3063715/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGGTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:1149289/1‑140 (MQ=255) gCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaat < 1:823039/140‑1 (MQ=255) gCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaat < 2:2496026/140‑1 (MQ=255) ccTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCaatcaatc > 2:1872725/1‑140 (MQ=255) gAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGa > 2:2110172/1‑140 (MQ=255) aTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGTAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 1:2142251/140‑1 (MQ=255) ggCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGc > 2:90050/1‑140 (MQ=255) ggCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGc > 2:5070112/1‑140 (MQ=255) gCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCg > 1:4367043/1‑140 (MQ=255) gCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCg > 1:4145567/1‑140 (MQ=255) gCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCg > 1:358384/1‑140 (MQ=255) cGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTc < 1:633889/140‑1 (MQ=255) ggtggtggtgATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcaca < 2:624886/139‑1 (MQ=255) gtggtgATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATcg > 1:909815/1‑140 (MQ=255) gtggtgATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAGGGTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAGTCAATCCCGAGAAGCGGCACAATcg > 2:4598863/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAGGGGTGGGGGAAAAAAGCTCTGCAAAAAGGTGAGAATTTTCGCAAACCGATTTTGTGGGGTGCCGATGCATGGAACCTGCTGTCAATCAATCCCGAGGAGCGTCACAATCGCATGAt > 2:1374994/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAt > 1:640090/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAt > 1:3390709/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGCCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGCTGCATTGAACCTGCTGCCGATCGATCCCGCTAAGCGTCACAAACGCGTGAt > 2:4321915/1‑140 (MQ=255) tGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGTAAAAAAGCACTGCAAAAAGTCGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCa > 1:3117875/1‑140 (MQ=255) tGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATTCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCa > 1:2652936/1‑140 (MQ=255) tGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCa > 1:1277597/1‑140 (MQ=255) tGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAACCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCa < 2:4801089/140‑1 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcg < 1:330573/140‑1 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcg > 1:566340/1‑140 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcg > 2:168486/1‑140 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAGCAcg > 1:1428702/1‑140 (MQ=255) cccGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgcc < 2:1231685/140‑1 (MQ=255) cccGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgcc < 2:1442126/140‑1 (MQ=255) gTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCAt > 1:5075593/1‑140 (MQ=255) gTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCAt > 1:224529/1‑140 (MQ=255) | AGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGTCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCATC > NZ_CP025268/4396849‑4397117 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |