Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 939,446 | (A)7→8 | intergenic (‑289/‑255) | trxB ← / → lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 939,439 | 1 | . | A | 95.2% | 841.8 / 27.9 | 231 | intergenic (‑282/‑262) | trxB/lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/6); new base A (79/139); total (84/147) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.37e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTC > NZ_CP025268/939300‑939572 | ctGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag > 2:4446109/1‑140 (MQ=255) ctGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag > 1:2255075/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGGCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATATTGTACTAAGAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTATGCGAAAACAGTCGAGgaag‑‑a > 2:3910896/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGCGgaag‑‑a > 1:3768194/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑‑a > 1:3979043/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑‑a > 1:1567030/1‑140 (MQ=255) cTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a > 1:4081838/1‑140 (MQ=255) cTACTTAAATTTCCCGCATTATCATCCGATTAAATGATGAAACAACACCCCTGTTAATGAATATCTGGCATATTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGCAG‑‑aa‑a > 2:4561678/1‑140 (MQ=255) aCTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aa < 1:1293061/140‑1 (MQ=255) cTTAAATTTCCCGCATTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCAGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa > 2:2052479/1‑140 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTCTAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAGAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aa > 2:3740166/1‑139 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aaca < 2:4060650/140‑4 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aaca < 1:3030039/140‑4 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aaca < 1:2635261/140‑4 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aaca < 1:5244944/140‑4 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aaca < 2:5203830/140‑4 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aaca < 1:73986/140‑4 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCAGGTTGCACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aaca < 2:4933540/140‑4 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aacagt < 1:267368/140‑6 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aacagt < 1:4996825/140‑6 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aacagt < 1:4871323/140‑6 (MQ=255) tttCCCGCGTTATAAGACGATTAAATGATGAATAAACGCCCATGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa‑aacagt < 2:333564/140‑6 (MQ=255) ccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTc > 1:1064727/1‑140 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTtat < 2:2718432/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTtat < 1:468029/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTtat < 1:1924898/140‑1 (MQ=255) tataAGCCGATTCAATGATTAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTatat < 2:626399/140‑1 (MQ=255) tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTGGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTatat < 1:4791151/140‑1 (MQ=255) gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCa < 1:2276905/140‑1 (MQ=255) gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATaa > 2:4705139/1‑140 (MQ=255) aTTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGCTGTCTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAAc > 1:3800245/1‑140 (MQ=255) aaTGATGAATCAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑A‑AAA‑ACCAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:3920593/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATTAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:678315/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:3122022/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:1447847/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:2802890/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:2427770/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:4131510/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:3389090/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:3665866/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACCAAAAATCGATGGTATGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:4432717/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTATAATAAAAATAGATGTTTTGCTTTAACAATCCACTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:1680001/140‑1 (MQ=255) aaTGATCAATAACCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:3424169/140‑1 (MQ=255) tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGATTATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgca < 2:1912536/140‑1 (MQ=255) tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgca < 2:2263028/140‑1 (MQ=255) aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTaa > 1:3250528/1‑140 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 1:3830477/140‑1 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 1:1066383/140‑1 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 1:2491383/140‑1 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 2:5022049/140‑1 (MQ=255) ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTtat < 2:1995812/108‑1 (MQ=255) ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTtat > 1:1995812/1‑108 (MQ=255) tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa > 1:2304087/1‑140 (MQ=255) aaTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGt < 2:4437630/140‑1 (MQ=255) aaTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg < 2:2971057/140‑1 (MQ=255) aTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg < 2:16088/140‑1 (MQ=255) aTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg > 1:3060447/1‑140 (MQ=255) gAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCt > 1:1233772/1‑140 (MQ=255) tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGTTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑A‑AAACA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTatt > 1:987852/1‑138 (MQ=255) tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑A‑AAA‑A‑CATTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCTTGCAAg > 2:2589544/1‑140 (MQ=255) tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt > 2:5145992/1‑140 (MQ=255) tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 2:4210905/140‑1 (MQ=255) atCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCCGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATGCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTg > 1:2412781/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATACCCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:1816950/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:3519272/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:3234236/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 2:3114115/1‑140 (MQ=255) tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 2:3465510/140‑1 (MQ=255) ggCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAAt < 2:2372735/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAACATCGATGTTTTGCTTTGACAAGCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:2844087/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:1885172/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:4389971/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:1414160/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:2146519/140‑1 (MQ=255) tggtACTAAAAATCGATGTTTTGTTTTGACAGTAATCTGGGGGTGTGCGTAAACATTTGAGGGAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑AAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGTATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt > 2:4815519/3‑140 (MQ=255) gtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAt < 1:1455612/140‑1 (MQ=255) cTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGc > 2:3258546/1‑140 (MQ=255) cTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGc < 2:2294317/140‑1 (MQ=255) cTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGc > 2:3852198/1‑140 (MQ=255) aaaaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTg > 2:4602890/1‑140 (MQ=255) aTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCGTGGTGTTTTGCGAAAACATTCTCGGAAG‑‑AAGA‑GAA‑A‑CAGTATTCTGATATGGGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTCACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAc > 2:1033547/1‑140 (MQ=255) cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:1820710/87‑1 (MQ=255) gTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGc < 1:4615123/140‑1 (MQ=255) ttGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTg < 2:2001795/140‑1 (MQ=255) aTCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCg < 1:2603571/140‑1 (MQ=255) ccccTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGAt < 1:5145992/140‑1 (MQ=255) ccTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTc < 2:3788497/135‑1 (MQ=255) ccTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTc > 1:3788324/1‑135 (MQ=255) ccTGGTGTTGTGCGAGATCATGGGAAGAAG‑‑AA‑AGACA‑A‑CAGTATGATTATGTGCGCAGAACCATGCATGTATGTCCCATGTTTCCCGGCCTAGTGAAATCTCCGCATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAg < 2:2503656/140‑1 (MQ=255) cTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGc < 1:1654383/140‑1 (MQ=255) ggTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTg > 2:2771641/1‑140 (MQ=255) ttttGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCcac > 1:816930/1‑140 (MQ=255) ttGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACaa > 2:930200/1‑140 (MQ=255) ttGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACaa > 2:1523311/1‑140 (MQ=255) aaaCATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAAc < 2:3604420/140‑1 (MQ=255) aaaCATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCAACAAGGCAAc > 2:1301614/1‑140 (MQ=255) aaCATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACg < 1:897759/140‑1 (MQ=255) cGAGGAAG‑‑AA‑A‑AAA‑ACCAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAACACTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATCGCTGCCACAAGGCAACGGtcttc < 2:2897558/140‑1 (MQ=255) gAGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTCTATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGtcttct < 2:1402068/140‑1 (MQ=255) aGGAAGA‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTtctc < 1:2223682/140‑1 (MQ=255) | CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑A‑AAA‑A‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTC > NZ_CP025268/939300‑939572 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |