| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,013,520 | +G | pseudogene (463/542 nt) | zapC → | cell division protein ZapC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 97.2% | 927.4 / 16.5 | 284 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (7/1); new base G (147/128); total (155/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.50e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 | tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑g > 1:1028703/1‑140 (MQ=255)tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑g > 1:2107226/1‑140 (MQ=255) gggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATTCCGCACTATGCCTTCTGGCACAACCCTGCTTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcg > 1:2895189/1‑137 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCCGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcga < 1:3202544/140‑5 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGGTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGGTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcga > 2:2740704/1‑136 (MQ=255) cGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACg > 1:4749500/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTGCGGTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCa > 1:5283371/1‑140 (MQ=255) cGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCAtt > 1:2344102/1‑140 (MQ=255) ccTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTaaa > 2:585535/1‑140 (MQ=255) tGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAAt > 2:3588421/1‑140 (MQ=255) gTTTGGTTGCGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCAt < 2:720276/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:3765766/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:3653825/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:1633053/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:3420285/140‑1 (MQ=255) tGAGCGATCCACACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAACTGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGAc > 2:4176266/1‑140 (MQ=255) tGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGAc < 1:5228775/140‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg < 1:1050211/140‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:3123769/1‑140 (MQ=255) cGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCTCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGGCGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGc > 2:360729/1‑140 (MQ=255) tACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGa > 1:991562/1‑140 (MQ=255) cTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGaaa > 1:457149/1‑140 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:4984288/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg > 1:4262286/1‑140 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg > 1:3490767/1‑140 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 1:4141488/140‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGTCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTCAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:199184/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:2574544/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:3154847/1‑140 (MQ=255) ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTa > 2:1597143/1‑140 (MQ=255) ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTa > 1:2537174/1‑140 (MQ=255) ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTa > 1:1243747/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 2:2274510/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:66121/1‑140 (MQ=255) ccctttGCTGGTCGTTTAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGACTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATCGCGTGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAACCCGCAGGTTAATg < 2:195554/137‑1 (MQ=255) tttGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTg < 1:2784272/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 2:3129991/140‑1 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGTAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 1:2968105/140‑1 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAATTCATGAACGACAGGATGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 1:727374/140‑1 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 1:3853228/140‑1 (MQ=255) ttGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGc < 2:3943955/140‑1 (MQ=255) ttGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGc < 1:1526752/140‑1 (MQ=255) aTCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCg < 2:64956/140‑1 (MQ=255) tCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGa < 1:5059200/140‑1 (MQ=255) gCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAg < 2:154046/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 2:2144694/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:1344882/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:2722426/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTGGGGCGACGACATTAAAATCATGAACGACAGGATGAAACCGTAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa < 1:4419053/140‑1 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg > 1:800251/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg > 2:4860752/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGCCGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:4642944/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGcc > 2:2431874/1‑139 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 1:1184012/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 1:1828160/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCGGAAACCGCAGGTTAATGGTGACAGCTTCAGGCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:3025402/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGGCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTGAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:11263/1‑140 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:4002826/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:1699053/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:1830068/140‑1 (MQ=255) caACCCGGCGGTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTGAAATCATGAACGACAGGGTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCGTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt > 2:1384338/1‑140 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 2:5012719/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 2:4117525/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 1:1023749/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 1:2460227/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 1:5086633/1‑140 (MQ=255) ccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGACACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCCGTCTCACGCGCCACCTTAAGTGCAGTCTTc > 2:3993567/1‑140 (MQ=255) tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg < 2:2883866/140‑1 (MQ=255) gCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACCGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGGCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGt > 2:3005053/1‑140 (MQ=255) ggttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 2:852006/139‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAAGCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGGAGTCTTCGGTa > 2:2791913/1‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 2:3730598/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa > 2:5328419/1‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa > 2:952796/1‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 2:2572523/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTCAAGTGCAGTCTTCGGTa > 2:1227895/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTGGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACCCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACGGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTACCGCGCCAACTTAAGTGCAGACTTCGGTACACAg > 2:4552363/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAACTCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGTCTCGAACTGGCAGTCTAACGCGCCAGCTTAAGTGCAGTCTTCGGTAcacac > 1:4873314/1‑139 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg < 2:3491829/133‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:2100027/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:4194674/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:54334/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:1700722/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAAACGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCATCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:3545112/1‑140 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATGATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc > 1:3933116/1‑140 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 1:3938065/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGGTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:4765606/140‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:1731010/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 2:1135675/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 1:863916/140‑1 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:2669671/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 2:3621917/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 2:922159/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:188928/1‑140 (MQ=255) cgcgcgATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAg > 1:1484705/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCAGGTT‑GCCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTTACAGCTTCATCCTCTAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAATTGCAGTCTTCGTTACACAGCTACAGCAAAGaa > 2:3229156/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa < 1:3621917/140‑1 (MQ=255) cgcgATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 1:3322464/1‑140 (MQ=255) cgATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATg > 1:3509251/1‑140 (MQ=255) gCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGc < 1:2751330/140‑1 (MQ=255) | TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |