Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,146,507 | +T | pseudogene (1028/1643 nt) | flgK → | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,146,507 | 1 | . | T | 98.9% | 959.3 / 1.2 | 264 | pseudogene (1028/1643 nt) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/2); new base T (121/139); total (123/141) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
ACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑G‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGAT > NZ_CP025268/1146368‑1146639 | cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gt < 1:3446962/140‑2 (MQ=255) cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gt < 1:1254545/140‑2 (MQ=255) cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gt < 2:5091239/140‑2 (MQ=255) gCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gtg < 1:1063946/140‑3 (MQ=255) gCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gtg < 1:3973554/140‑3 (MQ=255) cTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gtga > 1:3726192/1‑137 (MQ=255) ttGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gtgac > 1:2911038/1‑136 (MQ=255) ggACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCGCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGt > 2:4032655/1‑140 (MQ=255) ggACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGt > 2:5189269/1‑140 (MQ=255) aaCTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCg < 1:2446786/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACCCAAAGCCGGATTTGATGCTAACGTCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt > 1:160411/1‑140 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAAAG‑T‑GACGTTGCGAt > 2:4591559/1‑140 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 2:2310638/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 2:1798638/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt > 2:1731497/1‑140 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 1:82183/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 1:4313363/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 1:4247185/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 2:811225/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 1:2183098/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATCTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCAGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGCTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 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cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGAGGTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTGCTGGAAGACACGAAAAAC‑CAAG‑GTGACGTTTCGATCGGt > 1:2479546/1‑140 (MQ=255) cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGc < 2:3957867/140‑1 (MQ=255) cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGc > 2:1965724/1‑140 (MQ=255) tGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGcc < 1:1727245/140‑1 (MQ=255) ggCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGGGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCGCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCa > 1:4932764/1‑140 (MQ=255) gCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCAc > 1:313571/1‑140 (MQ=255) ccctttGCGCAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTTCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCAc < 2:4388028/137‑1 (MQ=255) aTTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACgg < 2:1087011/140‑1 (MQ=255) aTTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACgg < 1:5268892/140‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTaa > 2:2652014/1‑140 (MQ=255) gAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGa < 1:3647968/140‑1 (MQ=255) aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAt > 1:1009826/1‑140 (MQ=255) aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAt > 1:488781/1‑140 (MQ=255) aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCAGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACGGAt > 2:2112648/1‑140 (MQ=255) gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 2:2593633/140‑1 (MQ=255) gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 2:2847903/140‑1 (MQ=255) gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 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cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:3471174/140‑1 (MQ=255) cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:4406910/140‑1 (MQ=255) cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGATTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:3905310/140‑1 (MQ=255) ccAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTAGCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAACC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGACGCCTCCGCGGTAc > 2:4916897/1‑140 (MQ=255) aaCACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTGTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTg > 1:2775716/1‑140 (MQ=255) aaCACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTg > 1:3303647/1‑140 (MQ=255) aaCACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTg > 2:3425514/1‑140 (MQ=255) acacAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTgg > 1:2811278/1‑140 (MQ=255) caAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGa < 1:1303457/140‑1 (MQ=255) caAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGa < 1:110981/140‑1 (MQ=255) aaaGCCGGATTTGGTGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACCTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGAc > 2:2778853/1‑140 (MQ=255) 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< 1:577619/140‑1 (MQ=255) aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:674419/140‑1 (MQ=255) aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTGCCTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTAGCGATCGGTGCAACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGAAAGATTACAAAATATCGtt < 2:4213424/140‑1 (MQ=255) aaCGGCGAGGCCGGTGAAGATTTCTTTCCTTTTGCTACGCCCGCGGTTCTGCACGCCACGACAAAC‑AAAG‑GTGACGCTGAGATCGCTGCCACGGTACCTGATCCCTCCGCGGTACTGGCGACCGATTAAAACATCCCGtt < 2:4148506/140‑1 (MQ=255) aaCGGAGAGGCCGGTGAAGAGTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 2:1596062/140‑1 (MQ=255) gCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGat > 2:4262132/1‑140 (MQ=255) gATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGataa < 2:1470937/140‑1 (MQ=255) aaGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTgg < 1:1559438/140‑1 (MQ=255) gATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCa < 2:302888/140‑1 (MQ=255) tGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCAccc > 1:4718784/1‑140 (MQ=255) cTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGc > 2:3089327/1‑140 (MQ=255) tCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACCCGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAGCGGTGCCACTTTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAAGCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGGCAccgtactt > 2:1692543/1‑134 (MQ=255) tCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGACAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCtt < 1:2237842/140‑1 (MQ=255) ggTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGc < 2:4828873/140‑1 (MQ=255) gTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGcc < 2:4718784/140‑1 (MQ=255) aaGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAg < 1:4846556/140‑1 (MQ=255) ctcgcgGTTCTGCAAAACACGAAAAAT‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGCGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCTGTCGATAATAATCAGTGGCAGTGCACCCGCCTTTCCAGCaa > 2:1162260/3‑140 (MQ=255) cccGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCaa > 2:1343143/1‑140 (MQ=255) gcgGTTCTGCAAACCACGAAAAAC‑AAAGCC‑GACGTTGCGATCGCTGCCACGGTACCTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 2:1206776/140‑1 (MQ=255) gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 1:5139960/140‑1 (MQ=255) gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 2:5118454/140‑1 (MQ=255) gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc > 1:2303994/1‑140 (MQ=255) gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 2:3303647/140‑1 (MQ=255) cacGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGa > 1:1330217/1‑140 (MQ=255) cacGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGa > 2:1297648/1‑140 (MQ=255) cacGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGa > 1:4537490/1‑140 (MQ=255) cacGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGa > 2:1066122/1‑140 (MQ=255) cacGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGa > 2:3499596/1‑140 (MQ=255) gAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGc > 2:4965827/1‑140 (MQ=255) aC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGAt < 2:2038264/140‑1 (MQ=255) | ACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑G‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGAT > NZ_CP025268/1146368‑1146639 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |