| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,449,793 | +T | pseudogene (3757/3779 nt) | tamB → | autotransporter assembly complex protein TamB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,449,791 | 1 | . | T | 97.7% | 1764.2 / 22.9 | 474 | pseudogene (3755/3779 nt) | tamB | autotransporter assembly complex protein TamB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/8); new base T (259/202); total (263/211) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.90e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 508 total aligned reads displayed.
GTCAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTA > NZ_CP025268/4449652‑4449924 | gTCAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGa > 2:3145093/1‑140 (MQ=255)gTCAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGa > 1:2465577/1‑140 (MQ=255)gTCAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGa > 1:1936495/1‑140 (MQ=255) tCAGCCGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑t < 2:5144948/140‑1 (MQ=255) gCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑tttg > 2:4105689/1‑138 (MQ=255) cGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑tttgg > 1:6122/1‑137 (MQ=255) aTGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTAt < 2:2895598/140‑1 (MQ=255) aTGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTAt > 2:171777/1‑140 (MQ=255) ttGCCATGTCTGCAAGTTAAATACGGCGCGGGTCTATTAGACTCTATAGCTACACTCATGTTACGATATCTCTTGATGTCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTACAGACGACGCACCAGAGTT‑GCTCTTTCAGtt > 2:4737552/1‑140 (MQ=255) ttGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGtt > 2:627787/1‑140 (MQ=255) ttGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGtt < 1:3087898/140‑1 (MQ=255) tGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTc > 1:3623807/1‑140 (MQ=255) gCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGGGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCg > 2:3026348/1‑140 (MQ=255) ccAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGa > 1:2534643/1‑140 (MQ=255) ggTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGtt > 1:1846535/1‑140 (MQ=255) ggTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACAATCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTGCGAGtt > 2:3467327/1‑140 (MQ=255) tCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCCGTTCGAGcttt > 2:1058360/1‑140 (MQ=255) tCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGtttt > 1:2209894/1‑140 (MQ=255) gCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTagc < 2:5055527/140‑3 (MQ=255) gAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCg < 2:4336783/140‑1 (MQ=255) gAAATACGGCGTGGGTATATTGGACTCTATAGCAACACTCACGTTGCGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGGGTCTGGTGTAGACGAGTCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTGGAGTTTTAGCAAAGCg > 2:1356871/1‑140 (MQ=255) aaaTACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGa > 2:321852/1‑140 (MQ=255) aaaTACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGGCTCTATCAGGTCGAGGTTTAGCAATGctg > 2:4463462/1‑138 (MQ=255) aaaTACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGGTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGa > 1:4845462/1‑140 (MQ=255) tataTTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTCAGCTATATCTGGAACCCGTGTCTGGTGTAGCCCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCAAGTCTTTGCAATGCGAATATTTGTCTACgg < 1:3196540/140‑1 (MQ=255) tGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGttt < 1:1369132/140‑1 (MQ=255) tGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGttt < 1:5044821/140‑1 (MQ=255) gACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTa > 1:2877107/1‑140 (MQ=255) gACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTa < 2:789602/140‑1 (MQ=255) aCTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTAc > 2:5186285/1‑140 (MQ=255) ctctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACg > 2:3841921/1‑140 (MQ=255) ctctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTATCTACGGCAGTTTACg > 1:2966172/1‑140 (MQ=255) tctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGc > 2:164505/1‑140 (MQ=255) tctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGc > 1:5194664/1‑140 (MQ=255) ctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGcc < 2:497445/140‑1 (MQ=255) tataGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCca < 1:2835693/140‑1 (MQ=255) taGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCcaca > 2:1468699/1‑140 (MQ=255) gCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGACGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGCATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCacaaa < 1:2115515/140‑1 (MQ=255) gCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCacaaa < 1:1040944/140‑1 (MQ=255) cacTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAg > 1:1331465/1‑140 (MQ=255) cacTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAg > 1:477370/1‑140 (MQ=255) cacTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAg > 1:3921670/1‑140 (MQ=255) cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 2:4259552/1‑140 (MQ=255) cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTGAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 1:191050/1‑140 (MQ=255) cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 2:879239/140‑1 (MQ=255) cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa > 1:1120690/1‑140 (MQ=255) cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 2:2599127/140‑1 (MQ=255) ttacgttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGt < 1:1616870/140‑1 (MQ=255) tacgttaTCGCCTGATGCCTACGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCCGGCGCTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTATACGCCACAAACAAGGCAACAGTc < 1:4463462/140‑1 (MQ=255) tacgttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTc < 1:508103/140‑1 (MQ=255) ttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTg > 1:4207/1‑140 (MQ=255) ttaCCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTTTCTACGGCAGGTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTg > 2:2012034/1‑140 (MQ=255) aTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGa > 1:2234518/1‑140 (MQ=255) cGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATg > 1:3802505/1‑140 (MQ=255) gATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCaa < 1:1723450/140‑1 (MQ=255) gATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCaa < 1:40957/140‑1 (MQ=255) aTGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAAt > 2:2319376/1‑140 (MQ=255) aTGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAAt > 1:3511217/1‑140 (MQ=255) ccTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGcc < 1:1453408/140‑1 (MQ=255) ccTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGcc < 1:4365324/140‑1 (MQ=255) ccTAAGCTATATCGTGAAGCCGTGTCTGGTGTAGAACAGGAAATGGATTT‑GATCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGAGAATATTTGTCTACGCCAGTTTAGGACACAAACAGGGCAACAGTCACTGGATGACCATTGcc < 2:4911276/140‑1 (MQ=255) aGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGt > 1:912549/1‑140 (MQ=255) atatCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACt > 1:5301142/1‑140 (MQ=255) tatCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTg > 1:3407912/1‑140 (MQ=255) tatCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTg > 1:1226664/1‑140 (MQ=255) ttGGAATCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTAGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGc < 2:3520317/139‑1 (MQ=255) ggAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑CCTCTATAAGTTCGAGTTAGAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGATTACGCCACATACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCGAGTTACTGGGCGa > 2:4621153/1‑140 (MQ=255) gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAt > 1:2354626/1‑140 (MQ=255) aaGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAtt > 1:464110/1‑140 (MQ=255) aaGCCCTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTCGATGACCAATCCCCAGTTACTGGGCGAtt > 2:2703256/1‑140 (MQ=255) ccGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCa < 1:1009593/140‑1 (MQ=255) ccGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACAAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCa > 1:3986376/1‑140 (MQ=255) cGTGTCTGGTGTGGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAg > 2:5297227/1‑140 (MQ=255) cGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGCGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGCTGACCAATGCCCAGTCACTCGGCGATTCCac > 2:1213744/1‑139 (MQ=255) cGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAg > 2:364368/1‑140 (MQ=255) tgtCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTa > 1:3261886/1‑140 (MQ=255) gtgtAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATa < 2:2355558/140‑1 (MQ=255) tgtAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATaa > 2:2142482/1‑140 (MQ=255) tAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCCGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCCCTGTATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 2:4270222/140‑1 (MQ=255) tAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 2:2270058/140‑1 (MQ=255) tAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 2:734983/140‑1 (MQ=255) tAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 1:3856605/140‑1 (MQ=255) tAGACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 1:2621141/140‑1 (MQ=255) gACCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAc < 1:2026139/140‑1 (MQ=255) aCCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGt < 1:4412571/88‑1 (MQ=255) aCCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAcc > 1:797978/1‑140 (MQ=255) aCCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAcc > 2:1013276/1‑140 (MQ=255) aCCAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAc < 2:3705663/139‑1 (MQ=255) ccAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCa < 1:732686/140‑1 (MQ=255) ccAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCa < 1:228933/140‑1 (MQ=255) ccAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCa < 1:2674321/140‑1 (MQ=255) ccAGGCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCa < 2:252912/140‑1 (MQ=255) ggCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAGCTACCAGtt > 1:1141956/1‑140 (MQ=255) ggCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGtt > 1:866356/1‑140 (MQ=255) ggCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGtt > 1:2736749/1‑140 (MQ=255) ggCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGtt > 1:4309755/1‑140 (MQ=255) gCACTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTg > 2:1905880/1‑140 (MQ=255) aCTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGta > 2:2812750/1‑140 (MQ=255) aCTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGta < 2:2234518/140‑1 (MQ=255) aCTGGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGATTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGAACAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGta < 2:3929289/140‑1 (MQ=255) | GTCAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTA > NZ_CP025268/4449652‑4449924 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |