| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | 1292725 = | 358 (1.150) | 159 (0.600) | 56/234 | 1.2 | 47.0% | intergenic (+182/+2) | narI/CXP41_RS06830 | respiratory nitrate reductase subunit gamma/RtT sRNA |
| ? | NZ_CP025268 | = 1293258 | 56 (0.210) | intergenic (‑44/+3) | CXP41_RS06840/CXP41_RS06845 | RtT sRNA/tRNA‑Tyr | |||||
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
CGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGG > NZ_CP025268/1293120‑1293391 | ggccgtCGGGTCGTTGCCTGCGGCAAAGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGa < 2:422345/135‑1 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTga < 2:4293716‑M2/140‑3 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTga > 1:142819‑M2/1‑138 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTga > 1:965747‑M2/1‑138 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCACATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTga < 1:4451823‑M2/140‑3 (MQ=255) ccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatg > 1:2999949‑M2/1‑136 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggt > 1:3358083‑M2/1‑131 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggt > 2:4895769‑M2/1‑131 (MQ=255) tCGCTGCCGGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGTGACTTTTGAAAGTgatggtggtggg > 2:2012982‑M2/1‑128 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:1033309‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:5337503‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:2222352‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:4016917‑M2/1‑126 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaa > 1:2755273‑M2/1‑124 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 1:4748739‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCAGAATATTTGAATGCGGTTTCGCGTGGG‑GGTACAGGTGTTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:5048250/140‑1 (MQ=11) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 1:4217107‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 2:3584322‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 1:4184561‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 1:1335518‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 1:3929357‑M2/1‑121 (MQ=255) cGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggatta < 1:4549742‑M2/140‑23 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattact > 1:4349306‑M2/1‑116 (MQ=255) cAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactc < 1:1316614‑M2/140‑26 (MQ=255) aCGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcag > 1:1187389‑M2/1‑113 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagc < 1:2045618‑M2/140‑29 (MQ=255) ctctctCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGGG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgc < 2:3013390‑M2/140‑31 (MQ=255) ttgcgcGCTGGCGCCAGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCCTCCTTCCCCGCATGGGCAGAAGATTTAATTGGGGATTCGTAGGAG‑GGTTTAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg < 2:1802806/135‑1 (MQ=11) ctctcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGGCTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctg > 2:1625520‑M2/1‑108 (MQ=255) cctcgCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATACCTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGCAGGTgaaggtggtgggggaaggattactcagcgctgc > 2:3412490‑M2/2‑107 (MQ=255) cGCTGGCGCTTGAGCCGAACCTTAGTCGTAGCTTCTCCTCCTTACCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCCGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcg > 2:4365778‑M2/1‑104 (MQ=255) cGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGGgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcg > 2:2430848‑M2/1‑104 (MQ=255) cTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgct < 1:5239390‑M2/140‑39 (MQ=255) tgacgctcgAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGACAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgctt > 1:2868057‑M2/4‑101 (MQ=255) gacgctcGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattagtcagcgctgcgcgcttc < 2:4581190‑M2/138‑41 (MQ=255) cgcTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAG‑AGTTCAGGGGCTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattagtcagcgctgcgcggttcgc < 2:3512032‑M2/140‑43 (MQ=255) gcTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctacgctcttgacg < 2:3332027‑M2/140‑44 (MQ=255) cggctcGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTAATTGCGGAGTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGGCAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGGTTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 2:2765796/135‑1 (MQ=11) cGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCCGGGACTTTTGAAAGTgatggttgtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgccctt > 2:2219449‑M2/1‑94 (MQ=255) gAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAGATTTGATTGCGGATTCGCTGGGG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTa < 2:4518488/140‑1 (MQ=18) aaCCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcg > 1:2002130‑M2/1‑87 (MQ=255) agtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcct < 1:2907985‑M2/138‑60 (MQ=255) gAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcatttcaccctaggggtcgttgcctgttg < 2:3786238‑M2/140‑64 (MQ=255) gCTTCTCCTCCTTCCCCGCATGGGCAGAGTATTTGATTGCGGATTCGTTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaa > 2:1648516‑M2/1‑74 (MQ=255) ttCTCATCCTTGGCTGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGCCTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcggatcgttgcctgcggcaacg > 2:2795756‑M2/1‑72 (MQ=255) ccTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctc < 2:1682250‑M2/140‑76 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattagtaagcgctgagcccttggccgctggggtcgaggcctgccgcaacgctccctttc < 2:531678‑M2/140‑78 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgc < 1:4854777‑M2/140‑78 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgtgtcgttgcctgcggcaacgctctctcgct < 1:4586330‑M2/140‑79 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGGTTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcactcttcgggtcgttgactgcggcaacgctctctcgctg < 2:3278410‑M2/140‑80 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctg < 1:2688941‑M2/140‑80 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctg < 1:1672464‑M2/140‑80 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctg < 2:650575‑M2/140‑80 (MQ=255) cccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctgg < 1:3551266‑M2/140‑81 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggc < 1:1043759‑M2/140‑82 (MQ=255) gCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgc < 1:3486011‑M2/140‑84 (MQ=255) cATGGGCAGAAGATTTGATTGCGGAGTCGCATGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgct > 2:2895081‑M2/1‑56 (MQ=255) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagt > 2:1107333‑M2/1‑51 (MQ=255) cAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtc < 1:3655031‑M2/140‑91 (MQ=255) aaTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaa < 1:849497‑M2/140‑94 (MQ=255) ttGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttg < 2:2086008‑M2/140‑99 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGTGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 1:1518581‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggttggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 2:4717001‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 2:1472355‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 1:5300437‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga > 1:2339168‑M2/1‑37 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGCgatgggggtgggggaaggattactcagcgcggcgcgcttggccattcgggtcgtttcctgcggccaggctctctcgcgggcgctcgagtcgaaacttggtcga < 2:2295451‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGACGACGGCAGATTTACAGGCTGCTTCCTTTGGCCTGGCGGGGCCCCCAGCAGGGGTAATTCaaaat > 2:4465106/1‑138 (MQ=18) gCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaa > 1:650575‑M2/1‑36 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaag < 2:2526504‑M2/140‑106 (MQ=255) cgttgggg‑agTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTa < 2:2277900/133‑1 (MQ=255) gCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctca > 1:4498730‑M2/1‑28 (MQ=255) gttgggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTaa < 1:5026028/133‑1 (MQ=255) ggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 1:88499/137‑1 (MQ=255) gaatttCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCtt < 1:507107/136‑1 (MQ=255) aagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTg < 1:3739842/139‑1 (MQ=255) gTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAGGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGGAGCGCGGGAACCCCACCAGGGGGAATTCATATTTAGAGGGAATgagcgca > 2:4082725/1‑134 (MQ=18) ttCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 1:2599861/140‑1 (MQ=255) ttCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 2:2692134/140‑1 (MQ=255) ttCAGGGACTTTTGAAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCGCTTTGGCCGCTCGGGAACCCGACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 1:4163644/140‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagccgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccg < 2:5158573‑M2/140‑123 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAGCCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGTTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 1:3189927/140‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 2:1313099/140‑1 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgc < 2:72676‑M2/140‑124 (MQ=255) aGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtgg < 2:797645/140‑1 (MQ=255) aCTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatggg > 1:4947352‑M2/1‑12 (MQ=255) aCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtggtggt < 1:5222113/140‑1 (MQ=255) cTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggc < 2:4055249‑M2/140‑130 (MQ=255) cTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgcggcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgcgggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggc < 2:1961914‑M2/140‑130 (MQ=255) ttttGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggca > 1:2980092‑M2/1‑10 (MQ=255) tttGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcag < 1:998355‑M2/140‑132 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggg > 1:4744560/1‑140 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggg > 2:1126801/1‑140 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAGTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggg > 1:1101797/1‑140 (MQ=255) tGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggggg < 1:2440351/140‑1 (MQ=255) gTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgct > 2:1576148‑M2/1‑2 (MQ=255) tgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaacc > 1:2903724‑M2/1‑1 (MQ=255) tgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaacc < 2:2903917‑M2/96‑96 (MQ=255) tgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgct > 1:1788119‑M2/1‑1 (MQ=255) tgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgct < 2:1788119‑M2/85‑85 (MQ=255) | CGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGG > NZ_CP025268/1293120‑1293391 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |