Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 570,494 | A→G | *184* (TAA→TAG) | ybcL → | Raf kinase inhibitor‑like protein YbcL |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 570,494 | 0 | A | G | 99.5% | 682.1 / NA | 198 | *184* (TAA→TAG) | ybcL | Raf kinase inhibitor‑like protein YbcL |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (50/147); minor base T (1/0); total (51/147) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
ACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGTCAGGGAAAGAAAGTTAT > NZ_CP025268/570358‑570628 | aCCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGt < 1:2612132/140‑1 (MQ=255) aCCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGAGAAAGTAGGGt < 2:2813511/140‑1 (MQ=255) aCCAGTTTAAAGAATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAACATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGt < 1:4566670/140‑1 (MQ=255) ccAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTCGACTCTAACGCCAGCGCAGCGCTCGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCTTATCCGCTTACATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTg < 2:1595440/140‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |