| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 49,911 | T→G | W30G (TGG→GGG) | folA → | type 3 dihydrofolate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 49,911 | 0 | T | G | 95.3% | 734.9 / 20.6 | 234 | W30G (TGG→GGG) | folA | type 3 dihydrofolate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/7); new base G (100/121); total (105/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.12e-01 | |||||||||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
TTTACGCTTTACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGCCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGATCGCGTAACGTGGGTG > NZ_CP025268/49775‑50048 | tttACGCTTTACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGt > 1:44954/1‑140 (MQ=255) tACGTGTAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGTGTTATCGGCATGGAAAAAGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCa < 2:4708375/140‑1 (MQ=255) tACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATTTCAATGATAAGTATGATTGCGTGGTTAGCGGTAGATCGCGGTATCGGCATGGAAAACGCCATTCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGGTTTAAAGGCa > 2:3599523/1‑140 (MQ=255) tACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGGTTTAAACGCa < 1:1184885/140‑1 (MQ=255) tACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCa < 1:100346/140‑1 (MQ=255) tACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCa < 1:3122597/140‑1 (MQ=255) gcGTATAGTGGCGACAATGTTATTTCTCGGGCAACCTCAACGGTCAGGCTGATGGCGGGGTGAGGGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGGCATGCCGGGGAACCTGCCTGCCGGTCTCGCCGGGTTTAAACGCaa < 2:2984453/139‑1 (MQ=255) aCGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCCTGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCaa < 2:4906409/140‑1 (MQ=255) aCGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGTTTTAAACGCaa < 2:5258105/140‑1 (MQ=255) aCGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCaa < 2:4942120/140‑1 (MQ=255) ataGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACAcc < 1:2167132/140‑1 (MQ=255) ataGTGGCGACAATTTTTTTGATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTGTAAACGCAACAcc < 1:2602258/140‑1 (MQ=255) gTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTta > 2:3810581/1‑140 (MQ=255) gTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTta > 1:37231/1‑140 (MQ=255) tGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTtaa > 1:906717/1‑140 (MQ=255) ggCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTtaaa > 2:4471588/1‑140 (MQ=255) ggCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTtaaa > 1:2065136/1‑140 (MQ=255) ggCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTtaaa > 1:618932/1‑140 (MQ=255) cGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTtaaata < 2:1555207/140‑1 (MQ=255) cGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTtaaata > 1:700490/1‑140 (MQ=255) cGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTtaaata > 1:1316216/1‑140 (MQ=255) cGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTtaaata > 2:3234419/1‑140 (MQ=255) aCAATTTTTTTTATCGGGAAGTCTCAATTATCAGTCTGATTGCGGCGTTCGCGGTAGATCGCGTTATCGGGATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACAACTtaaataaa > 2:3016541/1‑140 (MQ=255) aCAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCCATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAGACGCCATGCCGTGGCACCTGCCTGCCGATCACGGCGGGTTTAAACGCAACACCGtaaataaa > 2:2236707/1‑140 (MQ=255) aCAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCGGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCCtaaataaa > 1:3678944/1‑140 (MQ=255) tATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCCGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTAt > 1:610924/1‑140 (MQ=255) aTCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCGACACCTTAAATAAACCCGTGATTATg < 2:1323106/140‑1 (MQ=255) cGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATggg > 2:166055/1‑140 (MQ=255) cGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATggg < 1:40243/140‑1 (MQ=255) cGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATggg < 2:520389/140‑1 (MQ=255) aaaTCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGgccgc < 1:3344389/140‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGgccgcc < 1:4208376/140‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCAGGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACCCCTTAAATAAACCCGTGATTATGGgccgcc < 2:3830139/140‑1 (MQ=255) aTCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCa < 2:2790031/140‑1 (MQ=255) tGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTgg > 1:1432773/1‑140 (MQ=255) tCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaa > 2:250/1‑140 (MQ=255) agtcTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaatc > 1:2744591/4‑140 (MQ=255) gtcTGATTGCGGCGTTAGCGGTTGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCGACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGACATACGTGGGaatca > 2:4555394/3‑140 (MQ=255) gtcTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaatca > 2:60565/3‑140 (MQ=255) gtcTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaatca > 1:1521391/3‑140 (MQ=255) gtcTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGAGCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaatca > 2:4800162/3‑140 (MQ=255) cTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaatcaat < 2:1197507/140‑1 (MQ=255) ttGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGgt < 1:2285384/140‑1 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGTCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCGGCCGATCTCGCCTGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATGAGGGGCCGCCATACCTGTGAAGCAATCGGTCGTcc > 1:3024597/1‑140 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGTTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTcc > 1:5008842/1‑140 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCaa > 1:344577/1‑83 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTcc > 1:1979972/1‑140 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTcc > 1:1768782/1‑140 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTcc > 2:705263/1‑140 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTcc > 1:3353159/1‑140 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTAGCGGCATGGAAAACGCAATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGAAACACCGTAAATAAACCCGTGAGTATGGGCCGCAAAACCACGGAATCAATCGGGCGTcc > 2:397121/1‑140 (MQ=255) tAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGTTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGa < 1:1040213/140‑1 (MQ=255) tAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGACTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGa < 2:1416038/140‑1 (MQ=255) aTCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGTCCGCCATACCTGTGAATCAATCGGTCGGCCGTTGCCAGGACGc > 2:4604377/1‑140 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGTTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa < 2:3454104/140‑1 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa < 2:2933662/140‑1 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa < 2:3746861/140‑1 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa > 1:3488162/1‑140 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa < 1:136117/140‑1 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa < 1:4763971/140‑1 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa < 2:44954/140‑1 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa > 2:233502/1‑140 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa < 2:2116492/140‑1 (MQ=255) cgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaaaa > 1:4530358/1‑140 (MQ=255) cgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaaaa > 1:1400269/1‑140 (MQ=255) cgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaaaa > 1:1619789/1‑140 (MQ=255) tATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAata < 2:2553215/140‑1 (MQ=255) tCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAatagt > 1:557334/1‑138 (MQ=255) tCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAAtatt < 2:296891/140‑1 (MQ=255) aTGGAAAGCGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCt < 2:2944380/140‑1 (MQ=255) aTGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGTTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCt < 1:171244/140‑1 (MQ=255) aTGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAACATATTATCCt > 2:3618694/1‑140 (MQ=255) aTGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCt < 2:338187/140‑1 (MQ=255) ggAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTca < 2:4107763/140‑1 (MQ=255) aaaaCGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTcagc < 1:3326358/140‑1 (MQ=255) cGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTc > 1:2389992/1‑140 (MQ=255) gCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTGGAATAAACCCGGGATGAGGGGCCGCCATACCTTGGAATCAATCGGTCGTCCGTGGCCAGGGCGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCa > 1:779590/1‑140 (MQ=255) ccATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCaa < 2:1450838/140‑1 (MQ=255) tGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCAt > 1:1329594/1‑77 (MQ=255) tGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCCAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑g > 2:1651730/1‑140 (MQ=255) tGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑g > 2:3093387/1‑140 (MQ=255) gcagTGGTACCTGCTTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTAAGCAGTCAACC‑gg < 2:4250551/137‑1 (MQ=255) cGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGt < 1:3577092/140‑1 (MQ=255) tGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTAc > 1:4302292/1‑140 (MQ=255) tGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTAc > 2:2737810/1‑140 (MQ=255) gcaaCCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACACAACACCTTAAATAAACCCCTGATTAAGGGACGCCATACCTGGGCCTCAATGGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATACTATCATCCGCAGACACCC‑GCGTACg > 2:2395657/3‑140 (MQ=255) aaCCTGCCTGCCGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTCAAATAAACCCATGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGa < 1:4917961/140‑1 (MQ=255) cctgcctgCCGATCCCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAAACCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTACGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACg < 1:3208618/140‑1 (MQ=255) tgcctgccGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGAt < 2:202141/140‑1 (MQ=255) tgcctgccGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGAt < 2:4672348/140‑1 (MQ=255) tgcctgccGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGAt < 1:1830004/140‑1 (MQ=255) gcctgccGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGATc > 2:923510/1‑140 (MQ=255) tgccGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGATcgcg < 1:184197/140‑1 (MQ=255) tgccGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGATcgcg < 1:2865036/140‑1 (MQ=255) tgccGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGATcgcg < 1:1231639/140‑1 (MQ=255) gccGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGATCGCGt < 2:1714210/140‑1 (MQ=255) ccGATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGGTACGGACGATCGCGt > 1:2506893/1‑140 (MQ=255) gATCTCGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAACCCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGATCGCGTAAc < 1:4126386/140‑1 (MQ=255) aTCTCGCCTGTTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATGATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGATCGCGTAACg < 1:4871793/140‑1 (MQ=255) ctcGCCGGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGATCGCGTAACGTg > 2:3558432/1‑140 (MQ=255) | TTTACGCTTTACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGCCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACC‑GGGTACGGACGATCGCGTAACGTGGGTG > NZ_CP025268/49775‑50048 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |