Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 2,016,740 | T→C | *105* (TAA→TAG) | fliE ← | flagellar hook‑basal body complex protein FliE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 2,016,740 | 0 | T | C | 99.5% | 697.2 / NA | 210 | *105* (TAA→TAG) | fliE | flagellar hook‑basal body complex protein FliE |
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Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
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1:1651712/1‑140 (MQ=255) tGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATcac > 1:967253/1‑140 (MQ=255) gagaTCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATcaca < 2:3039286/140‑1 (MQ=255) tGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAac > 1:145656/1‑140 (MQ=255) gTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATACTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAacg < 1:5283917/140‑1 (MQ=255) aaTTAACAACAGGTTACAAAGCCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCAGCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAacgcc < 2:3165811/140‑1 (MQ=255) tAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAacgccacg < 1:2201253/140‑1 (MQ=255) aacaacAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAacgccacgc < 1:2937305/140‑1 (MQ=255) caacaGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGCATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTCTAACGCCACGCCg > 1:896255/1‑140 (MQ=255) caacaGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCg > 1:1744968/1‑140 (MQ=255) caGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCCTTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCGGGt > 2:2245896/1‑140 (MQ=255) caGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCGGGt > 1:1217163/1‑140 (MQ=255) gTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCGGGTTCa > 2:1221032/1‑140 (MQ=255) gTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCGGGTTCa > 1:3146438/1‑140 (MQ=255) tACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGAt > 2:2487965/1‑37 (MQ=255) tACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGAt < 1:2487965/37‑1 (MQ=255) cAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCGGGTTCACCga > 2:3479163/1‑140 (MQ=255) | GTTATCGCGTATACGGATCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACTTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCGGGTTCACCGAG > NZ_CP025268/2016603‑2016874 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |