Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 2,118,541 | T→C | *465* (TAA→TAG) | wcaM ← | colanic acid biosynthesis protein WcaM |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 2,118,541 | 0 | T | C | 99.7% | 949.5 / NA | 285 | *465* (TAA→TAG) | wcaM | colanic acid biosynthesis protein WcaM |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (155/129); total (155/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
TTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATTTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGACAGCAGTGT > NZ_CP025268/2118405‑2118672 | tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCGTGAAGTACCCTGAATTGGTGACTGGAGTACTTGTGAGGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCAGTGTTCCTAAGTATGACGCCATTTTTCCAGGAGTGGGCGCGAAtttgcg > 2:3391548/1‑137 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACGCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACt > 2:3048230/1‑140 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCTCTTCTTTGTGGATTGCAGTAGCCTTGTTCCTAATTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACt > 2:1454330/1‑140 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACt > 1:77904/1‑140 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATGACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGAAATGGTCGCAAATCTACt > 2:2387192/1‑140 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAACATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAGTGGTCGCAAATCTACt > 2:4861291/1‑140 (MQ=255) ttCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTcc > 2:1764630/1‑140 (MQ=255) ttCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTcc > 1:902110/1‑140 (MQ=255) ttCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATAGTCGCAAATCTACTcc > 1:2946589/1‑140 (MQ=255) ttCGATTTTTTTCGCCAGCAGCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTGGTGGATTTCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATAACTACATTTTTCCAGGAATGGTCTAAAATCTAGTcc > 2:3365521/1‑140 (MQ=255) tCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATTACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCgg < 2:3570567/140‑1 (MQ=255) tCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCgg < 1:1015627/140‑1 (MQ=255) tCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCgg < 1:5163397/140‑1 (MQ=255) tCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCACTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCgg < 2:1077899/140‑1 (MQ=255) cGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGc < 1:1074168/140‑1 (MQ=255) gCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCa < 1:5207761/140‑1 (MQ=255) aGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATc < 1:1819099/140‑1 (MQ=255) aGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATc < 2:3083452/140‑1 (MQ=255) gCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCt < 1:4236368/140‑1 (MQ=255) cAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAg < 1:3212641/140‑1 (MQ=255) ttACCCTGCATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTCCTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTa < 2:4115573/140‑1 (MQ=255) ttACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTa < 2:3113652/140‑1 (MQ=255) tGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAAtcttc < 1:3841991/140‑1 (MQ=255) gAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAAtcttct < 2:4348185/140‑1 (MQ=255) aaTTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTtctc < 1:4550239/140‑1 (MQ=255) aaTTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTtctc < 1:3085315/140‑1 (MQ=255) aaTTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTtctc > 1:1169903/1‑140 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAATTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCACATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 2:4710248/140‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTGATCTTCTCCACAt > 2:4592231/1‑140 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 1:1392144/140‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 1:4178000/140‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 2:321256/140‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt > 2:2685545/1‑140 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 2:428319/140‑1 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTGGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa > 2:4900937/1‑140 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGTTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa > 2:2886722/1‑140 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTa > 1:4842568/1‑94 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTCATCTTCTCCACATTAACa > 2:3818108/1‑140 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa > 1:4756744/1‑140 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa < 1:2987808/140‑1 (MQ=255) aaTTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAat > 2:3688345/1‑140 (MQ=255) aaTTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAat > 2:1450840/1‑140 (MQ=255) tACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCTCATTAACAATATg > 1:4701934/1‑140 (MQ=255) tACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATg < 1:5286471/140‑1 (MQ=255) tACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATg < 1:2106451/140‑1 (MQ=255) ttGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTg < 2:676271/140‑1 (MQ=255) gtgATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGAt < 1:2370423/140‑1 (MQ=255) gtgATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGAt < 2:2316432/140‑1 (MQ=255) gtgATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGAt > 1:2580626/1‑140 (MQ=255) gATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTa > 1:3998178/1‑140 (MQ=255) gATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTa > 1:1597610/1‑140 (MQ=255) gccgcTTCGTTGTGGATTGCAGCAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGCTTAATCCTGTc < 2:3804380/140‑1 (MQ=255) cTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGata > 1:3047305/1‑140 (MQ=255) cTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGata > 2:3451947/1‑140 (MQ=255) cTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACGCCATGTTGCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCACTATAAACTTAATCGGCTCCACATTTACAATATGGCGATTAATCCTGTCGgta > 2:1199502/1‑140 (MQ=255) ttGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGAc < 2:3273710/140‑1 (MQ=255) tgGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGa > 1:688845/1‑140 (MQ=255) gATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGc > 2:1860033/1‑140 (MQ=255) gATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGc > 1:2671176/1‑140 (MQ=255) tGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCttt > 2:1148579/1‑140 (MQ=255) tGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCttt > 1:5105920/1‑140 (MQ=255) tGCAGTAGCACTGTTCCTAAGTCTGACTCCATTTTTCGAGGATTGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTGTCCACATTACCAATATGTTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCttt > 2:5305567/1‑140 (MQ=255) gCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTg < 1:3407381/140‑1 (MQ=255) cAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTACTCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGt > 2:4207812/1‑140 (MQ=255) cAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGt > 1:4292385/1‑140 (MQ=255) cAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGt > 1:1430281/1‑140 (MQ=255) aGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTc < 2:4161896/140‑1 (MQ=255) tAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCt > 2:1295749/1‑140 (MQ=255) tAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCt > 1:1966508/1‑140 (MQ=255) gCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCttt > 2:1056681/1‑140 (MQ=255) gTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcat > 2:391530/1‑140 (MQ=255) gTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcat > 1:1714139/1‑140 (MQ=255) gTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcat > 2:618176/1‑140 (MQ=255) ttCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcatt > 2:810205/1‑140 (MQ=255) ttCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcatt > 1:2076802/1‑140 (MQ=255) ccTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcattca > 2:5149459/1‑140 (MQ=255) ccTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcattca > 2:936201/1‑140 (MQ=255) ccTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcattca > 1:314380/1‑140 (MQ=255) gTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCa < 1:2230263/140‑1 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGa > 1:352787/1‑140 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGa > 1:4990445/1‑140 (MQ=255) aCTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAAc < 1:2205018/140‑1 (MQ=255) aCTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAAc < 2:492626/140‑1 (MQ=255) aCTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAAc < 1:928642/140‑1 (MQ=255) tCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACAt < 1:173631/140‑1 (MQ=255) tCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACAt < 2:385024/140‑1 (MQ=255) aTTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTg < 2:3786572/140‑1 (MQ=255) tttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGc > 1:4433280/1‑140 (MQ=255) tttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGc > 1:2303444/1‑140 (MQ=255) tttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGc > 2:1703928/1‑140 (MQ=255) tttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGc > 2:2090542/1‑140 (MQ=255) ttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCa < 1:4320079/140‑1 (MQ=255) ttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCa < 1:3897744/140‑1 (MQ=255) ttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCa < 1:3625247/140‑1 (MQ=255) ttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCa < 1:884327/140‑1 (MQ=255) ttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCa < 1:2769720/140‑1 (MQ=255) ttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCa < 2:2973684/140‑1 (MQ=255) tCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAaga < 2:395762/140‑1 (MQ=255) gAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGAcag < 1:5357661/140‑1 (MQ=255) ggTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGACAGCAgt > 2:1372886/1‑140 (MQ=255) | TTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATTTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGACAGCAGTGT > NZ_CP025268/2118405‑2118672 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |