Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 3,098,977 | A→G | *97* (TAA→TAG) | yggU → | DUF167 family protein YggU |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 3,098,977 | 0 | A | G | 99.4% | 579.7 / NA | 171 | *97* (TAA→TAG) | yggU | DUF167 family protein YggU |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.04e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
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aacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAAc > 1:4386550/1‑140 (MQ=255) aTCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGGcc > 2:2017794/1‑140 (MQ=255) cccGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTTTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTc < 2:1379406/140‑1 (MQ=255) cccGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTc < 2:3829428/140‑1 (MQ=255) cccGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTc < 1:1882585/140‑1 (MQ=255) gCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGc > 2:2206162/1‑140 (MQ=255) ttaattaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTCCGGCCTTGATATCGCGGCCCAAACAGCCCTCGGCGTTGATTCCGCTgaag > 2:2091987/1‑140 (MQ=255) attaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGaaa < 2:1290511/140‑1 (MQ=255) attaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGaaa < 2:953532/140‑1 (MQ=255) ttaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAAc < 1:4808518/140‑1 (MQ=255) ttagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGc < 2:540636/140‑1 (MQ=255) | GTGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAAGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGC > NZ_CP025268/3098840‑3099113 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |