| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,684,318 | T→C | *663* (TAA→TAG) | hmsP ← | biofilm formation regulator HmsP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,684,318 | 0 | T | C | 99.6% | 816.8 / ‑5.2 | 249 | *663* (TAA→TAG) | hmsP | biofilm formation regulator HmsP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (137/110); minor base A (1/0); total (139/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.36e-01 | |||||||||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
ACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGTTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAATC > NZ_CP025268/3684181‑3684453 | aCCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTa > 2:100508/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 2:1567137/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 2:4314567/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 1:2740971/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 1:3766593/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 2:2638430/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 1:5238476/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCAAAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAAGCAGTTTGGGATAGCTAc > 2:4953771/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTCAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 1:4438039/1‑140 (MQ=255) cTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACt < 2:4605509/140‑1 (MQ=255) tGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACtt < 1:4665004/140‑1 (MQ=255) tgCCTTAACATAACACCTAGATAACATCACAGAAATGTCCCTGTATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGGTTCATCGGGCTCGCACAAACCCGCACTTTTTAAATTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTttc < 2:1155579/139‑1 (MQ=255) ggCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGACACAAACAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTCTTATCAGTTGTGGGTAGCTACTTttc > 2:3212012/1‑140 (MQ=255) gCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTttct > 1:1342660/1‑140 (MQ=255) ccTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTttctt < 1:5157681/140‑1 (MQ=255) ccTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTttctt < 1:5001850/140‑1 (MQ=255) ccTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTttctt < 1:4894490/140‑1 (MQ=255) ccTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTttctt < 1:4695569/140‑1 (MQ=255) tAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCa > 2:618778/1‑140 (MQ=255) ccaaTAACACCCAGACACCATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAACCACAAAGGTTAACAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTGTCAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAg > 2:3004822/3‑140 (MQ=255) tAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTaa < 1:1710319/140‑1 (MQ=255) acacCCAGACAACATCACAGAGATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACGTTTTAAAGTTTTGAAATCAGGTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAct > 2:533071/1‑140 (MQ=255) acacCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAct > 2:3006998/1‑140 (MQ=255) acacCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAct > 1:4351146/1‑140 (MQ=255) acacCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAct > 2:2059802/1‑140 (MQ=255) gACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCg < 1:4138097/140‑1 (MQ=255) caacaTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGaa < 1:259822/140‑1 (MQ=255) caacaTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGaa < 1:979287/140‑1 (MQ=255) acctCACAGAAATGTGCCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTGGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTCGGGTAGCGCCTTTTCTTCCAGGGAACTCTCGTCGAAGa < 2:3892366/137‑1 (MQ=255) acaTCACACAAATGTACCTGGATCATAATTCAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGa < 2:797554/140‑1 (MQ=255) caTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCCCTTCGAAGAt > 2:1947938/1‑140 (MQ=255) aTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGAtt < 1:1030660/140‑1 (MQ=255) aTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGAtt < 1:1844837/140‑1 (MQ=255) aTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGAtt < 1:422833/140‑1 (MQ=255) gAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATa < 2:2354703/140‑1 (MQ=255) aTGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAggg > 1:5043172/1‑140 (MQ=255) tGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATa < 1:4269303/136‑1 (MQ=255) tGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGa > 2:1669527/1‑140 (MQ=255) tGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGa > 1:1172523/1‑140 (MQ=255) tGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGa > 2:2780293/1‑140 (MQ=255) tACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAgg > 2:4211475/1‑139 (MQ=255) tACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGt > 1:2384864/1‑140 (MQ=255) aCCTGGATCATAATTGACACAAAAAGGCTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCCCAAACCAGCACTTTTTGAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTATTCTAGGTAACTCTCTTCGCAGATTTCAATAGGGAGTg > 2:4757169/1‑140 (MQ=255) tGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGc < 2:3756543/140‑1 (MQ=255) ggATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCg > 1:5176325/1‑140 (MQ=255) aTCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAg > 1:1942873/1‑140 (MQ=255) aTCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTGTGGTGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGCCGAg > 2:2530334/1‑140 (MQ=255) aTCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACAAGCAAATTCTAGAGTTTTGTAATCAGTTTGGGATAGATACTGTTCTTTCAGCTAACGGTCTGCAAAGATCTCACTACGGAGAGGGCGAg > 2:4227074/1‑140 (MQ=255) tCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGc < 1:1583165/140‑1 (MQ=255) aTAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCaa > 1:4342053/1‑140 (MQ=255) aTAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTATTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTATCTACGTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGTTTTCAATAGGGAGTGGGTGAGCaa > 2:4454231/1‑140 (MQ=255) tGAAACAAAAAGGTTAACCCGCTTGAGCTGGCTAGCCCAACCCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTACTCCGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAgg < 1:3022439/140‑1 (MQ=255) tGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAgg < 2:93587/140‑1 (MQ=255) aCAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGc > 1:2218893/1‑140 (MQ=255) cAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGcc < 1:3248174/140‑1 (MQ=255) cAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGAACCTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGCAGcc < 2:3063701/140‑1 (MQ=255) aaaaaaGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGccc < 2:328339/140‑1 (MQ=255) gTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCa < 2:3376311/140‑1 (MQ=255) ttAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGGGGGCGAGCAAGAAGGAAGCCCTGGGCaa > 1:4847152/1‑140 (MQ=255) aaaaaCTTTGATCTGGCTCGCACAAACCAACACTATTTAAAGATGTGTAATCAGATTGCGCTAGCTACCTTTCTTACAGGTAACTTTCTTTGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAACAAAAAGGAAACCCTGGGCAATa > 2:2537144/1‑140 (MQ=255) ttGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGaa > 1:1155717/1‑87 (MQ=255) ttGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGaa < 2:1155757/87‑1 (MQ=255) ttGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGc > 2:1344436/1‑140 (MQ=255) ttGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGc > 1:802849/1‑140 (MQ=255) ttGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGc < 2:2908836/140‑1 (MQ=255) tGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGcc > 1:1554390/1‑140 (MQ=255) tGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGcc > 1:659089/1‑140 (MQ=255) tGAGCTGGCTCGAACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGcc < 1:4465484/140‑1 (MQ=255) gCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATCGGGAGTGGGCAAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCtttt > 2:3534026/1‑140 (MQ=255) cTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTg < 1:4826248/140‑1 (MQ=255) tCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTgc < 1:208456/140‑1 (MQ=255) aCCAGCACTTTTTAACGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAACAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGt > 2:1359121/1‑140 (MQ=255) aCCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGt > 1:3543369/1‑140 (MQ=255) aCCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGt > 1:2165624/1‑140 (MQ=255) aCCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGt > 2:4645066/1‑140 (MQ=255) aCCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGt > 2:4262158/1‑140 (MQ=255) aCCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGt > 1:3365119/1‑140 (MQ=255) aCCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGt > 2:2195435/1‑140 (MQ=255) aCCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTGTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGt > 1:2991055/1‑140 (MQ=255) cAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTcg < 1:75414/140‑1 (MQ=255) cAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTcg < 1:3017887/140‑1 (MQ=255) gCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTcgcg < 1:3717708/140‑1 (MQ=255) aCTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGtt < 1:1415505/140‑1 (MQ=255) aCTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGtt < 2:1863565/140‑1 (MQ=255) aCTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGtt < 2:3553704/140‑1 (MQ=255) tttAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGTTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAGAAAGGAAGCCCTGGTCAATACCAACGCCCGCTTTTACCAGCCAGTCGCGTTGTGc > 2:449337/1‑140 (MQ=255) tttAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGTGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCGGTCGCTGTGTGc > 1:2640134/1‑140 (MQ=255) tttAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGc > 1:599911/1‑140 (MQ=255) tttAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGc > 1:938751/1‑140 (MQ=255) ttAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCt < 1:2822717/140‑1 (MQ=255) tAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCtt < 2:858742/140‑1 (MQ=255) tGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTcc > 2:3435168/1‑140 (MQ=255) tGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTcc > 1:3182918/1‑140 (MQ=255) tGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTcc > 2:685074/1‑140 (MQ=255) tGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTcc > 2:2255873/1‑140 (MQ=255) tGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTcc > 1:2211375/1‑140 (MQ=255) cAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCt < 1:2910030/140‑1 (MQ=255) aGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCtt > 2:5060122/1‑140 (MQ=255) ggggTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCa < 1:3968725/140‑1 (MQ=255) ggTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAAt < 2:5238476/140‑1 (MQ=255) | ACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGTTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAATC > NZ_CP025268/3684181‑3684453 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |