| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,009,615 | A→G | *610* (TAA→TAG) | recQ → | ATP‑dependent DNA helicase RecQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,009,615 | 0 | A | G | 99.7% | 948.7 / NA | 285 | *610* (TAA→TAG) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase RecQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (107/177); total (107/178) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
GATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAATCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTCCCGATTTCTT > NZ_CP025268/4009480‑4009749 | gaTGGCTGAACAGATTCCGATCACCGCCAGGGAAATGCTCAGCGGTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTCGTcag > 2:3223576/1‑140 (MQ=255)gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag > 2:941413/1‑140 (MQ=255)gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag > 2:2700470/1‑140 (MQ=255)gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag < 2:126768/140‑1 (MQ=255)gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag < 1:1428039/140‑1 (MQ=255)gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag < 2:1240814/140‑1 (MQ=255)gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag < 1:513735/140‑1 (MQ=255)gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag < 1:4138372/140‑1 (MQ=255)gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag < 1:2359448/140‑1 (MQ=255)gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGGTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag > 1:1474276/1‑140 (MQ=255) aTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcagc > 2:1493387/1‑140 (MQ=255) tGGCTGAACAGGTGCCGCTCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGGTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGCAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcagca < 2:1125620/140‑1 (MQ=255) gCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCGGCGTTAACGGCGTTGGGGGGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGGTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAACAGTAGTCagcagc > 2:4621537/1‑140 (MQ=255) aTGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAg > 1:1711141/1‑140 (MQ=255) tGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGt > 2:4356240/1‑140 (MQ=255) tGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGt > 1:5225259/1‑140 (MQ=255) gCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGCGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTg > 2:3757698/1‑140 (MQ=255) gCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTg < 1:508881/140‑1 (MQ=255) gCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTg < 2:587208/140‑1 (MQ=255) gCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTg > 1:624351/1‑140 (MQ=255) gCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTg < 2:1159879/140‑1 (MQ=255) cgaaTCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGc > 1:4267039/4‑140 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAGAAAGTGcc < 1:2618442/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 1:3485961/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 1:4765984/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 1:4507339/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 2:2218196/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 1:1159165/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 1:2680029/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 1:1069737/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATCGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 1:3907752/140‑1 (MQ=255) aTCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAg < 2:4284950/140‑1 (MQ=255) ccAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAg > 1:1291432/1‑140 (MQ=255) cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGa < 1:1338658/140‑1 (MQ=255) cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGa < 1:303318/140‑1 (MQ=255) cAGCCAAATGCTAAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGATGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGa < 2:1598641/140‑1 (MQ=255) cGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGGATGAAGACTc > 2:410798/1‑140 (MQ=255) aGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGtt > 1:3778501/1‑140 (MQ=255) aGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGtt > 1:2536333/1‑140 (MQ=255) cGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATaaaa > 1:1923496/1‑108 (MQ=255) cGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATaaaa < 2:1923496/108‑1 (MQ=255) aCGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcg < 2:3641367/140‑1 (MQ=255) aCGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcg < 2:2502526/140‑1 (MQ=255) cGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcgc < 1:4678409/140‑1 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGt > 2:512431/1‑140 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCGGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGt < 1:1764569/140‑1 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGt > 1:4410490/1‑140 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTGATGGCGCGGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGt < 1:1811098/140‑1 (MQ=255) ttGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTc < 1:1008558/140‑1 (MQ=255) gggATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCaa < 1:4860672/140‑1 (MQ=255) gggATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCaa < 1:567023/140‑1 (MQ=255) gATGCGCAAGCTGGAACGCTTTAGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAACAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAat < 2:4213580/140‑1 (MQ=255) cgcAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAatgtat > 2:2129887/1‑140 (MQ=255) cgcAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAatgtat > 2:2025162/1‑140 (MQ=255) cgcAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAatgtat > 1:696836/1‑140 (MQ=255) cgcAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAatgtat > 2:824100/1‑140 (MQ=255) cAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAatgtatgt < 1:3631591/140‑1 (MQ=255) aaGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGtt < 2:2250553/140‑1 (MQ=255) gCTGGAACTCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCTGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGa < 2:3918529/140‑1 (MQ=255) tGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTACGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGACGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATg < 2:4903095/140‑1 (MQ=255) tGGAACGCTTTGGAAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATCGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAACAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATg < 2:443638/140‑1 (MQ=255) aaaCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGt < 1:1514590/140‑1 (MQ=255) aCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg < 1:3379577/140‑1 (MQ=255) cGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGcc < 2:4565930/140‑1 (MQ=255) cGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGcc < 2:703400/140‑1 (MQ=255) cGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTGCTCACCGTCGcc < 2:2573636/140‑1 (MQ=255) cGTTTATCGCGCTGATCCGTGCGCATGTCGATTGCGATGAGGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAGAAGTGCCAGCATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGcc < 2:4427757/140‑1 (MQ=255) tttATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCAt < 2:399807/140‑1 (MQ=255) tgtATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTGGAGGTTATTTCTCACCGTCGCCAt < 2:303752/138‑1 (MQ=255) ttATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGAGGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATg < 1:3227630/140‑1 (MQ=255) ctgtcgcTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGt < 2:2600312/136‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGt < 1:357854/140‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGt < 2:1859067/140‑1 (MQ=255) gcgcTGATTGGTGCGGATGTTGATGGCGAGGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAGCGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGca < 2:2586357/140‑1 (MQ=255) gcgcTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGca < 2:1824913/140‑1 (MQ=255) gcgcTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTAAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGCTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGca < 2:4156283/140‑1 (MQ=255) gcTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTTATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGcaca > 1:1361167/1‑140 (MQ=255) gcTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGcaca > 1:2594180/1‑140 (MQ=255) cTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACAt > 2:2347589/1‑140 (MQ=255) gATTCTTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATtg < 2:279789/140‑1 (MQ=255) gATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATtg < 1:1656716/140‑1 (MQ=255) gATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATtg < 2:43974/140‑1 (MQ=255) tCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTgg < 1:434739/140‑1 (MQ=255) gTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGgcg < 1:4043277/140‑1 (MQ=255) gTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGgcg < 2:73605/140‑1 (MQ=255) gTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGgcg < 1:2931261/140‑1 (MQ=255) tGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGgcgc > 1:5011779/1‑140 (MQ=255) tGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGgcgc < 1:2124336/140‑1 (MQ=255) cATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTAt < 1:4272324/140‑1 (MQ=255) aTGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATg > 1:2754337/1‑140 (MQ=255) aTGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATg > 1:2813540/1‑140 (MQ=255) aTGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTGATg > 2:3154994/1‑140 (MQ=255) ggCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCgg > 1:945541/1‑140 (MQ=255) cGATGACGTAGAATAGCCAGCAGCATCAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAACCGTGTCCCCCGCGAGTCACATGCATGTTGACGTTATTTCTCACCGGCGCCATGGGGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCCGTc > 2:679888/1‑140 (MQ=255) cGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTc > 2:2914157/1‑140 (MQ=255) cGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTc > 2:852162/1‑140 (MQ=255) aTGACGAAGGGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGGATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTccc > 2:2148612/1‑140 (MQ=255) aTGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTccc > 2:4071254/1‑140 (MQ=255) aTGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTccc > 1:4868193/1‑140 (MQ=255) gagTAGTCCGCAGCATAAAGAGGTGCCAGTATGAAGACTCCGTACACGGTTCCCCTGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCGCACCGTTGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCTTCGGTCCCGGTTTCtt > 2:4814340/1‑140 (MQ=255) | GATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAATCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTCCCGATTTCTT > NZ_CP025268/4009480‑4009749 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |