| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,079,391 | A→G | intergenic (+17/‑28) | dtd → / → fabY | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/fatty acid biosynthesis protein FabY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,079,391 | 0 | A | G | 99.7% | 1015.8 / NA | 302 | intergenic (+17/‑28) | dtd/fabY | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/fatty acid biosynthesis protein FabY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (130/170); minor base T (0/1); total (130/172) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
GACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAACGC > NZ_CP025268/4079255‑4079526 | aCTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCAc > 2:3515306/1‑140 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg > 1:2308187/1‑140 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:4193765/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:629019/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 2:3688375/140‑1 (MQ=255) aTTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACggg > 2:2798512/1‑140 (MQ=255) aTTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGAAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACggg < 1:1270771/140‑1 (MQ=255) tttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGa > 2:1704435/1‑140 (MQ=255) tttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGa > 2:1498523/1‑140 (MQ=255) tttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGa > 2:3169416/1‑140 (MQ=255) tttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGCTGTCACGGGa > 1:2811619/1‑140 (MQ=255) ttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGaa < 2:1304615/140‑1 (MQ=255) ttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGATTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGaa < 1:2120455/140‑1 (MQ=255) tcgtcgAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGaaa > 2:4081697/1‑140 (MQ=255) tcgtcgAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGaaa < 2:5069706/140‑1 (MQ=255) tcgtcgAACGCTGCCGGCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGATGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGaaa < 2:42752/140‑1 (MQ=255) gAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAaga < 1:110022/140‑1 (MQ=255) gAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAaga < 1:4844510/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGACCACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTAAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 1:1400483/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 1:937399/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 2:4941932/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 1:1748691/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 2:618250/140‑1 (MQ=255) cTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagagagag < 1:2388615/140‑1 (MQ=255) cTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagagagag < 1:4369863/140‑1 (MQ=255) gCCGTCAGCAAGAGGTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTa < 1:472471/140‑1 (MQ=255) gCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCCGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTa < 2:2580397/140‑1 (MQ=255) ccGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTAt < 1:2993620/140‑1 (MQ=255) ccGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTAt < 1:3881404/140‑1 (MQ=255) ccGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGATTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTAt < 1:1175039/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACGGGACGCTTCGCGGCGGATATGCGGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 2:1170869/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 2:720619/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 1:3698412/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 1:334097/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 2:3958157/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 1:963637/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCAGATATGCCGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTCGCAGGTATGAGCCAGCTTTCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 2:1039719/140‑1 (MQ=255) ctCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATCTGCAGGTATCGCTGGTCAATGATCGCCCCGTGGCATTCTGGTTGCAGGTCTGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 2:2892067/139‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 1:4466068/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 1:878239/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 2:2847234/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTAGGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 2:2745237/140‑1 (MQ=255) cAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCt < 2:59756/140‑1 (MQ=255) gCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTAt < 1:1670117/140‑1 (MQ=255) aTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCAc > 1:3710332/1‑140 (MQ=255) gAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCt > 2:2936151/1‑140 (MQ=255) aaCACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCtt > 1:5048672/1‑140 (MQ=255) gCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGt < 2:2079848/140‑1 (MQ=255) aaCAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTcc < 1:2257141/140‑1 (MQ=255) ttCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaa > 1:3836953/1‑140 (MQ=255) tCGCTGCGGATTTGAAGGTATGGGTGGTCAAGGAAGGGCCCGTGACATTCTAGTTGCAGGGATGAGCCAGCTTGCAGGGTTGTCACGGGAAACCTTTGAGAGTATAGCTATGTATCGCCTTCGGGTTCCACAAACagatg < 2:3351266/140‑3 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCTGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 1:4913843/140‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 1:1963842/140‑1 (MQ=255) cGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaaga > 2:2205826/1‑140 (MQ=255) ggATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAAtt > 2:1821194/1‑140 (MQ=255) gATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTa < 1:689841/140‑1 (MQ=255) tatGCAGTTATCGCTGTTCAATCATGGCCCCCTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTaga < 2:2663896/140‑1 (MQ=255) tatGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTaga < 2:3735338/140‑1 (MQ=255) atGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTagag > 2:4154787/1‑140 (MQ=255) atGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTagag > 1:1558004/1‑140 (MQ=255) gCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCg < 1:2729585/140‑1 (MQ=255) gCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCg < 1:3574327/140‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGaaa < 2:2568506/73‑1 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTc > 1:1232607/1‑140 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTc > 1:4535224/1‑140 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTTCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGGTCCTCAAACAGAAGAAGAAGTAGAGCGTTACTATTAGTTTTGCGGGGaaa > 1:2063544/1‑140 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa > 2:111859/1‑140 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa > 1:2554789/1‑140 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa > 2:5113902/1‑140 (MQ=255) ccccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAAt < 2:3115949/140‑1 (MQ=255) ccccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAAt > 1:1006565/1‑140 (MQ=255) ccccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAAt > 1:3244023/1‑140 (MQ=255) cccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATg < 1:741710/140‑1 (MQ=255) cGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGtt < 1:1704435/140‑1 (MQ=255) gTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTg > 1:2764656/1‑140 (MQ=255) gTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAAGTAGAGCGGTACTATCCGTTTCGCTGGGAGATGTTg > 2:867750/1‑140 (MQ=255) tGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGc > 1:1898514/1‑140 (MQ=255) gACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCCGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCg < 2:190249/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 1:1510577/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 2:1735227/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 1:2172263/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 1:3464235/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTAACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 2:1774350/140‑1 (MQ=255) tCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGc > 1:2371760/1‑140 (MQ=255) tCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGc > 2:5350726/1‑140 (MQ=255) gTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCt > 2:4740788/1‑140 (MQ=255) gTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCt > 2:2644772/1‑140 (MQ=255) gCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCa > 1:2135189/1‑140 (MQ=255) cAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGACAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCAt < 1:4875914/140‑1 (MQ=255) ggTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCa > 1:2895787/1‑140 (MQ=255) tGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCa > 2:4624207/1‑140 (MQ=255) tGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCa > 1:4639539/1‑140 (MQ=255) aGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAATCAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTGCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCaaa < 2:4607403/140‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCaaaa > 2:810742/1‑140 (MQ=255) ccAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAg > 1:3985769/1‑140 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGtt > 2:4539391/1‑140 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGtt > 1:5164962/1‑140 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTGGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGtt > 1:3147596/1‑140 (MQ=255) cTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTc > 1:4101906/1‑140 (MQ=255) ggTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAacgc < 1:4061375/140‑1 (MQ=255) | GACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAACGC > NZ_CP025268/4079255‑4079526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |