| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 4,579,872 | T→C | M1M (ATG→GTG) † *460* (TAA→TAG) |
mcrC ← mcrB ← |
5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease system specificity protein McrC 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease subunit McrB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NZ_CP025268 | 4,579,872 | 0 | T | C | 99.6% | 822.0 / NA | 246 | M1M (ATG→GTG) † *460* (TAA→TAG) | mcrC mcrB | 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease system specificity protein McrC 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease subunit McrB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (177/68); minor base A (0/1); total (177/69) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
AATACATACCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATC > NZ_CP025268/4579736‑4580006 | tacatacCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGa > 1:4171963/1‑140 (MQ=255) tacatacCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGa > 1:2937835/1‑140 (MQ=255) acagacCACAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAg < 2:1689200/140‑1 (MQ=255) acCCCAGGGTATCAAGTTGACTGTTCCCTGTGATGGCCGCAAGGTTTGCCTGCTTATTTTCTTGTAAATAACCCCATGCAGAGGTAAGCATGTAATAGATATTCCGGACAGGTTTCACGGGCTGTTTGACTGTGAGTcgc > 2:3392611/1‑138 (MQ=255) 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tGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCa < 2:1614035/140‑1 (MQ=255) ttCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATc > 1:1045757/1‑140 (MQ=255) ttCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATc > 1:5233533/1‑140 (MQ=255) | AATACATACCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATC > NZ_CP025268/4579736‑4580006 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |