Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,995,413 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (‑54/‑239) | uvrY ← / → yecU | DNA‑binding transcriptional activator UvrY/protein YecU |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1427599 = | NA (NA) | 513 (1.250) | 163/188 | 0.0 | 100% | noncoding (1196/1196 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1995416 | 0 (0.000) | intergenic (‑57/‑239) | uvrY/yecU | DNA‑binding transcriptional activator UvrY/protein YecU | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1428794 | NA (NA) | 518 (1.230) | 169/192 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1196 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | 1995413 = | 0 (0.000) | intergenic (‑54/‑242) | uvrY/yecU | DNA‑binding transcriptional activator UvrY/protein YecU |
Only 100 of 518 total aligned reads displayed.
TATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1428699‑1428794 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCAC > NC_000913/1995413‑1995508 TATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCT > 1:19053025/1‑97 TCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:12176961/97‑1 TCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:12288422/97‑1 CGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAG > 1:19467837/1‑97 GGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGC > 1:17598159/1‑97 GCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCG < 1:20412579/97‑1 GCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCG < 1:12421270/97‑1 GAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGT < 1:15715723/97‑1 GAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGT > 1:16624234/1‑97 AGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTT < 1:8044033/97‑1 AGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTT > 1:2806150/1‑97 GGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTT < 1:15491694/97‑1 AGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATT < 1:19762654/97‑1 AGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATT < 1:1817453/97‑1 AGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATT > 1:16538221/1‑97 GTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTG < 1:9045490/97‑1 TTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGC < 1:10694033/97‑1 TTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGC < 1:1411024/97‑1 TGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCCCCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCA > 1:9837148/1‑97 TGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCA < 1:4663058/97‑1 GATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAn < 1:18454479/97‑2 GATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAA > 1:493480/1‑97 ATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCCAC > 1:17424943/1‑97 GCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTT < 1:16785506/97‑1 CTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTG < 1:18327589/97‑1 CTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTG > 1:1271175/1‑97 TCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGA > 1:13010551/1‑97 TCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGA < 1:12001196/97‑1 TCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGA > 1:15951042/1‑97 TGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAAC > 1:10084299/1‑97 ATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGT > 1:19357312/1‑97 ATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGT < 1:6598861/97‑1 TGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTT < 1:3635055/97‑1 CCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAA < 1:4110575/97‑1 CCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAA < 1:13560969/97‑1 CCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAA > 1:11836414/1‑97 CTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAA > 1:17240112/1‑97 CTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAA < 1:10000492/97‑1 TCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAAT < 1:1477989/97‑1 CTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATG > 1:11607248/1‑97 GGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGT < 1:17049333/97‑1 GATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGG > 1:594134/1‑97 ATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGG < 1:5111903/97‑1 GCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATT > 1:6264979/1‑97 CTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTC < 1:3774689/97‑1 TCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCG < 1:2389508/97‑1 CCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTACGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGA > 1:19866366/1‑97 CGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGGATTCGAT > 1:11536305/1‑97 GATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGTAGGGGATTCGATTT > 1:20067820/1‑97 GATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTT > 1:7223567/1‑97 ATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTT < 1:12905871/97‑1 GAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTC > 1:8805422/1‑97 GAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTC > 1:824373/1‑97 AATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCT > 1:11127475/1‑97 AATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCT > 1:13093881/1‑97 ATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTC > 1:2220522/1‑97 ATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTC > 1:14418814/1‑97 ATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTC > 1:7420169/1‑97 GATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGT > 1:4745619/1‑97 ATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTT < 1:15344378/97‑1 TGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTT < 1:1077374/97‑1 CTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGT < 1:16114820/97‑1 TCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTC > 1:9182144/1‑97 TCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTC < 1:8345173/97‑1 CATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCA > 1:3972687/1‑97 CATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCA < 1:9641776/97‑1 ATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAA > 1:15134706/1‑97 TATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAAT > 1:13330477/1‑97 TATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAAT < 1:3416981/97‑1 ATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATT < 1:3239921/97‑1 ATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATT > 1:20724354/1‑97 TCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTC < 1:10579726/97‑1 AGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGA > 1:15633835/1‑97 GGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGAT > 1:859489/1‑97 GGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGAT < 1:9362346/97‑1 GAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATT > 1:5247187/1‑97 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CTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGG < 1:17294703/97‑1 TTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGT < 1:1253756/97‑1 TTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGT < 1:20257017/97‑1 TTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGT > 1:3877925/1‑97 CTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCAC > 1:16370372/1‑97 CTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCAC < 1:8722569/97‑1 CTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCAC > 1:20545077/1‑97 CTTAGCGGCTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGGATTCGCTTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCAC > 1:13809348/1‑97 TATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1428699‑1428794 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCAC > NC_000913/1995413‑1995508 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |