| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4542690 | 567 (1.350) | 20 (0.050) | 18/174 | 9.8 | 4.0% | intergenic (+57/‑425) | fimE/fimA | regulator for fimA/type 1 fimbriae major subunit |
| ? | NC_000913 | = 4542986 | 436 (1.140) | intergenic (+353/‑129) | fimE/fimA | regulator for fimA/type 1 fimbriae major subunit | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 575 total aligned reads displayed.
TAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTAT > NC_000913/4542594‑4542786 | taatCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCa > 1:19862081/1‑97 (MQ=255) atCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCaaa < 1:12462627/97‑1 (MQ=255) ctcATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACt > 1:1825295/1‑97 (MQ=255) ctcATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACt < 1:4126235/97‑1 (MQ=255) tcATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTg > 1:1856333/1‑97 (MQ=255) tcATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTg > 1:9130179/1‑97 (MQ=255) aTAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTc > 1:14188394/1‑97 (MQ=255) aTAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTc < 1:9399535/97‑1 (MQ=255) aaaCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCa < 1:18453529/97‑1 (MQ=255) aaaCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCa > 1:20811096/1‑97 (MQ=255) aaCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCat < 1:19228149/97‑1 (MQ=255) aCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCata < 1:16428793/97‑1 (MQ=255) cGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAACAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCatat < 1:9688728/97‑1 (MQ=255) aaaTTAAAAAGAGAAGAGTTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCata < 1:18913816/97‑1 (MQ=255) aaaTTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCata > 1:12686881/1‑97 (MQ=255) aaTTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataa < 1:10855926/97‑1 (MQ=255) aaTTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataa > 1:11553166/1‑97 (MQ=255) aaTTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataa > 1:19306219/1‑97 (MQ=255) aaTTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataa > 1:6273360/1‑97 (MQ=255) ttAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataaat > 1:20044146/1‑97 (MQ=255) tAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataaat‑a < 1:15514424/97‑1 (MQ=255) tAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataaat‑a > 1:1001302/1‑97 (MQ=255) tAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataaat‑a > 1:7041597/1‑97 (MQ=255) aaaaaGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataaat‑aa < 1:17859856/97‑1 (MQ=255) aaaaGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAg > 1:4408707/1‑97 (MQ=255) aagagaagagGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGtt < 1:12953957/97‑1 (MQ=255) aagagaagagGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAAAAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGtt < 1:18731320/97‑1 (MQ=255) agagaagagGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTa > 1:2426898/1‑97 (MQ=255) agagaagagGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTa > 1:16805827/1‑97 (MQ=255) gaagagGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGt < 1:15169665/97‑1 (MQ=255) agGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTAttt < 1:16028058/97‑1 (MQ=255) taaTTTAACTTATTGATAAAAAAGTTAAAAAAACAAAAAAATACAAGCCAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTtct < 1:20528365/95‑1 (MQ=255) tGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTtct > 1:17537067/1‑97 (MQ=255) tGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTtct < 1:14520367/97‑1 (MQ=255) tGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTtct > 1:14310422/1‑97 (MQ=255) gATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTtctc > 1:4692085/1‑97 (MQ=255) aTTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCa < 1:7443676/97‑1 (MQ=255) aTTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCa > 1:8624904/1‑97 (MQ=255) aTTTAACTTATTAATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCa < 1:6891129/97‑1 (MQ=255) tttAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCaa > 1:9548864/1‑97 (MQ=255) aaCTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCa > 1:18065294/1‑97 (MQ=255) aCTTATTGATAATAAATTTAAAAAAACAAATAAATTCAAGACAATTGGGCCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCAt < 1:12111256/97‑1 (MQ=255) cTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATa < 1:12787518/97‑1 (MQ=255) ttATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATaa < 1:3538601/97‑1 (MQ=255) tATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATaaa > 1:10215073/1‑97 (MQ=255) aTTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATaaaa > 1:6721707/1‑97 (MQ=255) aTTGATAATAAAGTAAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATaaaa < 1:12584416/97‑1 (MQ=255) tGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAat > 1:8899622/1‑97 (MQ=255) gATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAata > 1:9885507/1‑97 (MQ=255) gATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAata > 1:8011280/1‑97 (MQ=255) ataataAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAatat > 1:11905719/1‑97 (MQ=255) ataataAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAatat > 1:3435152/1‑97 (MQ=255) aataaAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTa < 1:11697913/97‑1 (MQ=255) aataaAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTa > 1:553699/1‑97 (MQ=255) aataaAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTa < 1:13464899/97‑1 (MQ=255) ataaAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaa > 1:17095796/1‑97 (MQ=255) taaAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaaa < 1:10359069/97‑1 (MQ=255) aaaGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaaaa < 1:3928452/97‑1 (MQ=255) aGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaaaaaa < 1:20729890/97‑1 (MQ=255) gTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAAc > 1:7218543/1‑97 (MQ=255) gTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAAc > 1:15031065/1‑97 (MQ=255) gTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATGGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAAc < 1:2932171/97‑1 (MQ=255) ttAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACg < 1:10619490/97‑1 (MQ=255) ttAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACg > 1:18368212/1‑97 (MQ=255) ttAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACg > 1:2147865/1‑97 (MQ=255) tAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGa > 1:1363460/1‑97 (MQ=255) tAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGa > 1:20311670/1‑97 (MQ=255) aaaaaaaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGAc < 1:9257733/97‑1 (MQ=255) aaaaaaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCAAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACa < 1:19447083/97‑1 (MQ=255) aaaaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACaaa > 1:17447026/1‑97 (MQ=255) aaaaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACaaa > 1:5836119/1‑97 (MQ=255) aaaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACaaaa > 1:2691892/1‑97 (MQ=255) aaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACaaaaa > 1:9001426/1‑97 (MQ=255) aaCAAAAAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACaaaaa < 1:14084251/97‑1 (MQ=255) aaCAAAAAAATACAAGACAATGGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACaaaaa < 1:13206452/97‑1 (MQ=255) cAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGc > 1:5680689/1‑97 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1:11275532/1‑97 (MQ=255) aataCAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTaa > 1:19081030/1‑97 (MQ=255) ataCAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAAc > 1:19704441/1‑97 (MQ=255) ataCAAGACAATTGGGCCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAAc < 1:3099416/97‑1 (MQ=255) taaaaGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACt < 1:5249711/94‑1 (MQ=255) taCAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACt > 1:5996831/1‑97 (MQ=255) aaaaGACAATGGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTg < 1:7581472/95‑1 (MQ=255) aaGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGtt < 1:1606168/97‑1 (MQ=255) aGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGttt > 1:11336726/1‑97 (MQ=255) gACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTg > 1:15833524/1‑97 (MQ=255) aaTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGata > 1:18680087/1‑97 (MQ=255) aaTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGata < 1:17317531/97‑1 (MQ=255) aaTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGata > 1:14743483/1‑97 (MQ=255) tGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGt > 1:11110912/1‑97 (MQ=255) ggCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTaaa < 1:16915100/97‑1 (MQ=255) gCCAAACTGTCCATATCATAAATAAAGTTCCTATTTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTaaa < 1:20168662/97‑1 (MQ=255) ccAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAatt > 1:166504/1‑97 (MQ=255) | TAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT‑AAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTAT > NC_000913/4542594‑4542786 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |