| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,678,263 | 0 | T | G | 38.9% | 790.1 / 247.4 | 419 | intergenic (‑360/‑164) | pntA/ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase subunit alpha/DUF1471 domain‑containing protein YdgH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/214); new base G (163/0); total (205/214) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 448 total aligned reads displayed.
GTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGTTTAAATGCAAT > NC_000913/1678167‑1678359 | gTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑Gt < 1:2575248/97‑1 (MQ=255) tAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑Gtt < 1:16436335/97‑1 (MQ=255) tAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑Gtt < 1:6077944/97‑1 (MQ=255) aCGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑Gtttttt < 1:9813093/97‑1 (MQ=255) aCGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑Ggttttt > 1:20001953/1‑97 (MQ=255) gagaCATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑Ggtttttta > 1:7390205/1‑95 (MQ=255) gagaCATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑Gggtttttt > 1:3055531/1‑95 (MQ=255) gagaCATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑Gggtttttt > 1:4949632/1‑95 (MQ=255) gaCATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCTGGGTTTTTaac > 1:12624471/1‑96 (MQ=255) aCATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCa > 1:14782194/1‑97 (MQ=255) aTCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATa < 1:10071748/97‑1 (MQ=255) aTCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTATCATa > 1:6717663/1‑97 (MQ=255) tCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAg < 1:8397961/97‑1 (MQ=255) cGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGGCTAGa > 1:3970791/1‑97 (MQ=255) ggCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCa < 1:5249733/97‑1 (MQ=255) gCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCAt < 1:20935812/97‑1 (MQ=255) cACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCAtt < 1:19458416/97‑1 (MQ=255) cACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCAtt < 1:18149433/97‑1 (MQ=255) cGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCTGGTTTTTTAAG‑ATAGAAGGGTATTTg > 1:19749902/1‑97 (MQ=255) cGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTg < 1:9739201/97‑1 (MQ=255) aaTCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGAAGGGCAtttttg > 1:4096690/1‑94 (MQ=255) aTCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGc < 1:4455094/97‑1 (MQ=255) aTCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGc < 1:10207992/97‑1 (MQ=255) cACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAg < 1:12996138/97‑1 (MQ=255) cACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATTGATGGTCATTTGAGCaa > 1:20616901/1‑96 (MQ=255) cACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAACATAGACGGGCATTTTAGCAg > 1:20141092/1‑97 (MQ=255) actactTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAgg < 1:3524033/97‑1 (MQ=255) actactTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGGTTTTTAATATAGACGGTGCTTTGAGCAgg > 1:8890344/1‑97 (MQ=255) ctactTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGACGGGCATTTTAGCAggg > 1:19665371/1‑96 (MQ=255) actTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGAtt < 1:7037669/97‑1 (MQ=255) actTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGACGGTCATTTTTGCAGGGtt > 1:2161624/1‑97 (MQ=255) ctTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTa < 1:10353832/97‑1 (MQ=255) ttAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTaa < 1:18002799/97‑1 (MQ=255) tAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGAAGGGCATTTTAGAAGGATTaaa > 1:3629389/1‑97 (MQ=255) aaCATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTTACGATTGAAGGTCATTTTTGCCGGATTtaaa > 1:17092779/1‑97 (MQ=255) aaCATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGACGGGCATTTTAGCAGGATTaaaa > 1:3288917/1‑97 (MQ=255) aCATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGACGGGCATTTTAGCAGGGTTtaaaa > 1:14016666/1‑96 (MQ=255) cATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGGATAGACGGGCATTTTGGCAGGGTTTAAAtt > 1:19263865/1‑97 (MQ=255) cATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAACATAGACGGGCATTTTAGGAGGATTaaaaat > 1:12114306/1‑95 (MQ=255) attaaattaaCTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGACGGGCATTTTAGCAGGATTAAAAATg > 1:11101105/1‑97 (MQ=255) attaaattaaCTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGAAGGTCATTTTAGCAGGGTTTAAAATg > 1:8159516/1‑97 (MQ=255) aaattaaCTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGACGGGCATTTTAGCAGGATTAAAATTGGCt > 1:20803619/1‑97 (MQ=255) aattaaCTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCtt < 1:15714040/97‑1 (MQ=255) aattaaCTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCtt < 1:17419817/97‑1 (MQ=255) aattaaCTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGACGGGCATTTTAGCAGGGTTTAAATTTGCtt > 1:8535331/1‑97 (MQ=255) attaaCTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTa < 1:2678321/97‑1 (MQ=255) attaaCTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTa < 1:10754455/97‑1 (MQ=255) attaaCTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAACATAAACGGGCACTTTAGCAGGGTTAAAAATGGCttt > 1:16581875/1‑96 (MQ=255) ttaaCTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATGAACCGGCATTTGGGCAAGCATAAAATTGGAttta > 1:6388613/1‑95 (MQ=255) aCTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGGTTTTTAAAATTGACGGTTCTTTGAGCAGGATTTAAAATTGTTTAAGGa > 1:4662337/1‑97 (MQ=255) cTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGACGGGCCTTTTAGCAGGATTAAAAATTGCTTTAggga > 1:2046957/1‑95 (MQ=255) ttATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAAt < 1:16502393/97‑1 (MQ=255) tataCAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAAtg < 1:16349063/97‑1 (MQ=255) ataCAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAAtgt < 1:8287809/97‑1 (MQ=255) taCAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGACGGGCATTTTAGCAGGGTTTAAATTTGGTTTAGGGAagtg > 1:15088581/1‑97 (MQ=255) taCAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGGCATTTTAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAAtgtg > 1:16078260/1‑97 (MQ=255) cAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGACGGGCATTTTAGCAGGATTAAAATTGGCTTTAGGGATGTGATATGaa > 1:1676777/1‑97 (MQ=255) cAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTTAGCATAGACGGGCATTTGAGCAGGATTTAAATTTGCTTAAGGAATGTGATATGaa > 1:5360564/1‑97 (MQ=255) aGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGGCATTTGAGCAGGGTTTAAATTTGGTTTAGGGATGTGATATGaaa > 1:6932156/1‑97 (MQ=255) tGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAAt < 1:4761344/97‑1 (MQ=255) tGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGGCATTTTAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAAt > 1:3767468/1‑97 (MQ=255) cTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTTAGCAGGATTAAAATTGGCTTTAGGAATGTGATATGAAAAATGa > 1:7552895/1‑97 (MQ=255) tCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACg < 1:19876248/97‑1 (MQ=255) tCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACg < 1:2313757/97‑1 (MQ=255) cAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGc > 1:1339666/1‑97 (MQ=255) agtagtAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCa < 1:8790178/97‑1 (MQ=255) agtagtAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCa < 1:9612032/97‑1 (MQ=255) agtagtAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCa < 1:9181329/97‑1 (MQ=255) agtagtAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCa > 1:18777224/1‑97 (MQ=255) agtagtAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGAAGCa > 1:1246984/1‑97 (MQ=255) agtagtAATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGGCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCa > 1:14208737/1‑97 (MQ=255) gtagtaATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAg < 1:13634005/97‑1 (MQ=255) gtagtaATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGTCCTTTGAGCAGGATTAAAATTGGGTTTAGGAATGTGATATGAAAAAAGACGCAg > 1:7822923/1‑97 (MQ=255) tagtaATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGa < 1:1525957/97‑1 (MQ=255) tagtaATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGa > 1:17619956/1‑97 (MQ=255) tagtaATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGGCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGAAGCAGa > 1:10611539/1‑97 (MQ=255) agtaATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGAc > 1:14976895/1‑97 (MQ=255) agtaATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGAc > 1:5512990/1‑97 (MQ=255) taATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAg < 1:4227032/97‑1 (MQ=255) taATGATGCTGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAg > 1:17724756/1‑97 (MQ=255) tgatgCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTa < 1:11519590/97‑1 (MQ=255) gCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACAcc < 1:14552386/97‑1 (MQ=255) cTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCg < 1:15841097/97‑1 (MQ=255) tGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGt > 1:20226527/1‑97 (MQ=255) tGATACGGCT‑GGTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCgg > 1:6503147/1‑96 (MQ=255) gATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGtt < 1:6622868/97‑1 (MQ=255) gATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGtt < 1:13200116/97‑1 (MQ=255) gATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGtt < 1:730509/97‑1 (MQ=255) aTACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGttt < 1:13878293/97‑1 (MQ=255) aTACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGttt > 1:950856/1‑97 (MQ=255) aTACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGttt > 1:14423910/1‑97 (MQ=255) aTACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGttt > 1:11290123/1‑97 (MQ=255) aCGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGTTTaa < 1:5842039/97‑1 (MQ=255) ggCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGTTTAAAt > 1:3897155/1‑97 (MQ=255) gCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGTTTAAATg < 1:15536143/97‑1 (MQ=255) gCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGTTTAAATg > 1:17198082/1‑97 (MQ=255) gCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGTTTAAATg > 1:11648269/1‑97 (MQ=255) cT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGTTTAAATGc > 1:9085177/1‑97 (MQ=255) gTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGTTTAAATGCaa > 1:5659899/1‑97 (MQ=255) ttttttAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGTTTAAATGCaat < 1:122009/97‑1 (MQ=255) | GTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTCAGTAGTAATGATGCTGATACGGCT‑GTTTTTTAAGCATAGACGGTCATTTGAGCAGGATTAAAATTGGCTTAAGGAATGTGATATGAAAAATGACGCAGACAGTTACACCGTTTAAATGCAAT > NC_000913/1678167‑1678359 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |