Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,417,946 | 0 | T | G | 34.6% | 493.8 / 102.1 | 260 | V289G (GTA→GGA) | yfcC | putative transporter YfcC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/114); new base G (90/0); total (146/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.60e-31 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 486 total aligned reads displayed.
ATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGAAATTGCCAGCCAGTTCTTCACCAT > NC_000913/2417850‑2418042 | aTCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGt < 1:17267562/97‑1 (MQ=255) aTCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGt < 1:1828930/97‑1 (MQ=255) tcttctGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGattg > 1:19183104/1‑97 (MQ=255) ttctGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTattgat < 1:9076881/97‑1 (MQ=255) tctGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTgttggtt > 1:15435329/1‑97 (MQ=255) tctGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTattgatt < 1:2915664/97‑1 (MQ=255) tctGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGCatttatt > 1:20652576/1‑97 (MQ=255) ctGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTattgattg < 1:9263759/97‑1 (MQ=255) ctGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGgttgattg > 1:18473253/1‑97 (MQ=255) tGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGgattgatttt > 1:13635845/1‑95 (MQ=255) tGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGt < 1:20072655/97‑1 (MQ=255) tGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGt > 1:7565070/1‑97 (MQ=255) gTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGgattgattttg > 1:2281691/1‑94 (MQ=255) gTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGgattgatttgc > 1:14669140/1‑94 (MQ=255) gTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTTTc > 1:9762608/1‑97 (MQ=255) tCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTcc < 1:5154848/97‑1 (MQ=255) cACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCt < 1:12493377/97‑1 (MQ=255) cACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCt > 1:8786519/1‑97 (MQ=255) cACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCt > 1:6141425/1‑97 (MQ=255) aCGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTGTTTTTTGtaccg > 1:17782673/1‑93 (MQ=255) gcgTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGAc < 1:16104186/97‑1 (MQ=255) gcgTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGGTTGATTTTCCTGaa > 1:11411173/1‑96 (MQ=255) cgTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGAcc < 1:19008885/97‑1 (MQ=255) gTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGGTTGATTTTCCCGGccg > 1:13480568/1‑97 (MQ=255) gTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTTCTCAccg > 1:3688144/1‑97 (MQ=255) aTGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGGTTGATTGTCCTGAccgccgg > 1:9538091/1‑96 (MQ=255) aTGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGAccgccgg > 1:4545956/1‑96 (MQ=255) ggAGCCCGCCCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTCCCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTa < 1:18601555/96‑1 (MQ=255) gAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTTCTTACCGCCGTaa > 1:10583046/1‑97 (MQ=255) gTCCGACCGTTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACACCGTCCG‑TTTCCCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATg < 1:7657014/97‑1 (MQ=255) gTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGGTTGATTGTTCTGACCGCCGCAATg > 1:6944806/1‑97 (MQ=255) cgccccGCTTTTTTCGTGAAAAGCAGGCGGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGt < 1:13745045/93‑1 (MQ=255) ccGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTTATTTTCCTGACCGCCGCTATggg > 1:14451498/1‑96 (MQ=255) ccGACCGCTTCTTTCGTAAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTCCCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGt < 1:10845952/97‑1 (MQ=255) cGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTggg < 1:6300708/97‑1 (MQ=255) gCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGGTTGTTCTGAACGCCCTAATGGGCTgggg > 1:12686827/1‑96 (MQ=255) gCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTgggg > 1:13944998/1‑96 (MQ=255) gCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCCCCCTAAAGGTCTgggg > 1:6468083/1‑96 (MQ=255) gCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGAACGCCGTAATGGGCTtggg > 1:17064713/1‑96 (MQ=255) cttcttTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGTATGATTGTTCTGACCGCCCGAATGGTCTggggg > 1:11230085/1‑95 (MQ=255) cttcttTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTTTCCTGACCGCCGTAATTGGTTGGGTg > 1:1411351/1‑97 (MQ=255) ttcttTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGGTTTTCCTGACCGCCCGAATGGTCTGGGGGa > 1:17354560/1‑97 (MQ=255) tttCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGAttt < 1:4709777/97‑1 (MQ=255) tCGTGAAAAGCGGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTgg < 1:19723914/97‑1 (MQ=255) cgggAAAAGCAGGCTGATGTTAAACAACGCCCG‑TTTCCCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTggg < 1:3288545/94‑1 (MQ=255) cGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTggg < 1:20408732/97‑1 (MQ=255) cGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGATTTggg > 1:20906072/1‑97 (MQ=255) cGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGGTTTggg > 1:6728077/1‑97 (MQ=255) gTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCCTAATGGTCTGGGGGATTTgggg > 1:9919517/1‑97 (MQ=255) gTGAAAAGCAGGCGGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTCCCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTgggg < 1:18863067/97‑1 (MQ=255) tGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGGTTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGGTTTGGGGc > 1:10274448/1‑97 (MQ=255) aaggCAGGCTGATGTTGACCAACGTCCG‑TTTACCTTGGGTGACGGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTg < 1:418383/94‑1 (MQ=255) aaaGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGGTTGATTTTCCTGACCGCCGGAATGGTCTGGGGGGTTTGGGGCGTg > 1:18193664/1‑97 (MQ=255) aGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGGTTGTCCTGAACGCCGGAATGGTCTGGGGGGTTTTGGGGGGGAt > 1:3046555/1‑97 (MQ=255) gCAGGCTGATGTTGAACAACTTCCT‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATc < 1:3426445/97‑1 (MQ=255) cAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGATTTGGGGCGGGATCg > 1:15700980/1‑97 (MQ=255) aGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGGTTGTCCTGACCGCCGGAATGGGCTGGGGGATTTTGGGCGTGGTCGt > 1:16045015/1‑97 (MQ=255) ggCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGGTTTTGGGGGTGgttgtt > 1:13020974/1‑97 (MQ=255) ggCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGATTTGGGGCGTGGTCGtt > 1:19931694/1‑97 (MQ=255) cTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGATTTGGGGCGTGATCGTTaa > 1:5353060/1‑97 (MQ=255) tGATGTTGACCAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAAt < 1:12401692/97‑1 (MQ=255) tGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGGTTTGGGGCGTGATCGTTAAt > 1:4081905/1‑97 (MQ=255) gATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTTGGTGGTTTTGGGGGTGATCGTTTATg > 1:2104722/1‑97 (MQ=255) gATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGATTTGGGGCGTGATCGTTAATg > 1:18405153/1‑97 (MQ=255) gATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGGAATGGGCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATg > 1:10126693/1‑97 (MQ=255) gTTGACCAACGTCCT‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑t < 1:20238156/97‑1 (MQ=255) gTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑t < 1:7858310/97‑1 (MQ=255) tGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGGC‑Tgg > 1:5239518/1‑97 (MQ=255) gAACACCGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGt < 1:15286324/97‑1 (MQ=255) gAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGGCTGGGGGGTTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑Tggg > 1:15877424/1‑96 (MQ=255) aacaacGTCCG‑TTTACTTTTGGTGACTGGGTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGtt < 1:12814248/97‑1 (MQ=255) acaccGCCCT‑TTTACTTTTGGTGCGTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGttt < 1:6888550/97‑1 (MQ=255) acaacGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCCTAATGGTCTGGGGGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGgtt > 1:8132994/1‑97 (MQ=255) acaacGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGGTTTTGGGCGGGATCGTTAATGCC‑TGGgtt > 1:7078590/1‑97 (MQ=255) caccGTCCT‑TTTACCTTTGGTGACTGGTTGGTTTTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTa < 1:18001590/94‑1 (MQ=255) caacGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGGTTTGGGGCGGGATCGTTAATGGC‑TGGGTTa > 1:8385006/1‑97 (MQ=255) accGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGTTATTGATTTTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTAt < 1:7364017/95‑1 (MQ=255) aacGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGATTTTGGGCGGGATCGTTTATGCC‑TGGTTTAt > 1:11884131/1‑97 (MQ=255) ccttcct‑tttcctttGGGTGACTGGCTGGTATTGATTGCCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTAtt < 1:1099718/94‑1 (MQ=255) ccGTCCG‑TTTCCCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTAtt < 1:4876395/96‑1 (MQ=255) acGTCCGTTTTCCCTTTGGTGCCTGGCTGGTATTGATGGCCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTAt < 1:19501695/97‑1 (MQ=255) cttCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTc < 1:10044250/95‑1 (MQ=255) gTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTcc > 1:4910204/1‑97 (MQ=255) ccG‑TTTACCTTTGGTGACGGGCTGGTATTGATTGTCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAg < 1:15082469/97‑1 (MQ=255) gg‑TTTCCTTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGa < 1:14795637/96‑1 (MQ=255) cG‑TTTACTTTTGGGGACGGGCTGGTATTGATTGTCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGa < 1:580214/97‑1 (MQ=255) cG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGa < 1:15621456/97‑1 (MQ=255) g‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGGGATCGTTAATGCA‑TGGTTTATTCCAGaa > 1:8600681/1‑97 (MQ=255) g‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGGGATCGTTAATGCC‑TGGTTTTTTCCAGaa > 1:16491840/1‑97 (MQ=255) g‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGGTTTGGGGCGTGATCGTTAATGCCTTGGTTTTTTccgaa > 1:16762501/1‑94 (MQ=255) ttttCCCTTTGGTTACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGaa < 1:268331/96‑1 (MQ=255) tttACCTTTGGTGACTGGCTGGGATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGGGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGGTTTTTCCAGgaa > 1:19440143/1‑97 (MQ=255) ttgggTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGAAATTgcca < 1:13338845/94‑1 (MQ=255) tGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGAAATTgccagc > 1:12000247/1‑97 (MQ=255) gTGACGGGTTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGAAATTgccagcca < 1:1166539/97‑1 (MQ=255) tgcctggcttgTTTTAGTTGTCCTCACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGAAATTGccagccag < 1:2488842/94‑1 (MQ=255) tgtggctgtTATGAGTTGTCTTAACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGAAATTGCCAGCCAGtt < 1:3819365/95‑1 (MQ=255) gctgtTATTGATTCCCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGAAATTGCCAGCCAGttcttc < 1:16277139/97‑1 (MQ=255) tggTATTGATTGTCCTGCCCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGAAATTGCCAGCCAGTTCTTCAc < 1:719298/97‑1 (MQ=255) gTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGAAATTGCCAGCCAGTTCTTCACCa > 1:10466494/1‑97 (MQ=255) | ATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG‑TTTACCTTTGGTGACTGGCTGGTATTGATTGTCCTGACCGCCGTAATGGTCTGGGTGATTTGGGGCGTGATCGTTAATGCC‑TGGTTTATTCCAGAAATTGCCAGCCAGTTCTTCACCAT > NC_000913/2417850‑2418042 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |