Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,840,748 | 0 | G | C | 38.9% | 37.6 / 20.4 | 36 | A409P (GCC→CCC) | ascF | beta‑glucoside specific PTS enzyme IIBC component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (9/13); new base C (0/14); total (9/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.01e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GCGTTATATGGCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTCGCGGTCATG > NC_000913/2840652‑2840843 | gCGTTATATGGCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g < 1:5663953/97‑1 (MQ=255) gCGTTATATGGCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g < 1:7654245/97‑1 (MQ=255) gCGTTATATGGCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g < 1:19701464/97‑1 (MQ=255) cGTTATATGGCGTGGCGATCCGCTTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g‑c < 1:20096736/97‑1 (MQ=255) gTTATGTGTGGTGGCGATCCGCCTGAACCGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g‑cc < 1:7025967/97‑1 (MQ=255) gTTATATGGCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g‑cc < 1:8925016/97‑1 (MQ=255) gTTATATGGCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g‑cc < 1:13477447/97‑1 (MQ=255) gTTATATGGCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g‑cc < 1:7089438/97‑1 (MQ=255) tataTGGCGTGGCGATCGGCCTGAACCGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g‑ccag < 1:4188243/97‑1 (MQ=255) atatGGCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g‑ccagc < 1:14966900/97‑1 (MQ=255) atatGGCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g‑ccagc < 1:5795871/97‑1 (MQ=255) atatGGCGTGGCGACCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g‑ccagc < 1:18604436/97‑1 (MQ=255) atGTCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g‑ccagcca < 1:20610614/97‑1 (MQ=255) atGGCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑g‑ccagcca < 1:17907964/97‑1 (MQ=255) tggcgtggcgATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCGG‑G‑CCAGCTAc > 1:2256094/1‑97 (MQ=255) tggcgATCCGCCGGAAACTTCCGCTTATCGCGAGTTTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAAt < 1:17480646/97‑1 (MQ=255) gtggtCCGCGTGAATCGCCCGTTTATCGCCATTCTTATCAGCGGTTTTTTTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATgg < 1:20786974/93‑1 (MQ=255) aaTCCGCTGGAAACGTCCCCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCa < 1:9158135/96‑1 (MQ=255) aTCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GCGGGG‑GGGT‑G‑CCGGCCACCCAATGGCa > 1:18407557/1‑97 (MQ=255) cccGCCTGAACCGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAgc < 1:2282086/96‑1 (MQ=255) tGAAACTTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCggg < 1:20964514/97‑1 (MQ=255) gAAACGTCTGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTTTTTGC‑GGCGCGGTGGCTGGTAGG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCgggg < 1:15138621/97‑1 (MQ=255) aaccGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTGGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGc < 1:7319633/94‑1 (MQ=255) gTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGTTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTAGG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTAtt < 1:15671670/97‑1 (MQ=255) cgccTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTa < 1:15443672/94‑1 (MQ=255) cGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTAc < 1:1152808/97‑1 (MQ=255) tctgaTCCCCAGTCTCATCGGCGCTTTTCTTGGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCACCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTAcc < 1:1663897/93‑1 (MQ=255) tttATGGCCGGTCTATCCAGCGGTTTATTTTGC‑GGCGGGGTTGCCGGTAGG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCa < 1:15136683/96‑1 (MQ=255) tttATCGCCAGTCTTACCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTAGG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCa < 1:7843640/96‑1 (MQ=255) ccGCCATTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGGGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGt < 1:12540387/96‑1 (MQ=255) ggCCTGTCTTGTCAGCTTTTTTTTGGGC‑GGCGCGTTTGCGGGTATG‑GC‑GGG‑GCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTg < 1:7620864/96‑1 (MQ=255) cGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTGGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTg < 1:12826979/97‑1 (MQ=255) gCCAGTTTTATCAGCGTTTTTATTGGG‑GGCGGGGTGGCGGGTAGG‑GC‑GGG‑CCTG‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGc < 1:17443900/97‑1 (MQ=255) cAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAg < 1:4491790/97‑1 (MQ=255) aGTTTTATCAGGGGTTTTATTGGC‑GGCGGGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GTTG‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGt < 1:5427819/97‑1 (MQ=255) gttttATCAGCGGTTTTTTTGGC‑GCCGCGTTTGCCGGTATG‑GG‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGtt < 1:7966935/94‑1 (MQ=255) gTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTGTG‑GC‑GGG‑TCTT‑C‑CCAGCCACTCGATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGtt < 1:17737368/97‑1 (MQ=255) tCTTATCCGGTGTTTTTTGGGC‑GGGGGGGTTCCAGGTATG‑GC‑GGG‑GTTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGttc < 1:4984356/97‑1 (MQ=255) tCTTATCAGCGGTTTT‑TTTGCGGGCGCGTTTGCCGGTAGG‑GC‑GGG‑CCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGttc < 1:18635387/97‑1 (MQ=255) tttATCGGCGTTTTTATTTGC‑GGCGGGGTTGCCGGTAGG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGttct < 1:10305648/96‑1 (MQ=255) tttATCAGCGTTTTTTTTGGC‑GGCGCGTTTGCGGGTAGG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGttct < 1:18769995/96‑1 (MQ=255) cTTATCGGCGGTTTTATTGGC‑GCCGCGTTTGCCGGTAGG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGttct < 1:17988697/97‑1 (MQ=255) ttATCGGCGTTTTTTTTGGC‑GGCGCGGTTGCCGGTAGG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGttctt < 1:17130255/97‑1 (MQ=255) ttATCGGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTGTG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGttctt < 1:8601003/97‑1 (MQ=255) ttATCAGCGGTTTTATTGGC‑GGCGCGTTTGCGGGTAGG‑GC‑GGG‑GCTG‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGttctt < 1:19079021/97‑1 (MQ=255) tATCGGCGTTTTTTTTTGC‑GGCGCGGTTCCCGTTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGttcttc < 1:671145/97‑1 (MQ=255) ttCAGGGGTTTGTTTTGC‑GGTGC‑GTTCGCGGTGTG‑GG‑GGGCGCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCg < 1:6908239/96‑1 (MQ=255) atgaGCGTTTTCATTGGG‑GGCGGGGTTGCGGTTATG‑GC‑GGG‑CCTG‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCg < 1:182395/94‑1 (MQ=255) aTCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGTTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCg < 1:11556541/97‑1 (MQ=255) tCAGCGTTTTTATTTGC‑GGCGCGTTTGCCGGTAGG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGa < 1:1982914/97‑1 (MQ=255) aGCTGTTTTATTTGG‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATc < 1:7622656/97‑1 (MQ=255) aGCGTTTTTATTGGG‑GGCGCGTTTGCCGGTAGG‑GG‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATc < 1:6029102/97‑1 (MQ=255) gCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGTTATG‑GC‑GGG‑GCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATcc < 1:4583518/97‑1 (MQ=255) ccgtttttATTGGC‑GGGCGGGTTGCCGATTTG‑GC‑GGG‑CCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATcc < 1:4765629/93‑1 (MQ=255) gtgTTTTTTTTGC‑GGCGCGGTGCCCGTTATG‑GC‑GGT‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCg < 1:4427715/95‑1 (MQ=255) ggtttttttttGG‑GGCGCGTTTGCGGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCg < 1:9310401/94‑1 (MQ=255) ggtttttATTGGC‑GGCGGGGTTCCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTG‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCg < 1:19747819/94‑1 (MQ=255) cgtttttttTCGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTG‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCg < 1:11487429/94‑1 (MQ=255) cGGTTTTATTGGG‑GGCGCGTTTGCCGGTGTG‑GG‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCg < 1:13459297/97‑1 (MQ=255) tttttttTGGG‑GGCGCGGTTGCGGGTTTG‑GG‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGc < 1:17933998/96‑1 (MQ=255) gTTTTTTTGGG‑GGCGCGTTGCCCGTTAGG‑GC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGc < 1:19227716/97‑1 (MQ=255) tttGC‑GGCGGGTTTGCGGGTAGG‑GC‑GGG‑CCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATcc < 1:13989921/97‑1 (MQ=255) tgcc‑ggcgCGG‑GGCCGGTTTGCGG‑GGG‑CCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCa < 1:2619895/94‑1 (MQ=255) gc‑ggcgGGTTTGCCGTTAGG‑GG‑GGG‑CCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAAt < 1:16044664/97‑1 (MQ=255) gc‑ggcgGGGTTGCCGGTGTG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAAt < 1:4749821/97‑1 (MQ=255) gc‑ggcgCGGTTGCCTGTAGG‑GG‑GGG‑TCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAAt < 1:6355022/97‑1 (MQ=255) gcgcGGTTGCGGTTATG‑GG‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAg < 1:1247581/97‑1 (MQ=255) gcgcGGTGGCCGTTATG‑GC‑GGC‑GCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGGCGGGGCTATTTACCAGCGTGCATTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAg < 1:3555854/97‑1 (MQ=255) cgcgTTTCCCGGTGGG‑GG‑GGG‑CCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGc < 1:9074246/97‑1 (MQ=255) cgcgGTTGCTGGTGGG‑GG‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGc < 1:12747981/97‑1 (MQ=255) gcgGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑CCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCa < 1:17316182/97‑1 (MQ=255) cgtttGCGGGTATG‑CG‑GGG‑GCTG‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCAt < 1:4811942/94‑1 (MQ=255) ggTTGGCGGTTAG‑GT‑GGG‑GCTT‑GCCCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCAt < 1:1513694/97‑1 (MQ=255) ggTTGCGGGTAGG‑GC‑GGG‑CCTG‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATc < 1:8140881/97‑1 (MQ=255) gtgcccGGTGGG‑GC‑GGC‑GCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCg < 1:16775181/93‑1 (MQ=255) gcgggTGTG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCt < 1:4870681/94‑1 (MQ=255) gCCGTTAGG‑GG‑GGG‑CCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCt < 1:3101945/97‑1 (MQ=255) ccGGTTTG‑GG‑GGG‑GCTTCC‑CCAGCCACTCAATGGCAGCCCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCt < 1:5908884/97‑1 (MQ=255) ccGGTTGG‑GC‑GGG‑GCTC‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTg < 1:6198374/97‑1 (MQ=255) cGGGATG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTgg < 1:15724548/97‑1 (MQ=255) gTATG‑GG‑GGT‑GCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGgt < 1:11981113/97‑1 (MQ=255) tG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGGGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGtt > 1:4066375/1‑97 (MQ=255) gg‑gC‑GGG‑CCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGtt < 1:5864997/96‑1 (MQ=255) g‑gC‑GGG‑GCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTc < 1:3683423/97‑1 (MQ=255) gtggggg‑gCCT‑GCCCATCCACTCAATGGCAGCGCCGGGTCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGgtgt < 1:11644206/93‑1 (MQ=255) ggggggg‑gCTT‑TCCCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGgtgt < 1:16769855/93‑1 (MQ=255) gC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGCATCCAATGGGGATCGTCTGGGGGtttg > 1:19636555/1‑95 (MQ=255) gC‑GGG‑GCTC‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTcg < 1:12264106/97‑1 (MQ=255) ggggg‑gCTG‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTcg < 1:6506684/95‑1 (MQ=255) gggg‑gCTT‑C‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTcgc < 1:4769165/96‑1 (MQ=255) gggg‑gCCT‑GCCCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTcg < 1:1487814/96‑1 (MQ=255) ggg‑gCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGGGGTcgcg > 1:11903035/1‑97 (MQ=255) gg‑gCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTCGCgg > 1:1796822/1‑97 (MQ=255) g‑gCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTTGATCAGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGGGGTTGCGGt > 1:7990231/1‑97 (MQ=255) g‑gCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGGGTTCGCGGt > 1:3387027/1‑97 (MQ=255) g‑gCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGGGTTCGCGGt > 1:15844540/1‑97 (MQ=255) cTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTCGCGGTCa > 1:2352565/1‑97 (MQ=255) tt‑G‑CCAGTCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTCGCGGTCAt < 1:12718685/97‑1 (MQ=255) tcg‑ccagccaCTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTCGCGGTCAt < 1:19633932/95‑1 (MQ=255) t‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTCGCGGTCATg > 1:8602827/1‑97 (MQ=255) | GCGTTATATGGCGTGGCGATCCGCCTGAAACGTCCGCTTATCGCCAGTCTTATCAGCGGTTTTATTTGC‑GGCGCGGTTGCCGGTATG‑GC‑GGG‑GCTT‑G‑CCAGCCACTCAATGGCAGCGCCGGGGCTATTTACCAGCGTGCAGTTCTTCGATCCGGCGAATCCAATGAGCATCGTCTGGGTGTTCGCGGTCATG > NC_000913/2840652‑2840843 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |