| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,130,379 | 0 | A | C | 33.0% | 715.6 / 38.9 | 285 | V162G (GTA→GGA) | flgA | flagellar basal body P‑ring formation protein FlgA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (150/41); new base C (1/93); total (151/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.15e-41 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 361 total aligned reads displayed.
TTCTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCA > NC_000913/1130283‑1130475 | ttCTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTa > 1:19971761/1‑97 (MQ=255) tCTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTAc < 1:8005725/97‑1 (MQ=255) tCTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTAc < 1:18871567/97‑1 (MQ=255) tgtgCGGCGGCTGCATTGCTCAGGTGCGGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTAccc < 1:3602250/97‑1 (MQ=255) tgtgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTAccc > 1:4667593/1‑97 (MQ=255) gtgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCg < 1:3255492/97‑1 (MQ=255) tgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGc > 1:8567084/1‑97 (MQ=255) tgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGc > 1:15068079/1‑97 (MQ=255) cGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCa < 1:16714071/97‑1 (MQ=255) cGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCa > 1:9476704/1‑97 (MQ=255) ggCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGcc > 1:1123622/1‑97 (MQ=255) gCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCt > 1:12880158/1‑97 (MQ=255) tGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTgg > 1:13664439/1‑97 (MQ=255) gctttGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAACCCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGc < 1:7052922/94‑1 (MQ=255) gCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGc > 1:16173789/1‑97 (MQ=255) gCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGc > 1:4983339/1‑97 (MQ=255) gCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTGGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGc < 1:15701040/97‑1 (MQ=255) tGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGaac > 1:15447144/1‑96 (MQ=255) tGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCAACGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGaaa > 1:19841702/1‑97 (MQ=255) ttCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACt > 1:9104991/1‑97 (MQ=255) cAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAACCCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTgg < 1:4207454/97‑1 (MQ=255) gcgcCTGCCCTTCTGCGTTGGCGCTAACCCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGt < 1:9044032/97‑1 (MQ=255) gcgcCTGACCTTCTGCTTTGGCGCTAAACCCATCCCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGt < 1:20348285/97‑1 (MQ=255) gcCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTa > 1:2146316/1‑97 (MQ=255) cTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAACCCCATCCCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAAc < 1:20695539/97‑1 (MQ=255) tgcccTTCTGCGTTGGCCCTAACCCCATCCCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGCCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACt < 1:18124545/94‑1 (MQ=255) gACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTg > 1:10392434/1‑97 (MQ=255) gACCTTCTGCGTGGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTg < 1:8145221/97‑1 (MQ=255) cccTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCCCCGCTGGCGATCACATTGACGCTTTGCCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTgg < 1:5935416/96‑1 (MQ=255) aCCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTgg > 1:6489535/1‑97 (MQ=255) ttCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATa > 1:12348980/1‑97 (MQ=255) ttCGGCTTTGGCGCAAACCCCATCCCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATa < 1:4116331/97‑1 (MQ=255) tCTGCGTTGCCCCTAAACCCACCCCCGCTGGCGATCTCATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAg < 1:4405722/97‑1 (MQ=255) tGCGTGGGCGCAAAACCCATCCCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGt < 1:17318219/97‑1 (MQ=255) gCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGtt > 1:9232677/1‑97 (MQ=255) gCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGtt > 1:12224716/1‑97 (MQ=255) gTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGa > 1:6915840/1‑97 (MQ=255) gTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGa > 1:610164/1‑97 (MQ=255) gTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGa > 1:16054224/1‑97 (MQ=255) tgggCGCTAACCCCATCCCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGT‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGAt < 1:14340508/95‑1 (MQ=255) gggCGCAAACCCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGCCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATc < 1:674280/96‑1 (MQ=255) ggCGCTAACCCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCg < 1:6224288/97‑1 (MQ=255) gcgtTAACCCCCTCCCCGCGGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCgg < 1:18765030/97‑1 (MQ=255) cgcTAACCCCATCGCCGCTGGCGATCACATTGCCGCGTTGCCCCGT‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCggg < 1:4012709/97‑1 (MQ=255) cgcTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCggg > 1:10582819/1‑97 (MQ=255) cgcTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCggg > 1:19155320/1‑97 (MQ=255) tAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGa > 1:18531133/1‑97 (MQ=255) aaccccATCCCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGAt < 1:14472005/94‑1 (MQ=255) aaaCCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGAt > 1:19362735/1‑97 (MQ=255) aaaCCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGAt > 1:4922533/1‑97 (MQ=255) aaCCTATCCCCGCTGGCGATCATATTCCCCGGTTGCCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATa < 1:3154635/97‑1 (MQ=255) ccATCCCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGCCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGAt < 1:14952045/97‑1 (MQ=255) cATCCCCGCTGGCGATCACATTGACGCTTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATc < 1:14637751/97‑1 (MQ=255) cATCCCCGCTGGCAATCCCATTGACGCGTTGCCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATc < 1:15563836/97‑1 (MQ=255) cATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATc < 1:15778030/97‑1 (MQ=255) aTCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATcg > 1:10999575/1‑97 (MQ=255) aCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCgcgc > 1:13024703/1‑97 (MQ=255) aCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCgcgc > 1:9537596/1‑97 (MQ=255) cgcgGGCGATCACATTGACGCTTTCGCCCGT‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAg < 1:17985296/97‑1 (MQ=255) cGCTGGCGATCACATTGACGCTTTGCCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAg < 1:6721769/97‑1 (MQ=255) gCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAgg > 1:5805044/1‑97 (MQ=255) cggggCGATCACATGGACGCTTTGCCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAgg < 1:10213604/94‑1 (MQ=255) tGGCGATCACATTGCCGCTTTTCCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCt < 1:19693579/97‑1 (MQ=255) tGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCt > 1:1281168/1‑97 (MQ=255) tGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCt > 1:17151019/1‑97 (MQ=255) ggCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTa > 1:9748786/1‑97 (MQ=255) cGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAAt > 1:10751341/1‑97 (MQ=255) cGATCACATTGACGCGTTGTCCCCC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAAt < 1:15742109/97‑1 (MQ=255) cGATCACATCGCCGCGTTGCCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAAt < 1:2557696/97‑1 (MQ=255) gATCACATTGACGCTTTGCCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATg < 1:11511287/97‑1 (MQ=255) gATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGCTAGGTTGGTCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATg > 1:8438763/1‑97 (MQ=255) aTCACATTCACCCGTTGCCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATgg < 1:20947854/97‑1 (MQ=255) cacaTTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGGTGATCGGGTGATAGGTCGCGCAGGCTAATGGCa > 1:17654881/1‑97 (MQ=255) acaTGGCCGCGTTGTCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCAt < 1:2784484/97‑1 (MQ=255) caTTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATc > 1:2983655/1‑97 (MQ=255) caTTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATc > 1:2595741/1‑97 (MQ=255) aTTGACGCGTTGTCCCTC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATca < 1:19533631/97‑1 (MQ=255) aTTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATca > 1:13371628/1‑97 (MQ=255) ttGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATcaa > 1:390307/1‑97 (MQ=255) aCGCGTTGCCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATcaacaa < 1:1199608/97‑1 (MQ=255) gcggTTGCCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAg < 1:16415284/94‑1 (MQ=255) cgcgTTGTCCCGT‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAg < 1:17494776/97‑1 (MQ=255) gcgTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGt > 1:2409378/1‑97 (MQ=255) cgTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGtt > 1:18341944/1‑97 (MQ=255) gTTGCCCTGC‑TTTCACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttg < 1:3104406/97‑1 (MQ=255) tgccccGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgat < 1:20580598/94‑1 (MQ=255) tGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgat > 1:11784841/1‑97 (MQ=255) ggcccGCTTTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgat < 1:5406080/95‑1 (MQ=255) tCCCGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgattg < 1:7380833/97‑1 (MQ=255) tCCCGC‑TTGTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgattg < 1:10003327/97‑1 (MQ=255) ccccGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgattg < 1:16219555/96‑1 (MQ=255) cccGC‑TTTTCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgattga < 1:7769115/97‑1 (MQ=255) ccGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTtgattgat < 1:8820868/97‑1 (MQ=255) cGC‑TTTACCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGata < 1:17347639/97‑1 (MQ=255) cgtttttCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGata < 1:7601876/94‑1 (MQ=255) gtttttACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGatat < 1:19033815/95‑1 (MQ=255) c‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCCACAAGTTGATTGATATc > 1:20144303/1‑97 (MQ=255) ttttACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATcc > 1:6307777/1‑97 (MQ=255) ttttACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATcc > 1:3754163/1‑97 (MQ=255) tttCCCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCa < 1:3521710/97‑1 (MQ=255) | TTCTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGC‑TTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCA > NC_000913/1130283‑1130475 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |