| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,303,379 | Δ11 bp | coding (481‑491/921 nt) | oppB → | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppB |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1303379 | 1303389 | 11 | 894 [0] | [0] 886 | oppB | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1303378 | 0 (0.000) | 857 (0.990) | 188/196 | 0.0 | 100% | coding (480/921 nt) | oppB | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppB |
| ? | NC_000913 | 1303390 = | 0 (0.000) | coding (492/921 nt) | oppB | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppB | |||||
Only 100 of 899 total aligned reads displayed.
TGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1303277‑1303378‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATGATATTGCCGATGGTGGCGTTGTCACTCGCTTATATCGCCAGTATTGCGCGTATTACCCGTGGCTCTATG > NC_000913/1303390‑1303489 GGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGG < 1:3380464/101‑1 GGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGG > 2:3057573/1‑101 GGACCATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGT < 2:17718015/101‑1 GACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGTG > 1:20580128/1‑101 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |