Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,995,413 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (‑54/‑239) | uvrY ← / → yecU | DNA‑binding transcriptional activator UvrY/protein YecU |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1427599 = | NA (NA) | 806 (0.930) | 184/196 | 0.0 | 100% | noncoding (1196/1196 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1995416 | 0 (0.000) | intergenic (‑57/‑239) | uvrY/yecU | DNA‑binding transcriptional activator UvrY/protein YecU | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1428794 | NA (NA) | 864 (0.970) | 194/200 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1196 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | 1995413 = | 0 (0.000) | intergenic (‑54/‑242) | uvrY/yecU | DNA‑binding transcriptional activator UvrY/protein YecU |
Only 100 of 864 total aligned reads displayed.
TCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1428695‑1428794 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCACGCCC > NC_000913/1995413‑1995512 TCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:3091548/101‑1 CACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:18872068/101‑1 CACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:6213751/1‑101 CACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGACGAATATGATGATCTCACATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:20179885/101‑1 ACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:9469925/101‑1 CTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 2:16322161/101‑1 CTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAG > 2:27671/1‑101 CTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAG > 1:7424300/1‑101 TATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGC > 2:17248285/1‑101 TATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGC < 1:17472820/101‑1 ATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCG > 2:10875229/1‑101 TCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGG < 2:10105690/101‑1 CGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGT < 2:10518664/101‑1 GGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTT < 2:14199726/101‑1 CGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTT < 2:17617394/101‑1 GAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTT < 2:2470743/101‑1 AGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTAT > 2:7705103/1‑101 GGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATT < 2:6762521/101‑1 GAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCA < 2:4871357/101‑1 GAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCA < 1:15873150/101‑1 GAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCA > 2:11724295/1‑101 AGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAA < 2:20378951/101‑1 GTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAAC > 2:9046983/1‑101 GTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAAC < 2:11385313/101‑1 GTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAAC > 2:18074916/1‑101 TTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACT < 1:6603711/101‑1 CTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAAC < 1:10875229/101‑1 TCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACG < 1:11331437/101‑1 TCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACG < 2:13399813/101‑1 ATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTn < 1:13403464/101‑2 ATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTT < 1:14993947/101‑1 ATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTT < 1:3876620/101‑1 TGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTA > 1:11889491/1‑101 TGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTA < 2:5636219/101‑1 ATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAA < 2:19201859/101‑1 TGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTGCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGCAACGTTAAAA > 1:2777858/1‑101 GTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAA > 1:14513590/1‑101 GTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAA > 1:8071736/1‑101 TCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAAT < 2:16691153/101‑1 CCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGG > 1:14093161/1‑101 CCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGG < 1:918771/101‑1 CTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGT < 2:19488851/101‑1 TCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTG > 2:8683361/1‑101 TGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGG < 2:15608640/101‑1 TGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGG < 1:19943276/101‑1 gcATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTA < 1:19647502/99‑1 GGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTA > 1:10481651/1‑101 GGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTA < 1:18907484/101‑1 GATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTAT < 1:15267257/101‑1 GATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTAT < 1:5232516/101‑1 GCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCG > 1:16397457/1‑101 CGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGA < 2:5269317/101‑1 GCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGAT > 1:7851032/1‑101 GCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGAT < 1:10062835/101‑1 CTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATT < 2:9711796/101‑1 CCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTT < 1:17271715/101‑1 GGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTC > 1:16964503/1‑101 TGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCT > 1:8476670/1‑101 GAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTC > 1:6260584/1‑101 AATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCG > 1:8899089/1‑101 TATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTT < 1:7221752/101‑1 TATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTT > 2:5934906/1‑101 TATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTT > 2:1602863/1‑101 TATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTT < 2:12678777/101‑1 ATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTT < 2:1697575/101‑1 TGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTT > 1:4362274/1‑101 TGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTT < 1:20225375/101‑1 TGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCACACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTT < 2:7157711/101‑1 ATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTG < 2:2106468/101‑1 TGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGT > 1:5552075/1‑101 TGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGT > 2:1468246/1‑101 TCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATT > 2:12169970/1‑101 TATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGA > 1:6772973/1‑101 TATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGA > 1:20619491/1‑101 ATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGAT < 1:13766696/101‑1 TCAGGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATT < 1:19220634/101‑1 GGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTC < 2:4061799/101‑1 GGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTC > 2:13801261/1‑101 GGAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTC < 1:12550384/101‑1 GAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCC > 2:3758331/1‑101 GAACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCC < 2:13124929/101‑1 AACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCA > 2:4593229/1‑101 AACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCA > 2:1510009/1‑101 ACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTAAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCAC > 1:3510559/1‑101 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TCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGCTCCGGATGAATATGATGATCTCATATCAGGAACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1428695‑1428794 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCACGCCC > NC_000913/1995413‑1995512 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |