| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,368,009 | Δ802 bp | [aspA]–[fxsA] | [aspA], [fxsA] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4368009 | 4368810 | 802 | 952 [0] | [0] 954 | [aspA]–[fxsA] | [aspA],[fxsA] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4368008 | 0 (0.000) | 943 (1.060) | 189/200 | 0.0 | 100% | coding (320/1437 nt) | aspA | aspartate ammonia‑lyase |
| ? | NC_000913 | 4368811 = | 0 (0.000) | coding (148/477 nt) | fxsA | protein FxsA | |||||
Only 100 of 943 total aligned reads displayed.
TTGTTAACATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4367909‑4368008‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCCAGCGGCGGAGATGATTAAAAGTGTTTCGCTGATCATTGCTGGTT > NC_000913/4368811‑4368910 TTGTTAACATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTC < 1:20417177/101‑1TTGTTAACATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTC < 2:5706081/101‑1TTGTTAACATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTC < 1:9571572/101‑1 GTTAACATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAG < 1:4868724/101‑1 TTAACATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGG < 2:13946100/101‑1 TAACATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGG > 1:12042585/1‑101 TAACATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGG < 2:11750303/101‑1 ACATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCT > 1:10242433/1‑101 ACATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCT < 1:15569554/101‑1 ATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTT > 2:18155943/1‑101 TGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTA < 1:15884081/101‑1 GGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAA > 2:5083303/1‑101 GTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAG < 1:3974272/101‑1 TCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGA < 1:14502286/101‑1 TCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGA < 1:1894198/101‑1 GTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAAT > 1:13476761/1‑101 GTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAAT > 2:3703877/1‑101 GTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAAT < 2:4685344/101‑1 TCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTT > 1:11843139/1‑101 CGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTC < 1:13750811/101‑1 CGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTC < 2:19728165/101‑1 GGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCG > 2:9635487/1‑101 GGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCG > 1:3041331/1‑101 GGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCG < 2:7030792/101‑1 GGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGT > 2:12995359/1‑101 GGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGT > 1:15297330/1‑101 GTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTG > 1:1002119/1‑101 TTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGC < 2:6704466/101‑1 GTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATG > 2:14851592/1‑101 GTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATG < 2:10243637/101‑1 ACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCA > 1:10730011/1‑101 CTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAG < 1:16692442/101‑1 ATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAA > 2:623183/1‑101 TTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAA > 1:3560656/1‑101 TCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAA > 1:3285422/1‑101 TCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAA > 2:167816/1‑101 CACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAAT < 2:15215521/101‑1 CCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGG > 2:2720333/1‑101 TTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCG > 1:20077552/1‑101 TTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGC > 1:17963051/1‑101 TTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGC < 1:16268913/101‑1 GGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGG < 2:15870477/101‑1 GGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGG < 2:9442862/101‑1 GGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGG > 2:17340576/1‑101 GACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGA > 2:14446300/1‑101 GACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGA > 2:19502927/1‑101 CCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAA > 2:19239195/1‑101 CCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAA > 1:10454673/1‑101 ATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACC > 2:16285062/1‑101 ATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACC < 2:8069954/101‑1 TCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCC > 2:17651696/1‑101 AGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCCAG < 2:4337683/101‑1 AGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCCAG > 2:7511072/1‑101 TCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCCAGCGG > 2:15397103/1‑101 CAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCCAGCGGCG > 2:8472032/1‑101 AGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCCAGCGGCGG < 2:1337741/101‑1 GACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCCAGCGGCGGA > 1:7874555/1‑101 ACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCCAGCGGCGGAG > 1:18694307/1‑101 CCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCCAGCGGCGGAGA > 1:8603514/1‑101 CCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGTCAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCCAGCGGCGGAGA < 1:2293018/101‑1 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TTGTTAACATGGTCGTTCGGGTTCAGGTACTGATATTCACCTTTTTGGTGACCCATCAGTTCCAGACCGATATTGGCCAGCACTTCGTTGGTGTTCATGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4367909‑4368008‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGGCTTTAAGAATTTCGTGCTGATGCAGCAAAAAATGGCGGCGGGTGAAAACCCAGCGGCGGAGATGATTAAAAGTGTTTCGCTGATCATTGCTGGTT > NC_000913/4368811‑4368910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |