Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 3,939,153 | IS2 (+) +5 bp | coding (927‑931/993 nt) | rbsR → | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 921 (1.040) | 186/200 | 0.0 | 99.9% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | 3939153 = | 1 (0.000) | coding (927/993 nt) | rbsR | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR | |||||
* | ? | NC_000913 | = 3939157 | 1 (0.000) | 876 (0.990) | 189/200 | 0.0 | 99.9% | coding (931/993 nt) | rbsR | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
Only 100 of 940 total aligned reads displayed.
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAA > NC_000913/3187328‑3187526 | tAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGt < 1:9851924/101‑1 (MQ=11) gTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTa > 2:17204210/1‑101 (MQ=32) gcgcTGGGGTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGTAATATAGGGGCAAATCCAGTTatc > 2:2997944/1‑101 (MQ=255) gcTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTatcat < 1:10386267/101‑1 (MQ=38) gcTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTatcat < 1:16265765/101‑1 (MQ=38) tGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTAtcatca < 2:6327843/101‑1 (MQ=40) gggTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATcatcat < 2:3127012/101‑1 (MQ=40) ggTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCAtt > 1:2374774/1‑101 (MQ=255) ggTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCAtt < 2:1631825/101‑1 (MQ=255) gTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTg < 1:18921215/101‑1 (MQ=255) gTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTg > 1:1956843/1‑101 (MQ=255) aTCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGtt > 2:3457029/1‑101 (MQ=255) aTCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGtt < 1:9017506/101‑1 (MQ=255) cgctcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTtgt > 2:6714744/1‑101 (MQ=255) cgctcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTtgt > 1:18161965/1‑101 (MQ=255) gctcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTtgtg > 1:14117333/1‑101 (MQ=255) gctcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTtgtg > 1:494686/1‑101 (MQ=255) ctcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGc < 2:11888907/101‑1 (MQ=255) tcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCg < 2:19395847/101‑1 (MQ=255) tcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCg < 2:10134882/101‑1 (MQ=255) cgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGt < 2:19818066/101‑1 (MQ=255) ccACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCa > 1:594905/1‑101 (MQ=255) aCGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGc > 2:12607816/1‑101 (MQ=255) aCGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGc > 2:9626877/1‑101 (MQ=255) cGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCt < 1:8685954/101‑1 (MQ=255) ggAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTa > 2:13895517/1‑101 (MQ=255) gAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTAt < 2:2192589/101‑1 (MQ=255) atatCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGc > 1:16884589/1‑101 (MQ=255) tatCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGcc > 1:17827765/1‑101 (MQ=255) tCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGt < 1:5182721/101‑1 (MQ=255) ggCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAAt < 2:11465547/101‑1 (MQ=255) ggCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAAt > 2:1533919/1‑101 (MQ=255) ggCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAAt < 1:13953027/101‑1 (MQ=255) cAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTc > 1:19967825/1‑101 (MQ=255) cAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTc < 1:16549849/101‑1 (MQ=255) aGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTca > 1:13191453/1‑101 (MQ=255) aGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTca > 2:6938234/1‑101 (MQ=255) aGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTca < 1:13612302/101‑1 (MQ=255) gCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaa < 1:4099144/101‑1 (MQ=255) gCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaa > 1:15262317/1‑101 (MQ=255) gCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaa > 1:2028713/1‑101 (MQ=255) cGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaac > 1:9522104/1‑101 (MQ=255) cGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaac < 1:19091022/101‑1 (MQ=255) gggCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaaca < 2:19687542/101‑1 (MQ=255) gggCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaaca < 1:11820444/101‑1 (MQ=255) gggCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTaaaca > 2:16647724/1‑101 (MQ=255) ggCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaacaa > 2:10694510/1‑101 (MQ=255) gCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACaaa < 1:7658849/101‑1 (MQ=255) 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ataGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCt > 1:12906171/1‑101 (MQ=255) ataGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCt > 2:18330077/1‑101 (MQ=255) ataGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCt < 2:1748001/101‑1 (MQ=255) taGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCtt < 2:18051941/101‑1 (MQ=255) taGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCtt < 1:17385885/101‑1 (MQ=255) ggggCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTc > 2:2045892/1‑101 (MQ=255) ggggCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTc > 2:5811378/1‑101 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |