Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 2,977,410 G→A G271D (GGC→GAC)  galR → DNA‑binding transcriptional dual regulator GalR

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009132,977,4100GA99.8% 3712.8 / ‑4.9 908G271D (GGC→GAC) galRDNA‑binding transcriptional dual regulator GalR
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (1/1);  new base A (495/411);  total (496/412)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01

Only 100 of 908 total aligned reads displayed.

CACTGCGGTAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGCCGAACTGGCT  >  NC_000913/2977312‑2977507
                                                                                                  |                                                                                                 
cACTGCGGTAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACt                                                                                                 >  2:484982/1‑101 (MQ=255)
 aCTGCGGTAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACtt                                                                                                <  2:7271684/101‑1 (MQ=255)
     cGGTAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTtgat                                                                                            <  1:14501412/101‑1 (MQ=255)
      ggTAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTtgatg                                                                                           >  2:16142308/1‑101 (MQ=255)
      ggTAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTtgatg                                                                                           >  2:20103803/1‑101 (MQ=255)
        tAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTgatgat                                                                                         <  1:1944470/101‑1 (MQ=255)
          gCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGAtgt                                                                                       >  1:7305229/1‑101 (MQ=255)
          gCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGAtgt                                                                                       <  2:19654440/101‑1 (MQ=255)
          gCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGAtgt                                                                                       >  2:14321729/1‑101 (MQ=255)
          gCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGAtgt                                                                                       <  2:10855502/101‑1 (MQ=255)
           ccTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGAtgtg                                                                                      <  1:16470462/101‑1 (MQ=255)
            cTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGc                                                                                     >  1:10240659/1‑101 (MQ=255)
            cTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGc                                                                                     <  2:4626927/101‑1 (MQ=255)
              gTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTg                                                                                   >  2:18084358/1‑101 (MQ=255)
               ttATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTgg                                                                                  <  2:11126151/101‑1 (MQ=255)
                tataACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGgt                                                                                 >  2:6266681/1‑101 (MQ=255)
                tataACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGgt                                                                                 >  2:17304804/1‑101 (MQ=255)
                 ataACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGgtg                                                                                <  1:20343886/101‑1 (MQ=255)
                  taACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGgtgt                                                                               >  2:1042885/1‑101 (MQ=255)
                  taACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGgtgt                                                                               >  1:18354644/1‑101 (MQ=255)
                  taACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGgtgt                                                                               >  1:19075/1‑101 (MQ=255)
                   aaCGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTc                                                                              >  1:1242005/1‑101 (MQ=255)
                    aCGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCa                                                                             <  1:14100184/101‑1 (MQ=255)
                    aCGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCa                                                                             >  1:4665786/1‑101 (MQ=255)
                    aCGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCa                                                                             >  2:6484797/1‑101 (MQ=255)
                     cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCAc                                                                            >  1:17081284/1‑101 (MQ=255)
                     cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCAc                                                                            >  1:15816722/1‑101 (MQ=255)
                      gATTCNNTGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACg                                                                           <  1:13095672/101‑1 (MQ=255)
                      gATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACg                                                                           <  2:17561076/101‑1 (MQ=255)
                        ttCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCt                                                                         >  2:6826874/1‑101 (MQ=255)
                         tCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGAAGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTa                                                                        >  1:3421709/1‑101 (MQ=255)
                          cAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTAt                                                                       <  1:10739857/101‑1 (MQ=255)
                           aaTGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTAtg                                                                      >  2:2248580/1‑101 (MQ=255)
                            aTGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTAtgt                                                                     >  2:14187450/1‑101 (MQ=255)
                              ggcggcGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGc                                                                   >  1:9742703/1‑101 (MQ=255)
                                cggcggGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGt                                                                 <  1:6584181/101‑1 (MQ=255)
                                 ggcggGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTc                                                                >  2:1497324/1‑101 (MQ=255)
                                 ggcggGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTc                                                                >  2:13775867/1‑101 (MQ=255)
                                 ggcggGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTc                                                                <  2:12234630/101‑1 (MQ=255)
                                 ggcggGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTc                                                                >  2:20518176/1‑101 (MQ=255)
                                  gcggGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTcc                                                               <  2:9432927/101‑1 (MQ=255)
                                   cggGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCcg                                                              <  2:19246757/101‑1 (MQ=255)
                                    gggTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCcgc                                                             <  2:8628880/101‑1 (MQ=255)
                                    gggTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCcgc                                                             >  1:12200057/1‑101 (MQ=255)
                                     ggTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCcgcg                                                            <  2:13377133/101‑1 (MQ=255)
                                        gCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCt                                                         <  2:10250169/101‑1 (MQ=255)
                                         cGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTg                                                        <  1:4101002/101‑1 (MQ=255)
                                          gATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGa                                                       <  2:11634095/101‑1 (MQ=255)
                                            tGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGacc                                                     >  2:7687207/1‑101 (MQ=255)
                                              ggCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGaccac                                                   <  1:10000303/101‑1 (MQ=255)
                                              ggCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGaccac                                                   <  2:5287355/101‑1 (MQ=255)
                                               gCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGaccacc                                                  <  1:4446468/101‑1 (MQ=255)
                                               gCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGaccacc                                                  >  1:1144126/1‑101 (MQ=255)
                                                 gTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGt                                                <  2:15215156/101‑1 (MQ=255)
                                                 gTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGt                                                >  1:16176109/1‑101 (MQ=255)
                                                 gTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGt                                                >  1:11234963/1‑101 (MQ=255)
                                                 gTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGt                                                <  1:15033706/101‑1 (MQ=255)
                                                  ttCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTg                                               >  2:15721320/1‑101 (MQ=255)
                                                  ttCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTg                                               <  2:4366172/101‑1 (MQ=255)
                                                   tctcAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGc                                              <  1:1759189/101‑1 (MQ=255)
                                                   tctcAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGc                                              >  1:1545808/1‑101 (MQ=255)
                                                   tctcAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGc                                              >  1:9447596/1‑101 (MQ=255)
                                                     tcAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGt                                            >  2:11907988/1‑101 (MQ=255)
                                                      cAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGtt                                           <  2:3216599/101‑1 (MQ=255)
                                                      cAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGtt                                           >  2:16683723/1‑101 (MQ=255)
                                                      cAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGtt                                           <  2:1860358/101‑1 (MQ=255)
                                                        aTGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTAc                                         >  1:2909955/1‑101 (MQ=255)
                                                        aTGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTAc                                         >  1:8825973/1‑101 (MQ=255)
                                                          gATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTAccc                                       <  2:2552003/101‑1 (MQ=255)
                                                          gATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTAccc                                       <  1:6145406/101‑1 (MQ=255)
                                                          gATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTAccc                                       >  1:5723263/1‑101 (MQ=255)
                                                           aTAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCa                                      >  1:17966271/1‑101 (MQ=255)
                                                            tAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCaa                                     <  2:6983673/101‑1 (MQ=255)
                                                             aaTGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAAt                                    <  2:14706312/101‑1 (MQ=255)
                                                             aaTGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAAt                                    >  1:2438112/1‑101 (MQ=255)
                                                              aTGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATc                                   <  2:9062064/101‑1 (MQ=255)
                                                                ggTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGt                                 >  1:13539266/1‑101 (MQ=255)
                                                                  tATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGa                               >  1:8110203/1‑101 (MQ=255)
                                                                  tATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGa                               >  2:5789185/1‑101 (MQ=255)
                                                                     tGATGTACCGGGTGAGCTTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGa                            <  2:19821768/101‑1 (MQ=255)
                                                                     tGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGa                            <  1:16774289/101‑1 (MQ=255)
                                                                     tGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGa                            >  1:3888178/1‑101 (MQ=255)
                                                                      gATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGAt                           >  1:20596012/1‑101 (MQ=255)
                                                                         gTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGc                        <  2:16905200/101‑1 (MQ=255)
                                                                            ccGGGTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGAc                     <  1:14818873/101‑1 (MQ=255)
                                                                              gggTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGAccc                   <  2:18485699/101‑1 (MQ=255)
                                                                                gTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAg                 <  1:9073448/101‑1 (MQ=255)
                                                                                gTGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAg                 >  1:19962678/1‑101 (MQ=255)
                                                                                 tGAGATTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAgg                <  1:11898124/101‑1 (MQ=255)
                                                                                   agaTTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCt              <  1:7618715/101‑1 (MQ=255)
                                                                                     aTTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGc            <  2:13038533/101‑1 (MQ=255)
                                                                                     aTTTCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGc            <  1:8579953/101‑1 (MQ=255)
                                                                                      tttCGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGcc           <  1:7906551/101‑1 (MQ=255)
                                                                                         cGTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGCCGaa        >  2:805075/1‑101 (MQ=255)
                                                                                          gTTAATTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGCCGAAc       >  1:18787802/1‑101 (MQ=255)
                                                                                             aaTTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGCCGAACTgg    >  2:12580419/1‑101 (MQ=255)
                                                                                             aaTTGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGCCGAACTgg    <  1:12694231/101‑1 (MQ=255)
                                                                                               ttGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGCCGAACTGGCt  <  2:3891456/101‑1 (MQ=255)
                                                                                               ttGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGCCGAACTGGCt  <  1:5245801/101‑1 (MQ=255)
                                                                                               ttGACTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGCCGAACTGGCt  >  2:2782809/1‑101 (MQ=255)
                                                                                                  |                                                                                                 
CACTGCGGTAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTTGATGATGTGCTGGTGTCACGCTATGTGCGTCCGCGCCTGACCACCGTGCGTTACCCAATCGTGACGATGGCGACCCAGGCTGCCGAACTGGCT  >  NC_000913/2977312‑2977507

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑