| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM406671 | 977,528 | Δ1 bp | coding (1177/1197 nt) | lplA → | sugar ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM406671 | 977,526 | 0 | C | . | 98.6% | 4429.7 / 44.5 | 947 | coding (1175/1197 nt) | lplA | sugar ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (8/5); new base . (501/431); total (510/437) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 972 total aligned reads displayed.
CCTGCAGGGGAAAATGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAACCCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTGGTTTCCGTAATGGTGTCT > AM406671/977378‑977670 | gCAGGGGAAAATGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAAcctt > 1:9822437/1‑147 (MQ=255) cAGGGGAAAATGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAACCttt > 1:1477705/1‑149 (MQ=255) gggAAAATGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTgcg < 2:4275797/149‑1 (MQ=255) aaaaTGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTgcgcgc > 2:6553112/1‑149 (MQ=255) aaaaTGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTgcgcgc < 1:9171108/149‑1 (MQ=255) aaaTGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCt < 2:5546735/149‑1 (MQ=255) aaTGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGATAACTAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCATTTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CGTTTGCGCGCTg > 2:2306551/1‑149 (MQ=255) aTGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACGAA‑CCTTTGCGCGCTgg > 1:7027856/1‑149 (MQ=255) aTGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTgg > 1:7175795/1‑149 (MQ=255) tGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTggg > 2:2497325/1‑149 (MQ=255) aTGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGa > 1:303508/1‑149 (MQ=255) aTGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGa < 1:3558775/149‑1 (MQ=255) tGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGaa < 1:3431155/149‑1 (MQ=255) tGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGaa < 1:410234/149‑1 (MQ=255) cAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTAc > 2:5630371/1‑149 (MQ=255) cAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTAc < 1:3266766/149‑1 (MQ=255) aaGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGNATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACa > 1:5786530/1‑149 (MQ=255) aGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACaa < 1:8289011/149‑1 (MQ=255) gATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAAc > 2:8050783/1‑149 (MQ=255) gATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAAc > 1:4756349/1‑149 (MQ=255) ccGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTtata < 1:2314711/149‑1 (MQ=255) ccGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTtata > 1:171301/1‑149 (MQ=255) ccGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTtata < 2:8595936/149‑1 (MQ=255) gATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTa > 2:104210/1‑149 (MQ=255) gATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTa > 1:3153314/1‑149 (MQ=255) aTTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTaa > 2:5433693/1‑149 (MQ=255) gCAGCCCTGGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATAAAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATc < 2:10269180/149‑1 (MQ=255) gCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTgg > 1:10019519/1‑149 (MQ=255) gCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTgg < 1:5438173/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGga > 1:9495825/1‑149 (MQ=255) cGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTACATTGAACAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAACTCATTGCCTGGTTACTTTATTCACACTCTCGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTCCAACTTATACAAAATCtacag > 2:9332117/1‑145 (MQ=255) cGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGgag > 1:3857106/1‑149 (MQ=255) tGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGaca < 1:7802493/149‑1 (MQ=255) gCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGacac < 1:789650/149‑1 (MQ=255) tGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGacactt < 1:2500388/149‑1 (MQ=255) ggTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGacactta < 2:6088758/149‑1 (MQ=255) gTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGacacttac > 1:3940258/1‑149 (MQ=255) tATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGacacttaca < 2:9867801/149‑1 (MQ=255) tATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGacacttaca < 1:101960/149‑1 (MQ=255) tgatgTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGacacttacact > 2:4424526/1‑149 (MQ=255) gatgTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGacacttacactt < 2:9519597/149‑1 (MQ=255) tgTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGATGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTg > 2:6850608/1‑149 (MQ=255) ttATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGc < 1:7670645/149‑1 (MQ=255) tATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCa > 2:3050878/1‑149 (MQ=255) tATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCa > 1:4229364/1‑149 (MQ=255) tcttctAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCaaa > 2:8797195/1‑149 (MQ=255) cttctAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCaaaa < 2:2653167/149‑1 (MQ=255) ctAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGAt > 2:7758883/1‑149 (MQ=255) aaaTTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGt < 1:2819889/149‑1 (MQ=255) aaaTTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGt < 1:9297194/149‑1 (MQ=255) aaaTTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGt < 2:6733258/149‑1 (MQ=255) aTTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTa > 1:9683601/1‑149 (MQ=255) aTTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTa < 1:5559611/149‑1 (MQ=255) ttGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTaa > 1:5137138/1‑149 (MQ=255) gAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATa > 1:600404/1‑149 (MQ=255) aaaaaTAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATAc > 2:8960370/1‑149 (MQ=255) aaaaTAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATAcc < 1:900407/149‑1 (MQ=255) aaaTAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCt > 1:6656090/1‑149 (MQ=255) aaTAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATATATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGAGAGTTGAAAGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTAAAAAAAAAAAAAAAGATGTTAATACCtt < 2:1977878/149‑1 (MQ=255) aTAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTa > 1:529421/1‑149 (MQ=255) aGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGTCTCTGGAGAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACATTAgg > 2:7130701/1‑149 (MQ=255) aGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAgg > 2:5837519/1‑149 (MQ=255) tGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCt < 2:83253/149‑1 (MQ=255) aCCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTg > 2:9188424/1‑149 (MQ=255) aCCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTg < 1:6875739/149‑1 (MQ=255) ccATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGa > 1:6451816/1‑149 (MQ=255) ccATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGa < 1:10389019/149‑1 (MQ=255) aTTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAAc > 2:1783605/1‑149 (MQ=255) tttCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAAcc > 2:1320223/1‑149 (MQ=255) tCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCa > 1:6223082/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCaa > 2:3435837/1‑149 (MQ=255) tGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTg > 2:6328215/1‑149 (MQ=255) gCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTgg > 2:7645847/1‑149 (MQ=255) ccACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGt < 2:2732337/149‑1 (MQ=255) ccACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGt > 2:1649801/1‑149 (MQ=255) cACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTa < 1:5033265/149‑1 (MQ=255) cccTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACTCTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACa < 2:5351985/149‑1 (MQ=255) cccTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACa > 1:747487/1‑149 (MQ=255) ccTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACaa > 1:1243555/1‑149 (MQ=255) ccTCCAATTTATTGACTGGTTACGTTATTCGGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACGGCGGATACTAAATCGGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACaa < 2:4627371/149‑1 (MQ=255) aaTTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGAc < 1:3751386/149‑1 (MQ=255) aaTTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGAc < 1:4504862/149‑1 (MQ=255) aTTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGAcc > 2:8203419/1‑149 (MQ=255) tttATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCt > 1:8042925/1‑149 (MQ=255) tATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGc > 1:8869066/1‑149 (MQ=255) ttGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCaa > 1:9990676/1‑149 (MQ=255) tGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGa > 1:2161369/1‑149 (MQ=255) tGGTAACTTTATTCAGACCCTGGTGAAA‑GCTATGAGCGCAAGAAAGTTAAAGGTATAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTATGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTTCAAAAAGa > 2:3985856/1‑149 (MQ=255) tACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGAtttt < 1:1198771/149‑1 (MQ=255) tACTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTAGCGCGCTAAAGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTATGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTAATAAAAAAGAACTGCAAAAAGAtttt < 2:3756256/149‑1 (MQ=255) aCTTTATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTg > 2:7223632/1‑149 (MQ=255) tttATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGCTACAACTGATACTAAATCGGGAGACACTTGCACTTTGGCAAGAGATGTTAATACCTTAGGCTAGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTgct > 2:7571372/1‑147 (MQ=255) tATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTGGttt > 2:4860281/1‑149 (MQ=255) tATTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTAAAACTTATAATAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTGGttt > 2:3200644/1‑149 (MQ=255) aTTCAGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTGGTTTc > 2:5065385/1‑149 (MQ=255) aGACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTGGTTTCCGTa < 1:1962475/149‑1 (MQ=255) gACTCTGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTGGTTTCCGTaa < 1:8137449/149‑1 (MQ=255) ctGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTGGTTTCCGTAATGgt < 1:2656696/149‑1 (MQ=255) tGGACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTGGTTTCCGTAATGgtg < 1:8579077/149‑1 (MQ=255) ggACAAA‑CCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTGGTTTCCGTAATGgtgt > 2:5141068/1‑149 (MQ=255) | CCTGCAGGGGAAAATGGTTTGATGGTTCAAGATAACCGGATTGCAGCCGTTGCTGGTATGATGTTATCTTCTAAATTGAAAAATAGTGACCATTTCCTTGCCACCCTCCAATTTATTGACTGGTTACTTTATTCAGACTCTGGACAAACCCTTTGCGCGCTGGGGAGTTGAAGGTACAACTTATACTAAATCTGGAGACACTTACACTTTGGCAAAAGATGTTAATACCTTAGGCTTGAACCCAAGTGGTACAAAAGACCTGCAAAAAGATTTTGGTTTCCGTAATGGTGTCT > AM406671/977378‑977670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |