| Predicted mutation | ||||||
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| RA | AM406671 | 636,592 | (A)7→6 | coding (297/1164 nt) | llmg_0642 ← | putative membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | AM406671 | 636,586 | 0 | A | . | 96.3% | 5086.4 / 171.4 | 1163 | coding (303/1164 nt) | llmg_0642 | putative membrane protein |
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Only 100 of 1231 total aligned reads displayed.
AAGTTTTACCGATAATATACCAGAAAATAATCTGAACGGCAAATGCAATACTGGTGTAGGCTACTGATAATGTTAAGCTTTCTCTAAAGATTTTAAATTTAGATTTTGATAAATCACAGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACCAAAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATAAAAGACTAGGGACGATAAAAT > AM406671/636438‑636731 | aaGTTTTACCGATAATATACCAGAAAATAATCTGAACGGCAAATGCAATACTGGTGTAGGCTACTGATAATGTTAAGCTTTCTCTAAAGATTTTAAATTTAGATTTTGATAAATCACAGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACCa > 2:4121148/1‑149 (MQ=255)aaGTTTTACCGATAATATACCAGAAAATAATCTGAACGGCAAATGCAATACTGGTGTAGGCTACTGATAATGTTAAGCTTTCTCTAAAGATTTTAAATTTAGATTTTGATAAATCACAGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACCa > 1:9128586/1‑149 (MQ=255) aGTTTTACCGATAATATACCAGAAAATAATCTGAACGGCAAATGCAATACTGGTGTAGGCTACTGATAATGTTAAGCTTTCTCTAAAGATTTTAAATTTAGATTTTGATAAATCACAGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACCaa > 1:4260229/1‑149 (MQ=255) 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ttGATAAATCACAGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCa > 2:970472/1‑149 (MQ=255) aaTCACAGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCaa > 2:481716/1‑149 (MQ=255) tCACAGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACt < 1:481589/149‑1 (MQ=255) cacaGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACGTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTa > 2:7043563/1‑149 (MQ=255) caGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATg > 1:94848/1‑149 (MQ=255) caGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGATACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATg > 2:4586419/1‑149 (MQ=255) aGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGc < 2:10419645/149‑1 (MQ=255) cTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCg < 1:9804070/149‑1 (MQ=255) cTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACATGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGCGAATGTTTAGCAAATAAAAACATAACCATGGCAACTATGCCg > 2:1852798/1‑149 (MQ=255) tcaatAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGGGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATa < 2:1524879/145‑1 (MQ=255) cTTTAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTTACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATaa > 2:13424/1‑149 (MQ=255) cTTTAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATaa < 1:2924095/149‑1 (MQ=255) ttAAGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAAGCATGGCAACTATGCCGGATaaaa > 1:5940315/1‑149 (MQ=255) aaGTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATAAAAGa > 1:8486010/1‑149 (MQ=255) gTAAATCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATAAAAGACt < 2:6214291/149‑1 (MQ=255) aaaTCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATAAAAGACTAg < 2:7460185/149‑1 (MQ=255) tCCATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTAGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATAAAAGACTAGGGa > 2:8549689/1‑149 (MQ=255) cATAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATAAAAGACTAGGGACg < 1:1357520/149‑1 (MQ=255) aTAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATAAAAGACTAGGGACGa > 2:3655160/1‑149 (MQ=255) tAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATAAAAGACTAGGGACGAt < 1:5098516/149‑1 (MQ=255) tAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATAAAAGACTAGGGACGAt > 1:97062/1‑149 (MQ=255) tAAGAAACC‑AAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATAAAAGACTAGGGACGAt < 2:351506/149‑1 (MQ=255) | AAGTTTTACCGATAATATACCAGAAAATAATCTGAACGGCAAATGCAATACTGGTGTAGGCTACTGATAATGTTAAGCTTTCTCTAAAGATTTTAAATTTAGATTTTGATAAATCACAGCTTTTCTTTAAGTAAATCCATAAGAAACCAAAAAAACCTAATAATGTCGAGAGGATTATACTTAAACTTGCTACTGACAGGTGCCGACTTCCAGTAAATGCAATTTGAGAATGTTTAGCAAATAAAAAAATAACCATGGCAACTATGCCGGATAAAAGACTAGGGACGATAAAAT > AM406671/636438‑636731 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |