New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AM406671 | 1583930 = | NA (NA) | 1157 (0.970) | 261/294 | 0.4 | NA | intergenic (‑98/‑80) | glf2/tnp712 | pseudogene/transposase for insertion sequence element IS712G |
? | AM406671 | 1632643 = | NA (NA) | coding (132/261 nt) | llmg_1655 | conserved hypothetical protein |
Only 100 of 1256 total aligned reads displayed.
ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/1584078‑1583930 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGTC > AM406671/1632643‑1632790 ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA < 1:4381013/149‑1 ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA > 2:7607226/1‑149 ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA < 1:3942672/149‑1 ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA > 2:5160066/1‑149 TCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAG < 2:10175430/149‑1 CAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGT < 1:3651342/149‑1 CGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGA < 2:529676/149‑1 AAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCGCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGG > 1:6430099/1‑149 AAAGTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCCTAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATGTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGG > 2:595571/1‑149 ATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTC > 1:6070683/1‑149 TAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTA > 2:8888177/1‑149 GTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCC < 2:662424/149‑1 TTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCAT < 1:7983637/149‑1 TTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCAT > 2:4991567/1‑149 TTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTAT < 1:8215638/149‑1 TTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTAT > 2:1928482/1‑149 TCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGTAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATTGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTG < 2:9653576/149‑1 TCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTt > 2:3587501/1‑148 TCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTG < 1:7637153/149‑1 CATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGT > 1:4993458/1‑149 TAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTG > 1:7461859/1‑149 AAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGC > 2:7729392/1‑149 TGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGG < 2:8742265/149‑1 TCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCC < 2:1188346/149‑1 CGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCA < 1:8676987/149‑1 GTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACG > 1:9173964/1‑149 TTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGT < 2:7433021/149‑1 TATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTC > 1:9951804/1‑149 TACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCAT > 1:8360494/1‑149 TACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCAT < 1:2212050/149‑1 ACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATA > 1:7787690/1‑149 TTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGAAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATT > 2:5760809/1‑149 TTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTC < 2:9220287/149‑1 TCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCT > 1:2383675/1‑149 GTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAG < 2:380378/149‑1 TCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGC > 1:524618/1‑149 CTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCT > 1:2556095/1‑149 CTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCT < 2:701869/149‑1 CTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCT < 1:1596919/149‑1 TTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGG < 1:8459020/149‑1 TTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGG > 1:4726968/1‑149 CTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTG < 1:7308232/149‑1 ATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACG > 1:6550708/1‑149 AAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGA < 1:10310388/149‑1 AGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGAT > 1:2883515/1‑149 GGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATT > 1:4283772/1‑149 GGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATT < 2:4529234/149‑1 GGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATT > 2:2339939/1‑149 GGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATT > 2:1453167/1‑149 AAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACC < 1:3342669/149‑1 AAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACC > 2:3139942/1‑149 AGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACCGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCA > 1:2993181/1‑149 AGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCA < 1:1399840/149‑1 CTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAA > 2:8047976/1‑149 ttcaaatTTTTAGGGTTAACGTGCGTTGTCAAGGGCCCGTTTCCTACTTTTTAGGATGGGCCTTTACAGTAGAGGTGTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATG < 2:7849004/142‑1 ATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATG > 1:1686061/1‑149 ACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATA < 2:1615675/149‑1 ACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATA < 1:2749141/149‑1 AATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGA < 2:3899665/149‑1 TTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAG > 1:10017064/1‑149 TAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCG > 2:3356575/1‑149 AAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGA > 1:6725137/1‑149 AGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATA > 1:190872/1‑149 AGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATGCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATA < 1:9599036/149‑1 ACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGT < 1:5537903/149‑1 ACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGT > 1:4145490/1‑149 CCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTT > 1:9359906/1‑149 TACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTC > 2:6280589/1‑149 ACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCT < 2:1036706/149‑1 ACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCT > 1:6893560/1‑149 CATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTT < 2:8567605/149‑1 ATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACCGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACATCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGGTTGGCCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTGTCTTT > 1:9796614/1‑149 TCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAAT > 2:8211522/1‑149 CAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATT > 2:9495351/1‑149 AATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTC > 1:6209442/1‑149 ATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCT > 2:9785133/1‑149 TGGCCCGTTACCTACATTTTAACATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACTTCATATTATTTAGACAGCTGAATGACTGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTT < 2:9379029/149‑1 CGTTTCCTACATTTTATCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAG < 1:7048860/149‑1 TTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAG > 1:9019158/1‑149 CTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGT > 2:2631805/1‑149 TACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTT > 2:7212208/1‑149 ACATTTTAGCTTGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATGTAGAGATGGTTGCATGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTCACCAGAATGATAGAAGGCGAGAAGCGTCTCTTTAAATGCGTTTGCGCAGCGTTT < 2:904662/149‑1 ACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTT > 1:8828116/1‑149 ACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTT < 2:4192247/149‑1 TTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTNTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGGTTTTG > 1:5803461/1‑149 AGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATG < 2:1826935/149‑1 GCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGT > 1:10443205/1‑149 GCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGT < 2:1095361/149‑1 GCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGT < 2:8380883/149‑1 atcGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGTGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTGGCATGTTT < 2:6859796/146‑1 ATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTT < 2:2961600/149‑1 ATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTT < 2:5547420/149‑1 ATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTT < 2:4773686/149‑1 CCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATACATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTC > 2:6485060/1‑149 CCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTC < 1:116364/149‑1 TTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTT < 2:4314105/149‑1 TACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTATATTTTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTT > 2:207967/1‑149 TACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTT < 1:204345/149‑1 CAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGT < 1:3211656/149‑1 AGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGTt > 2:609286/1‑148 ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/1584078‑1583930 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGTC > AM406671/1632643‑1632790 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |