| Predicted mutation | ||||||
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| RA | AM406671 | 1,891,450 | C→A | W87L (TGG→TTG) | llmg_1911 ← | conserved hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | AM406671 | 1,891,450 | 0 | C | A | 99.8% | 4346.5 / NA | 1091 | W87L (TGG→TTG) | llmg_1911 | conserved hypothetical protein |
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Only 100 of 1103 total aligned reads displayed.
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ttCCTATTGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAg > 2:10074204/1‑149 (MQ=255) ccTATTGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGa < 1:9385466/149‑1 (MQ=255) cTATTGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGAt < 1:828507/149‑1 (MQ=255) tATTGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATa < 1:8095852/149‑1 (MQ=255) tATTGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATa < 1:215489/149‑1 (MQ=255) tATTGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATa > 2:9891838/1‑149 (MQ=255) tGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAgc < 1:9877667/149‑1 (MQ=255) tGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAgc > 1:4141327/1‑149 (MQ=255) tCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAgcgc < 1:5148784/149‑1 (MQ=255) tGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAGCGCCCCa < 1:1224086/149‑1 (MQ=255) ggTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAGCGCCCCaa < 1:9267987/149‑1 (MQ=255) tATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAGCGCCACAATc > 1:7493368/1‑149 (MQ=255) | ACAGATAAACCCAGTCAATTAGTAAAAATGCCAAAACAACAATAGGCAATAAAAGATTACCAATGGATTTTGACTCTCTTCGCCACATTTTAATCGTTAAAACAACAATACTAATGGGAACAACAATTCCTATTGTCATTGGTATCCATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAGCGCCCCAATCG > AM406671/1891304‑1891595 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |