| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 1583930 = | NA (NA) | 1027 (0.930) | 254/294 | 0.6 | NA | intergenic (‑98/‑80) | glf2/tnp712 | pseudogene/transposase for insertion sequence element IS712G |
| ? | AM406671 | 1632643 = | NA (NA) | coding (132/261 nt) | llmg_1655 | conserved hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1137 total aligned reads displayed.
ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/1584078‑1583930‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGTC > AM406671/1632643‑1632790 ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA > 2:5765033/1‑149ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA < 1:9179094/149‑1ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA > 2:3778473/1‑149ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA > 1:2941533/1‑149ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA > 1:7350835/1‑149ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA < 1:240635/149‑1 TCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAG > 2:8848144/1‑149 TCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCACTTTACAG > 2:298080/1‑149 AGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTA < 1:3049653/149‑1 AAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAACGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGG > 1:4954738/1‑149 AAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTATACAGTAGAGG > 1:2317883/1‑149 TAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTA < 1:5491147/149‑1 AGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTAT < 2:3254772/149‑1 AGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTAT > 2:6299739/1‑149 AGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTAT < 1:1446786/149‑1 AGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTAT < 1:7862569/149‑1 TTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCA < 1:1786061/149‑1 TTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCA > 1:6561652/1‑149 ATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTA < 1:9288936/149‑1 TTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTAT > 1:8326800/1‑149 CCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAA > 1:3435840/1‑149 CAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAA < 2:869914/149‑1 TAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTG < 1:3318060/149‑1 AAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGC > 2:8558561/1‑149 AGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTCTCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCc > 2:2818581/1‑148 AGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCA > 2:7821454/1‑149 TTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATT > 2:3916006/1‑138 TTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGT > 1:1018906/1‑149 TTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGT > 2:2360224/1‑149 TTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTACCAAAATTTTAAAGTTAACGTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCATTTACAGTAGGGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCAACGT > 2:6495938/1‑149 TATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCAGAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGATGTTTCCATTTATATATTGTTGCAGGGGCGACGTC > 2:5176559/1‑149 TACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCAT > 2:9006134/1‑149 TACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCAT > 1:4785925/1‑149 CTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATAT > 1:1345067/1‑149 TCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCT < 1:9437907/149‑1 TCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGACCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCT < 1:8856363/149‑1 TAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTT < 2:1318403/149‑1 TAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTT < 2:407737/149‑1 TAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTT > 1:4189254/1‑149 ATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGAC > 1:8006402/1‑149 TCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGC < 1:1995309/149‑1 CTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCT < 2:8306432/149‑1 TTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTG > 1:2811101/1‑149 TTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGG > 1:7137462/1‑149 TTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTNTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGG > 1:5295795/1‑149 TCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGA > 1:3640017/1‑149 ATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACG < 2:5983390/149‑1 AAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGA > 1:8622306/1‑149 AAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGA > 1:5992470/1‑149 AAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGA > 2:206844/1‑149 GAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTG > 1:751346/1‑149 GAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCACGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTG > 2:6092983/1‑149 AAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACC > 2:118704/1‑149 AGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCA < 1:5663764/149‑1 CTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAA < 1:2129658/149‑1 TATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAAT < 2:510088/149‑1 TCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGA < 1:8505142/149‑1 CACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGAT > 1:124351/1‑149 TTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAG > 2:334872/1‑149 AAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGA < 1:4465749/149‑1 AAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGAT < 2:1859985/149‑1 AACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGG < 1:3754316/149‑1 AACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGG < 1:4046490/149‑1 CTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATA > 2:2626597/1‑142 CATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTT > 2:7669788/1‑149 TCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAAT > 1:4346176/1‑149 ATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCT > 2:5351457/1‑149 ATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCT > 2:4506496/1‑149 TGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTT < 2:6882620/149‑1 GCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTT < 2:43875/149‑1 CCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTGAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTG < 2:755171/149‑1 CCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGA < 2:4908503/149‑1 GTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGT < 2:1730307/149‑1 GTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGT < 2:5545319/149‑1 GTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGT > 2:7314936/1‑149 TTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTA < 2:8055158/149‑1 CCTACATTTTAGCGTGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCG > 1:2605278/1‑149 CCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCG < 1:636595/149‑1 TACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTT > 2:6692296/1‑149 TACATTTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTT > 1:57911/1‑149 TTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGC < 1:3909473/149‑1 TTTAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGC < 2:9537996/149‑1 TAGCATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTCGCGTTTTTGCAT > 1:191386/1‑149 CATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTT < 2:3090808/149‑1 CATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTT > 1:8147396/1‑149 CATGGCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTT > 2:3639038/1‑149 GCCCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTG > 2:15452/1‑149 CCTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTC < 2:9152405/149‑1 CTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCC < 1:3156922/149‑1 CTTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCC > 2:1018294/1‑149 TTTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCT < 2:4784472/149‑1 TTACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGCCCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTT < 2:9397694/149‑1 ACAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTG > 2:7125713/1‑149 CAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGT < 1:7685111/149‑1 CAGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGT < 1:5146543/149‑1 AGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGTCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGTC < 1:6208067/149‑1 AGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGTC > 1:6884138/1‑149 AGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGTC > 1:907576/1‑149 AGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGTC < 1:1642864/149‑1 AGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGTC < 1:4648369/149‑1 ATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCATAAGGAAAAGCCTATCACAATTTTAAAGTTAACCTACATTTTCAATGGCCCGTTTCCTACATTTTAGCATGGCCCTTTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/1584078‑1583930‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGTAGAGGTCTATCCATTTATAAATTGTTGCAGGGGCCACGTCATATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGCATGTTTTTGTCCTTTGTC > AM406671/1632643‑1632790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |