| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 2481826 = | 1380 (1.240) | 21 (0.020) | 18/268 | 24.2 | 1.7% | coding (52/366 nt) | phnA | putative alkylphosphonate uptake protein |
| ? | AM406671 | = 2492410 | 1182 (1.180) | intergenic (+461/+99) | ps614/gapB | hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica/glyceraldehyde 3‑phosphate dehydrogenase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1324 total aligned reads displayed.
CGTTTTTGGTTACGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTCCATTTTTTCTCCTTTATAAAATAAAAAAACCAGCCCGAAGACTGGTTTTTATACCGTTAAAATCGGAAAATTATTTAGCGATTTTAGCGAAGTATGCAAGTGTACGAACAAGGTTTGAAG > AM406671/2492262‑2492558 | cGTTTTTGGTTACGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCaa > 2:1524868/1‑149 (MQ=255) tttttGGTTACGTTCGTATTTTTTTATGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTTTAATGGTTTACAGTGATTCAAtt > 2:447017/1‑149 (MQ=255) tttGGTTACGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTTCATAAAACGATTTGCATGCTCTCTGTTTCCCTCTATTGGTTTACAGGGATTCAATTGa > 2:7808307/1‑149 (MQ=255) tttGGTTACGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGa > 1:4525040/1‑149 (MQ=255) ttGGTTACGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAg > 2:2633247/1‑149 (MQ=255) tGGTTACGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGc > 1:2193739/1‑149 (MQ=255) ttACGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAAt < 2:5344754/149‑1 (MQ=255) tACGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATg < 1:1011592/149‑1 (MQ=255) tACGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATg > 1:1455507/1‑149 (MQ=255) tACGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATg > 1:4745462/1‑149 (MQ=255) aCGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGa < 1:3719584/149‑1 (MQ=255) cGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGaa > 1:8582835/1‑149 (MQ=255) cGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGaa < 2:7029458/149‑1 (MQ=255) cGTTCGTACTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGaa < 1:5560188/149‑1 (MQ=255) gTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAAt > 2:3515883/1‑149 (MQ=255) tCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGTATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCTCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATgtttat > 2:8304893/1‑144 (MQ=255) cGTATTTTTTTACGTTTTTTTTTACGTTTAAAAGCATGTATATTCTGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTTCCTCTTATTGTTTACATGTATTTAATTGATCAATGACTACa > 2:1166266/1‑149 (MQ=255) cGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACa < 1:1313044/149‑1 (MQ=255) 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tttttACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTgg < 1:7207716/149‑1 (MQ=255) ttACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGgtgt > 1:3951034/1‑149 (MQ=255) ttACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGgtgt > 2:3671180/1‑149 (MQ=255) tACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAAt < 2:3349104/132‑1 (MQ=255) tACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAAt > 1:3349104/1‑132 (MQ=255) cGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTTATAAGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACTATTTGTATGCCCTCTGTTTCCCTCTAAGGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGtctc < 1:2894667/149‑1 (MQ=38) cGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATg < 1:638906/131‑1 (MQ=255) gTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTcc < 1:3518796/149‑1 (MQ=255) ttttttACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTCCa > 1:8755372/1‑149 (MQ=255) tttttACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTCCAt > 2:4758574/1‑149 (MQ=255) tttttACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTCCAt < 2:2398156/149‑1 (MQ=255) ttttACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTCCAtt < 2:4128027/149‑1 (MQ=255) ttACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTCCAtttt < 1:8994401/149‑1 (MQ=255) tacGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTCCATTTTTtct > 1:9558083/1‑149 (MQ=255) cGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTCCATTTTTTCTcc < 1:115683/149‑1 (MQ=255) ttAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTCCATTTTTTCTCCttt < 1:7620439/149‑1 (MQ=255) 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aTTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTCCATTTTTTCTCCTTTATAAAATAAAAAAACCAGCCCGAAGACTGGTTTTTATACCGTTAAAATCGGAAAATTATTTAGCGATTTTAGCGAAGTATGCAAGTGTACGAACAAGGTTTGAAg < 2:6840121/149‑1 (MQ=255) | CGTTTTTGGTTACGTTCGTATTTTTTTACGTTTTTTACTACGTTTAAAAGCATGTATATTATGGTCTGATAGGTCATGTTTTTAGTGCATAATTGCATAAAACGATTTGCATGCCCTCTGTTTCCCTCTAATGGTTTACAGGGATTCAATTGAGCAATGAATACATTTTGGTGTCTCCATTTTTTCTCCTTTATAAAATAAAAAAACCAGCCCGAAGACTGGTTTTTATACCGTTAAAATCGGAAAATTATTTAGCGATTTTAGCGAAGTATGCAAGTGTACGAACAAGGTTTGAAG > AM406671/2492262‑2492558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |